RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548516.5

LETMD1-217, Transcript of LETM1 domain containing 1, humanhuman

TSL 5

Gene LETMD1, Length 850 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1-217ENST00000548516 EXTL1Q92935 676 aa9.51□□□□□ -0.89
LETMD1-217ENST00000548516 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
LETMD1-217ENST00000548516 SLC13A1Q9BZW2 595 aa9.51□□□□□ -0.89
LETMD1-217ENST00000548516 PLCB1Q9NQ66 1216 aa9.51□□□□□ -0.89
LETMD1-217ENST00000548516 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa9.51□□□□□ -0.89
LETMD1-217ENST00000548516 IL17BQ9UHF5 180 aa9.51□□□□□ -0.89
LETMD1-217ENST00000548516 GGT7Q9UJ14 662 aa9.51□□□□□ -0.89
LETMD1-217ENST00000548516 DNAJC12Q9UKB3 198 aa9.51□□□□□ -0.89
LETMD1-217ENST00000548516 I6L893 689 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
LETMD1-217ENST00000548516 KRIT1O00522 736 aa9.5□□□□□ -0.89
LETMD1-217ENST00000548516 PLD2O14939 933 aa9.5□□□□□ -0.89
LETMD1-217ENST00000548516 EFSO43281 561 aa9.5□□□□□ -0.89
LETMD1-217ENST00000548516 TSPAN6O43657 245 aa9.5□□□□□ -0.89
LETMD1-217ENST00000548516 MMP20O60882 483 aa9.5□□□□□ -0.89
LETMD1-217ENST00000548516 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
LETMD1-217ENST00000548516 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
LETMD1-217ENST00000548516 TSHRP16473 764 aa9.5□□□□□ -0.89
LETMD1-217ENST00000548516 PON1P27169 355 aa9.5□□□□□ -0.89
LETMD1-217ENST00000548516 SLC5A2P31639 672 aa9.5□□□□□ -0.89
LETMD1-217ENST00000548516 CXCR3P49682 368 aa9.5□□□□□ -0.89
LETMD1-217ENST00000548516 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
LETMD1-217ENST00000548516 CSRP3P50461 194 aa9.5□□□□□ -0.89
LETMD1-217ENST00000548516 PFN3P60673 137 aa9.5□□□□□ -0.89
LETMD1-217ENST00000548516 SKOR1P84550 965 aa9.5□□□□□ -0.89
LETMD1-217ENST00000548516 SLC20A2Q08357 652 aa9.5□□□□□ -0.89
LETMD1-217ENST00000548516 PTPN20Q4JDL3 420 aa9.5□□□□□ -0.89
LETMD1-217ENST00000548516 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
LETMD1-217ENST00000548516 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
LETMD1-217ENST00000548516 SMYD5Q6GMV2 418 aa9.5□□□□□ -0.89
LETMD1-217ENST00000548516 RAB11FIP2Q7L804 512 aa9.5□□□□□ -0.89
LETMD1-217ENST00000548516 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa9.5□□□□□ -0.89
LETMD1-217ENST00000548516 SLC47A2Q86VL8 602 aa9.5□□□□□ -0.89
LETMD1-217ENST00000548516 DRC7Q8IY82 874 aa9.5□□□□□ -0.89
LETMD1-217ENST00000548516 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
LETMD1-217ENST00000548516 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
LETMD1-217ENST00000548516 NAT6Q93015 286 aa9.5□□□□□ -0.89
LETMD1-217ENST00000548516 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
LETMD1-217ENST00000548516 TBCBQ99426 244 aa9.5□□□□□ -0.89
LETMD1-217ENST00000548516 NPY6RQ99463 290 aa9.5□□□□□ -0.89
LETMD1-217ENST00000548516 LRRC61Q9BV99 259 aa9.5□□□□□ -0.89
LETMD1-217ENST00000548516 BOCQ9BWV1 1114 aa9.5□□□□□ -0.89
LETMD1-217ENST00000548516 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa9.5□□□□□ -0.89
LETMD1-217ENST00000548516 FOXP3Q9BZS1 431 aa9.5□□□□□ -0.89
LETMD1-217ENST00000548516 CEP44Q9C0F1 390 aa9.5□□□□□ -0.89
LETMD1-217ENST00000548516 GPR27Q9NS67 375 aa9.5□□□□□ -0.89
LETMD1-217ENST00000548516 PISDQ9UG56 409 aa9.5□□□□□ -0.89
LETMD1-217ENST00000548516 SSUH2Q9Y2M2 353 aa9.5□□□□□ -0.89
LETMD1-217ENST00000548516 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa9.5□□□□□ -0.89
