RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548823.1

CTDSP2-204, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 1,368 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-204ENST00000548823 MAOBP27338 520 aa20.37■□□□□ 0.85
CTDSP2-204ENST00000548823 ARL4AP40617 200 aa20.37■□□□□ 0.85
CTDSP2-204ENST00000548823 MAGEA11P43364 429 aa20.37■□□□□ 0.85
CTDSP2-204ENST00000548823 GPS1Q13098 491 aa20.37■□□□□ 0.85
CTDSP2-204ENST00000548823 CBLBQ13191 982 aa20.37■□□□□ 0.85
CTDSP2-204ENST00000548823 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
CTDSP2-204ENST00000548823 TTMPQ5BVD1 217 aa20.37■□□□□ 0.85
CTDSP2-204ENST00000548823 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
CTDSP2-204ENST00000548823 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
CTDSP2-204ENST00000548823 GLIS1Q8NBF1 620 aa20.37■□□□□ 0.85
CTDSP2-204ENST00000548823 FAM76AQ8TAV0 307 aa20.37■□□□□ 0.85
CTDSP2-204ENST00000548823 ARL8AQ96BM9 186 aa20.37■□□□□ 0.85
CTDSP2-204ENST00000548823 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa20.37■□□□□ 0.85
CTDSP2-204ENST00000548823 CSPG4P5Q96PW8 444 aa20.37■□□□□ 0.85
CTDSP2-204ENST00000548823 RNF38Q9H0F5 515 aa20.37■□□□□ 0.85
CTDSP2-204ENST00000548823 FAM204AQ9H8W3 233 aa20.37■□□□□ 0.85
CTDSP2-204ENST00000548823 TBC1D14Q9P2M4 693 aa20.37■□□□□ 0.85
CTDSP2-204ENST00000548823 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
CTDSP2-204ENST00000548823 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa20.37■□□□□ 0.85
CTDSP2-204ENST00000548823 CPQQ9Y646 472 aa20.37■□□□□ 0.85
CTDSP2-204ENST00000548823 H3BRJ5 948 aa20.36■□□□□ 0.85
CTDSP2-204ENST00000548823 CER1O95813 267 aa20.36■□□□□ 0.85
CTDSP2-204ENST00000548823 ITPKBP27987 946 aa20.36■□□□□ 0.85
CTDSP2-204ENST00000548823 HCAR3P49019 387 aa20.36■□□□□ 0.85
CTDSP2-204ENST00000548823 VPS41P49754 854 aa20.36■□□□□ 0.85
CTDSP2-204ENST00000548823 GAD2Q05329 585 aa20.36■□□□□ 0.85
CTDSP2-204ENST00000548823 FAM131BQ86XD5 332 aa20.36■□□□□ 0.85
CTDSP2-204ENST00000548823 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa20.36■□□□□ 0.85
CTDSP2-204ENST00000548823 RHBDD1Q8TEB9 315 aa20.36■□□□□ 0.85
CTDSP2-204ENST00000548823 DNASE2BQ8WZ79 361 aa20.36■□□□□ 0.85
CTDSP2-204ENST00000548823 SPATA17Q96L03 361 aa20.36■□□□□ 0.85
CTDSP2-204ENST00000548823 C8orf48Q96LL4 319 aa20.36■□□□□ 0.85
CTDSP2-204ENST00000548823 CEP295NLQ96MC4 621 aa20.36■□□□□ 0.85
CTDSP2-204ENST00000548823 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
CTDSP2-204ENST00000548823 GAREM1Q9H706 876 aa20.36■□□□□ 0.85
CTDSP2-204ENST00000548823 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
CTDSP2-204ENST00000548823 IL21RQ9HBE5 538 aa20.36■□□□□ 0.85
CTDSP2-204ENST00000548823 CD248Q9HCU0 757 aa20.36■□□□□ 0.85
CTDSP2-204ENST00000548823 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
CTDSP2-204ENST00000548823 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa20.36■□□□□ 0.85
CTDSP2-204ENST00000548823 KNTC1P50748 2209 aa20.36■□□□□ 0.85
CTDSP2-204ENST00000548823 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
CTDSP2-204ENST00000548823 FLRT2O43155 660 aa20.35■□□□□ 0.85
CTDSP2-204ENST00000548823 OLFM2O95897 454 aa20.35■□□□□ 0.85
CTDSP2-204ENST00000548823 RPL22P35268 128 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
CTDSP2-204ENST00000548823 ADRA1BP35368 520 aa20.35■□□□□ 0.85
CTDSP2-204ENST00000548823 CHKAP35790 457 aa20.35■□□□□ 0.85
CTDSP2-204ENST00000548823 PPP3CCP48454 512 aa20.35■□□□□ 0.85
