RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520948.5

VEGFA-222, Transcript of vascular endothelial growth factor A, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene VEGFA, Length 1,199 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
VEGFA-222	ENST00000520948	CAMK1G	Q96NX5	476 aa		18.44	■□□□□ 0.54
VEGFA-222	ENST00000520948	TSGA13	Q96PP4	275 aa		18.44	■□□□□ 0.54
VEGFA-222	ENST00000520948	ALS2CR12	Q96Q35	445 aa		18.44	■□□□□ 0.54
VEGFA-222	ENST00000520948	TLR10	Q9BXR5	811 aa		18.44	■□□□□ 0.54
VEGFA-222	ENST00000520948	RSPH9	Q9H1X1	276 aa	Predicted RBP	18.44	■□□□□ 0.54
VEGFA-222	ENST00000520948	FBRS	Q9HAH7	460 aa		18.44	■□□□□ 0.54
VEGFA-222	ENST00000520948	MCF2L	O15068	1137 aa		18.43	■□□□□ 0.54
VEGFA-222	ENST00000520948	CST8	O60676	142 aa		18.43	■□□□□ 0.54
VEGFA-222	ENST00000520948	CD59	P13987	128 aa		18.43	■□□□□ 0.54
VEGFA-222	ENST00000520948	GARS	P41250	739 aa	Known RBP	18.43	■□□□□ 0.54
VEGFA-222	ENST00000520948	LLGL1	Q15334	1064 aa		18.43	■□□□□ 0.54
VEGFA-222	ENST00000520948	NPNT	Q6UXI9	565 aa		18.43	■□□□□ 0.54
VEGFA-222	ENST00000520948	BBS12	Q6ZW61	710 aa		18.43	■□□□□ 0.54
VEGFA-222	ENST00000520948	ZNF354C	Q86Y25	554 aa		18.43	■□□□□ 0.54
VEGFA-222	ENST00000520948	CCDC50	Q8IVM0	306 aa		18.43	■□□□□ 0.54
VEGFA-222	ENST00000520948	CHCHD4	Q8N4Q1	142 aa		18.43	■□□□□ 0.54
VEGFA-222	ENST00000520948	PCDH20	Q8N6Y1	951 aa	Known RBP	18.43	■□□□□ 0.54
VEGFA-222	ENST00000520948	OR2A12	Q8NGT7	310 aa		18.43	■□□□□ 0.54
VEGFA-222	ENST00000520948	TRAF3IP1	Q8TDR0	691 aa	Predicted RBP	18.43	■□□□□ 0.54
VEGFA-222	ENST00000520948	FATE1	Q969F0	183 aa		18.43	■□□□□ 0.54
VEGFA-222	ENST00000520948	ZNF599	Q96NL3	588 aa		18.43	■□□□□ 0.54
VEGFA-222	ENST00000520948	OLFM3	Q96PB7	478 aa		18.43	■□□□□ 0.54
VEGFA-222	ENST00000520948	OSBPL8	Q9BZF1	889 aa		18.43	■□□□□ 0.54
VEGFA-222	ENST00000520948	FCF1	Q9Y324	198 aa	Known RBP	18.43	■□□□□ 0.54
VEGFA-222	ENST00000520948	MSRB2	Q9Y3D2	182 aa		18.43	■□□□□ 0.54
VEGFA-222	ENST00000520948	ZZEF1	O43149	2961 aa		18.42	■□□□□ 0.54
VEGFA-222	ENST00000520948	SYP	P08247	313 aa		18.42	■□□□□ 0.54
VEGFA-222	ENST00000520948	TGM2	P21980	687 aa		18.42	■□□□□ 0.54
VEGFA-222	ENST00000520948	CCNC	P24863	283 aa		18.42	■□□□□ 0.54
VEGFA-222	ENST00000520948	NR2C2	P49116	596 aa		18.42	■□□□□ 0.54
VEGFA-222	ENST00000520948	ZNF211	Q13398	564 aa	Predicted RBP	18.42	■□□□□ 0.54
VEGFA-222	ENST00000520948	RPS6KA1	Q15418	735 aa		18.42	■□□□□ 0.54
VEGFA-222	ENST00000520948	KAZN	Q674X7	775 aa		18.42	■□□□□ 0.54
VEGFA-222	ENST00000520948		Q6ZVU0	165 aa		18.42	■□□□□ 0.54
VEGFA-222	ENST00000520948	TMPRSS6	Q8IU80	811 aa		18.42	■□□□□ 0.54
VEGFA-222	ENST00000520948	STK40	Q8N2I9	435 aa		18.42	■□□□□ 0.54
VEGFA-222	ENST00000520948	HDAC11	Q96DB2	347 aa		18.42	■□□□□ 0.54
VEGFA-222	ENST00000520948	ZNF419	Q96HQ0	510 aa	Predicted RBP	18.42	■□□□□ 0.54
VEGFA-222	ENST00000520948	HEMGN	Q9BXL5	484 aa		18.42	■□□□□ 0.54
VEGFA-222	ENST00000520948	LHX3	Q9UBR4	397 aa		18.42	■□□□□ 0.54
VEGFA-222	ENST00000520948	UBA2	Q9UBT2	640 aa	Predicted RBP	18.42	■□□□□ 0.54
VEGFA-222	ENST00000520948	FAM208B	Q5VWN6	2430 aa		18.42	■□□□□ 0.54
VEGFA-222	ENST00000520948	GOLGA6L9	A6NEM1	432 aa		18.41	■□□□□ 0.54
VEGFA-222	ENST00000520948	MEI4	A8MW99	385 aa		18.41	■□□□□ 0.54
VEGFA-222	ENST00000520948	ALOX15B	O15296	676 aa		18.41	■□□□□ 0.54
VEGFA-222	ENST00000520948	SH3BP5	O60239	455 aa		18.41	■□□□□ 0.54
VEGFA-222	ENST00000520948	TMCC1	O94876	653 aa		18.41	■□□□□ 0.54
VEGFA-222	ENST00000520948	MAP3K6	O95382	1288 aa		18.41	■□□□□ 0.54
VEGFA-222	ENST00000520948	GSR	P00390	522 aa		18.41	■□□□□ 0.54
VEGFA-222	ENST00000520948	HOXB3	P14651	431 aa	Predicted RBP	18.41	■□□□□ 0.54
VEGFA-222	ENST00000520948	RPS14	P62263	151 aa	Known RBP	18.41	■□□□□ 0.54
VEGFA-222	ENST00000520948	DYNLT1	P63172	113 aa		18.41	■□□□□ 0.54
VEGFA-222	ENST00000520948	SLC10A7	Q0GE19	358 aa		18.41	■□□□□ 0.54
VEGFA-222	ENST00000520948	RFTN1	Q14699	578 aa	Predicted RBP	18.41	■□□□□ 0.54
VEGFA-222	ENST00000520948	CARD16	Q5EG05	197 aa		18.41	■□□□□ 0.54
VEGFA-222	ENST00000520948	SYCP2L	Q5T4T6	812 aa		18.41	■□□□□ 0.54
VEGFA-222	ENST00000520948	CACUL1	Q86Y37	369 aa		18.41	■□□□□ 0.54
VEGFA-222	ENST00000520948	TNKS2	Q9H2K2	1166 aa		18.41	■□□□□ 0.54
VEGFA-222	ENST00000520948	SP110	Q9HB58	689 aa		18.41	■□□□□ 0.54
VEGFA-222	ENST00000520948	ITM2C	Q9NQX7	267 aa		18.41	■□□□□ 0.54
VEGFA-222	ENST00000520948	DNAAF2	Q9NVR5	837 aa	Known RBP	18.41	■□□□□ 0.54
VEGFA-222	ENST00000520948	SAE1	Q9UBE0	346 aa	Predicted RBP	18.41	■□□□□ 0.54
VEGFA-222	ENST00000520948	PPM1H	Q9ULR3	514 aa		18.41	■□□□□ 0.54
VEGFA-222	ENST00000520948	HEY1	Q9Y5J3	304 aa		18.41	■□□□□ 0.54
VEGFA-222	ENST00000520948	SHROOM3	Q8TF72	1996 aa		18.41	■□□□□ 0.54
VEGFA-222	ENST00000520948	MATN3	O15232	486 aa		18.4	■□□□□ 0.54
