RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532751.1

PTPRK-222, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRK, Length 563 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-222ENST00000532751 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 TRIM69Q86WT6 500 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 RAB7BQ96AH8 199 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 RXFP3Q9NSD7 469 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 CACNA1EQ15878 2313 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 C16orf96A6NNT2 1141 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 PCDH8O95206 1070 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 ENGP17813 658 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 MX2P20592 715 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 TAS2R38P59533 333 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 PPP2CBP62714 309 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 PPP2CAP67775 309 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP22.24■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 GALNT2Q10471 571 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 KIF5AQ12840 1032 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 TEAD4Q15561 434 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 SRLQ86TD4 932 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 PQLC3Q8N755 202 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 CCDC112Q8NEF3 446 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 C1orf216Q8TAB5 229 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 PSKH2Q96QS6 385 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 LACRTQ9GZZ8 138 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 GOLPH3Q9H4A6 298 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 GRPEL1Q9HAV7 217 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 TMEM9BQ9NQ34 198 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 SALL4Q9UJQ4 1053 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 PCDH15Q96QU1 1955 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 DOCK9Q9BZ29 2069 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 TRPM6Q9BX84 2022 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 C10orf142B7Z368 130 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 ARHGAP33O14559 1287 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 APOL1O14791 398 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 INSIG1O15503 277 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 GARSP41250 739 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 MAPK8P45983 427 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 ID4P47928 161 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 SLC10A7Q0GE19 358 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 CFAP58Q5T655 872 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 STPG1Q5TH74 334 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 MARC1Q5VT66 337 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 RFX6Q8HWS3 928 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 RTKNQ9BST9 563 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 DESI2Q9BSY9 194 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 TM9SF3Q9HD45 589 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 DKK3Q9UBP4 350 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 DUSP10Q9Y6W6 482 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 LATO43561 262 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 AP1G1O43747 822 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 XPAP23025 273 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 GRIA4P48058 902 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 RACK1P63244 317 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 HCAR2Q8TDS4 363 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 SKA1Q96BD8 255 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 RMDN1Q96DB5 314 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 FEM1CQ96JP0 617 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 ORAI3Q9BRQ5 295 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 SUV39H2Q9H5I1 410 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 HAUS2Q9NVX0 235 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 DMTF1Q9Y222 760 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 A0A1W2PQU0 124 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 SLC30A4O14863 429 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 ARHGAP6O43182 974 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 NRDCO43847 1150 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 MAP3K6O95382 1288 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 PIGNO95427 931 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 PEX11BO96011 259 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 CCNCP24863 283 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 SERPINA4P29622 427 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 MMP13P45452 471 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 RGRP47804 291 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 SCNN1BP51168 640 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 AP1S1P61966 158 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 GBE1Q04446 702 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 TFDP2Q14188 446 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP22.21■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 SLC45A4Q5BKX6 768 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 SLC9A4Q6AI14 798 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 MFSD7Q6UXD7 560 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 TTC7BQ86TV6 843 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 ZSCAN30Q86W11 494 aa22.21■■□□□ 1.15
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