LETMD1-217ENST00000548516 ILVBLA1L0T0 632 aa9.49□□□□□ -0.89
LETMD1-217ENST00000548516 LMO7DNF2Z398 122 aa9.49□□□□□ -0.89
LETMD1-217ENST00000548516 GOLGA8SH3BPF8 625 aa9.49□□□□□ -0.89
LETMD1-217ENST00000548516 AP1G1O43747 822 aa9.49□□□□□ -0.89
LETMD1-217ENST00000548516 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
LETMD1-217ENST00000548516 ZMPSTE24O75844 475 aa9.49□□□□□ -0.89
LETMD1-217ENST00000548516 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
LETMD1-217ENST00000548516 UGT2B4P06133 528 aa9.49□□□□□ -0.89
LETMD1-217ENST00000548516 ITGA2BP08514 1039 aa9.49□□□□□ -0.89
LETMD1-217ENST00000548516 JMJD7P0C870 316 aa9.49□□□□□ -0.89
LETMD1-217ENST00000548516 CTSEP14091 401 aa9.49□□□□□ -0.89
LETMD1-217ENST00000548516 ITIH2P19823 946 aa9.49□□□□□ -0.89
LETMD1-217ENST00000548516 UGT1A5P35504 534 aa9.49□□□□□ -0.89
LETMD1-217ENST00000548516 ACVRL1P37023 503 aa9.49□□□□□ -0.89
LETMD1-217ENST00000548516 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
LETMD1-217ENST00000548516 PDX1P52945 283 aa9.49□□□□□ -0.89
LETMD1-217ENST00000548516 INHBCP55103 352 aa9.49□□□□□ -0.89
LETMD1-217ENST00000548516 CCL7P80098 99 aa9.49□□□□□ -0.89
LETMD1-217ENST00000548516 ARF5P84085 180 aa9.49□□□□□ -0.89
LETMD1-217ENST00000548516 GNA12Q03113 381 aa9.49□□□□□ -0.89
LETMD1-217ENST00000548516 PPARDQ03181 441 aa9.49□□□□□ -0.89
LETMD1-217ENST00000548516 CAMK4Q16566 473 aa9.49□□□□□ -0.89
LETMD1-217ENST00000548516 MAN2A1Q16706 1144 aa9.49□□□□□ -0.89
LETMD1-217ENST00000548516 LINC00303Q3SY05 128 aa9.49□□□□□ -0.89
LETMD1-217ENST00000548516 ZNF805Q5CZA5 627 aa9.49□□□□□ -0.89
LETMD1-217ENST00000548516 ZNF783Q6ZMS7 281 aa9.49□□□□□ -0.89
LETMD1-217ENST00000548516 CLEC14AQ86T13 490 aa9.49□□□□□ -0.89
LETMD1-217ENST00000548516 TTC7BQ86TV6 843 aa9.49□□□□□ -0.89
LETMD1-217ENST00000548516 ZNF354CQ86Y25 554 aa9.49□□□□□ -0.89
LETMD1-217ENST00000548516 HID1Q8IV36 788 aa9.49□□□□□ -0.89
LETMD1-217ENST00000548516 ZNF683Q8IZ20 524 aa9.49□□□□□ -0.89
LETMD1-217ENST00000548516 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa9.49□□□□□ -0.89
LETMD1-217ENST00000548516 MLKLQ8NB16 471 aa9.49□□□□□ -0.89
LETMD1-217ENST00000548516 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
LETMD1-217ENST00000548516 WDR48Q8TAF3 677 aa9.49□□□□□ -0.89
LETMD1-217ENST00000548516 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
LETMD1-217ENST00000548516 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
LETMD1-217ENST00000548516 CCDC74AQ96AQ1 378 aa9.49□□□□□ -0.89
LETMD1-217ENST00000548516 C18orf8Q96DM3 657 aa9.49□□□□□ -0.89
LETMD1-217ENST00000548516 SGF29Q96ES7 293 aa9.49□□□□□ -0.89
LETMD1-217ENST00000548516 KLHL32Q96NJ5 620 aa9.49□□□□□ -0.89
LETMD1-217ENST00000548516 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
LETMD1-217ENST00000548516 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
LETMD1-217ENST00000548516 STRADBQ9C0K7 418 aa9.49□□□□□ -0.89
LETMD1-217ENST00000548516 CLPBQ9H078 707 aa9.49□□□□□ -0.89
LETMD1-217ENST00000548516 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
LETMD1-217ENST00000548516 KIAA1468Q9P260 1216 aa9.49□□□□□ -0.89
LETMD1-217ENST00000548516 DACH1Q9UI36 760 aa9.49□□□□□ -0.89
LETMD1-217ENST00000548516 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
LETMD1-217ENST00000548516 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
LETMD1-217ENST00000548516 TRPM6Q9BX84 2022 aa9.49□□□□□ -0.89
LETMD1-217ENST00000548516 RP1P56715 2156 aa9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.1 ms