RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 TTC16Q8NEE8 873 aa10.23□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 EXD1Q8NHP7 514 aa10.23□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa10.23□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 HASPINQ8TF76 798 aa10.23□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM40Q8WWA1 233 aa10.23□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 WNT8BQ93098 351 aa10.23□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 CCDC138Q96M89 665 aa10.23□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 ALPK1Q96QP1 1244 aa10.23□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 CIB1Q99828 191 aa10.23□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 CERS4Q9HA82 394 aa10.23□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 PARVBQ9HBI1 364 aa10.23□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 PNPLA3Q9NST1 481 aa10.23□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 THAP1Q9NVV9 213 aa10.23□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa10.23□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 GPSM3Q9Y4H4 160 aa10.23□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 MGEA5O60502 916 aa10.22□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 ESRRBO95718 433 aa10.22□□□□□ -0.77
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TRPS1-211ENST00000520276 SERPINB5P36952 375 aa10.22□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 NR4A2P43354 598 aa10.22□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 RAB39AQ14964 217 aa10.22□□□□□ -0.77
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TRPS1-211ENST00000520276 BRSK2Q8IWQ3 736 aa10.22□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 PPIL6Q8IXY8 311 aa10.22□□□□□ -0.77
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TRPS1-211ENST00000520276 ADAM32Q8TC27 787 aa10.22□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 ARNTL2Q8WYA1 636 aa10.22□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 SLITRK1Q96PX8 696 aa10.22□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 PCDH9Q9HC56 1237 aa10.22□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 PCDH12Q9NPG4 1184 aa10.22□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 RIC8BQ9NVN3 520 aa10.22□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP10.22□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 SPG21Q9NZD8 308 aa10.22□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 TTLL3Q9Y4R7 772 aa10.22□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 A0A0G2JMZ2 1700 aa10.22□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 GSRP00390 522 aa10.22□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 CAPNS1P04632 268 aa10.22□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 ITGB3P05106 788 aa10.22□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 FAM26DQ5JW98 314 aa10.22□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
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TRPS1-211ENST00000520276 NDUFAF2Q8N183 169 aa10.22□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 LRTOMTQ8WZ04 291 aa10.22□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 OSBPL11Q9BXB4 747 aa10.22□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 RGS18Q9NS28 235 aa10.22□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 E7ESA3 106 aa10.22□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 PSTPIP1O43586 416 aa10.22□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 C8BP07358 591 aa10.22□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 UNGP13051 313 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
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TRPS1-211ENST00000520276 FEM1CQ96JP0 617 aa10.22□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 ZFP42Q96MM3 310 aa10.22□□□□□ -0.77
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TRPS1-211ENST00000520276 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 RPL22P35268 128 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 PTP4A2Q12974 167 aa10.21□□□□□ -0.77
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TRPS1-211ENST00000520276 MTX3Q5HYI7 312 aa10.21□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 ADGRF2Q8IZF7 708 aa10.21□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 TRPC4APQ8TEL6 797 aa10.21□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 C11orf70Q9BRQ4 267 aa10.21□□□□□ -0.77
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TRPS1-211ENST00000520276 SLC8A2Q9UPR5 921 aa10.21□□□□□ -0.77
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TRPS1-211ENST00000520276 KRT1P04264 644 aa10.21□□□□□ -0.78
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TRPS1-211ENST00000520276 SLC1A6P48664 564 aa10.21□□□□□ -0.78
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TRPS1-211ENST00000520276 MROH9Q5TGP6 573 aa10.21□□□□□ -0.78
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TRPS1-211ENST00000520276 HERC6Q8IVU3 1022 aa10.21□□□□□ -0.78
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TRPS1-211ENST00000520276 BCAP29Q9UHQ4 241 aa10.21□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa10.21□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 MGAMO43451 1857 aa10.21□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 HMX2A2RU54 273 aa10.21□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa10.21□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF195O14628 629 aa10.21□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 FAM189A1O60320 539 aa10.21□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 C1QAP02745 245 aa10.21□□□□□ -0.78
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