VEGFA-222	ENST00000520948	PECAM1	P16284	738 aa	Predicted RBP	18.4	■□□□□ 0.54
VEGFA-222	ENST00000520948	MX2	P20592	715 aa		18.4	■□□□□ 0.54
VEGFA-222	ENST00000520948	CD6	P30203	668 aa		18.4	■□□□□ 0.54
VEGFA-222	ENST00000520948	CETN2	P41208	172 aa		18.4	■□□□□ 0.54
VEGFA-222	ENST00000520948	PPID	Q08752	370 aa	Known RBP	18.4	■□□□□ 0.54
VEGFA-222	ENST00000520948	GRIK2	Q13002	908 aa		18.4	■□□□□ 0.54
VEGFA-222	ENST00000520948	KLF1	Q13351	362 aa	Predicted RBP	18.4	■□□□□ 0.54
VEGFA-222	ENST00000520948	ELAVL3	Q14576	367 aa	Known RBP	18.4	■□□□□ 0.54
VEGFA-222	ENST00000520948	LBR	Q14739	615 aa	Known RBP	18.4	■□□□□ 0.54
VEGFA-222	ENST00000520948	ZNF569	Q5MCW4	686 aa		18.4	■□□□□ 0.54
VEGFA-222	ENST00000520948	DPY19L3	Q6ZPD9	716 aa		18.4	■□□□□ 0.54
VEGFA-222	ENST00000520948	SLC35F6	Q8N357	371 aa		18.4	■□□□□ 0.54
VEGFA-222	ENST00000520948	ATPAF2	Q8N5M1	289 aa		18.4	■□□□□ 0.54
VEGFA-222	ENST00000520948	TEX26	Q8N6G2	289 aa		18.4	■□□□□ 0.54
VEGFA-222	ENST00000520948	OR2AP1	Q8NGE2	309 aa		18.4	■□□□□ 0.54
VEGFA-222	ENST00000520948	MAML1	Q92585	1016 aa		18.4	■□□□□ 0.54
VEGFA-222	ENST00000520948	TOE1	Q96GM8	510 aa	Known RBP	18.4	■□□□□ 0.54
VEGFA-222	ENST00000520948	GPR174	Q9BXC1	333 aa		18.4	■□□□□ 0.54
VEGFA-222	ENST00000520948	SUSD2	Q9UGT4	822 aa		18.4	■□□□□ 0.54
VEGFA-222	ENST00000520948	JRKL	Q9Y4A0	524 aa		18.4	■□□□□ 0.54
VEGFA-222	ENST00000520948	APOC4-APOC2	K7ER74	178 aa		18.39	■□□□□ 0.53
VEGFA-222	ENST00000520948	GJB3	O75712	270 aa		18.39	■□□□□ 0.53
VEGFA-222	ENST00000520948	TRIM16	O95361	564 aa		18.39	■□□□□ 0.53
VEGFA-222	ENST00000520948	APOC2	P02655	101 aa		18.39	■□□□□ 0.53
VEGFA-222	ENST00000520948	CTSL	P07711	333 aa		18.39	■□□□□ 0.53
VEGFA-222	ENST00000520948	GNS	P15586	552 aa		18.39	■□□□□ 0.53
VEGFA-222	ENST00000520948	CSNK1D	P48730	415 aa		18.39	■□□□□ 0.53
VEGFA-222	ENST00000520948	ZBTB16	Q05516	673 aa		18.39	■□□□□ 0.53
VEGFA-222	ENST00000520948	NSUN2	Q08J23	767 aa	Known RBP eCLIP	18.39	■□□□□ 0.53
VEGFA-222	ENST00000520948	HNRNPD	Q14103	355 aa	Known RBP	18.39	■□□□□ 0.53
VEGFA-222	ENST00000520948	PDK1	Q15118	436 aa		18.39	■□□□□ 0.53
VEGFA-222	ENST00000520948	WDR45B	Q5MNZ6	344 aa		18.39	■□□□□ 0.53
VEGFA-222	ENST00000520948	TMCO4	Q5TGY1	634 aa		18.39	■□□□□ 0.53
VEGFA-222	ENST00000520948	ZNF776	Q68DI1	518 aa	Predicted RBP	18.39	■□□□□ 0.53

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