CTDSP2-204ENST00000548823 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
CTDSP2-204ENST00000548823 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
CTDSP2-204ENST00000548823 EFHC2Q5JST6 749 aa20.35■□□□□ 0.85
CTDSP2-204ENST00000548823 LY6G5CQ5SRR4 150 aa20.35■□□□□ 0.85
CTDSP2-204ENST00000548823 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
CTDSP2-204ENST00000548823 IL27RAQ6UWB1 636 aa20.35■□□□□ 0.85
CTDSP2-204ENST00000548823 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
CTDSP2-204ENST00000548823 UNC45BQ8IWX7 931 aa20.35■□□□□ 0.85
CTDSP2-204ENST00000548823 PPIL6Q8IXY8 311 aa20.35■□□□□ 0.85
CTDSP2-204ENST00000548823 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
CTDSP2-204ENST00000548823 USP29Q9HBJ7 922 aa20.35■□□□□ 0.85
CTDSP2-204ENST00000548823 SMPD4Q9NXE4 827 aa20.35■□□□□ 0.85
CTDSP2-204ENST00000548823 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
CTDSP2-204ENST00000548823 CFAP97Q9P2B7 532 aa20.35■□□□□ 0.85
CTDSP2-204ENST00000548823 DEC1Q9P2X7 70 aa20.35■□□□□ 0.85
CTDSP2-204ENST00000548823 HCN2Q9UL51 889 aa20.35■□□□□ 0.85
CTDSP2-204ENST00000548823 STARD13Q9Y3M8 1113 aa20.35■□□□□ 0.85
CTDSP2-204ENST00000548823 FAM149AA5PLN7 773 aa20.34■□□□□ 0.85
CTDSP2-204ENST00000548823 ZNF840PA6NDX5 716 aa20.34■□□□□ 0.85
CTDSP2-204ENST00000548823 CAPN8A6NHC0 703 aa20.34■□□□□ 0.85
CTDSP2-204ENST00000548823 A6NNZ2 444 aa20.34■□□□□ 0.85
CTDSP2-204ENST00000548823 HACD1B0YJ81 288 aa20.34■□□□□ 0.85
CTDSP2-204ENST00000548823 TRIM66O15016 1216 aa20.34■□□□□ 0.85
CTDSP2-204ENST00000548823 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP20.34■□□□□ 0.85
CTDSP2-204ENST00000548823 TTC4O95801 387 aa20.34■□□□□ 0.85
CTDSP2-204ENST00000548823 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa20.34■□□□□ 0.85
CTDSP2-204ENST00000548823 NCAM1P13591 858 aa20.34■□□□□ 0.85
CTDSP2-204ENST00000548823 WASP42768 502 aa20.34■□□□□ 0.85
CTDSP2-204ENST00000548823 CXCR3P49682 368 aa20.34■□□□□ 0.85
CTDSP2-204ENST00000548823 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
CTDSP2-204ENST00000548823 IFFO1Q0D2I5 559 aa20.34■□□□□ 0.85
CTDSP2-204ENST00000548823 SLC29A2Q14542 456 aa20.34■□□□□ 0.85
CTDSP2-204ENST00000548823 ARL13BQ3SXY8 428 aa20.34■□□□□ 0.85
CTDSP2-204ENST00000548823 TUBB8Q3ZCM7 444 aa20.34■□□□□ 0.85
CTDSP2-204ENST00000548823 BSPRYQ5W0U4 402 aa20.34■□□□□ 0.85
CTDSP2-204ENST00000548823 BTBD8Q5XKL5 378 aa20.34■□□□□ 0.85
CTDSP2-204ENST00000548823 SDE2Q6IQ49 451 aa20.34■□□□□ 0.85
CTDSP2-204ENST00000548823 NPNTQ6UXI9 565 aa20.34■□□□□ 0.85
CTDSP2-204ENST00000548823 PIGVQ9NUD9 493 aa20.34■□□□□ 0.85
CTDSP2-204ENST00000548823 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
CTDSP2-204ENST00000548823 RAD54BQ9Y620 910 aa20.34■□□□□ 0.85
CTDSP2-204ENST00000548823 GOLGA8CPA6NN73 597 aa20.34■□□□□ 0.85
CTDSP2-204ENST00000548823 H7C0C1 242 aa20.34■□□□□ 0.85
CTDSP2-204ENST00000548823 TULP3O75386 442 aa20.34■□□□□ 0.85
CTDSP2-204ENST00000548823 IFNB1P01574 187 aa20.34■□□□□ 0.85
CTDSP2-204ENST00000548823 IGLV3-25P01717 112 aa20.34■□□□□ 0.85
CTDSP2-204ENST00000548823 HLA-EP13747 358 aa20.34■□□□□ 0.85
CTDSP2-204ENST00000548823 ETS1P14921 441 aa20.34■□□□□ 0.85
CTDSP2-204ENST00000548823 ATP5OP48047 213 aa20.34■□□□□ 0.85
CTDSP2-204ENST00000548823 GDF10P55107 478 aa20.34■□□□□ 0.85
CTDSP2-204ENST00000548823 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
CTDSP2-204ENST00000548823 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms