RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516272.1

RNU6-277P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 277, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-277P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-277P-201ENST00000516272 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 J3KR12 359 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 MYF6P23409 242 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 PMP22Q01453 160 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 FAM27E3Q08E93 113 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 TNFAIP1Q13829 316 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLC1A5Q15758 541 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 SYT16Q17RD7 645 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 TRIM60Q495X7 471 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 NFRKBQ6P4R8 1299 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 C19orf48Q6RUI8 117 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLC9B2Q86UD5 537 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 KCNH5Q8NCM2 988 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLC2A12Q8TD20 617 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 CPT1BQ92523 772 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 LRFN5Q96NI6 719 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 CSF3RQ99062 836 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 SARGQ9BW04 601 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF696Q9H7X3 374 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 PTPRHQ9HD43 1115 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 GRHL1Q9NZI5 618 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF224Q9NZL3 707 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 SIX4Q9UIU6 781 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 RCE1Q9Y256 329 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 OR6C68A6NDL8 312 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLC25A17O43808 307 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 TIPRLO75663 272 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 GAGE7O76087 117 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 TNFRSF6BO95407 300 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 GAGE12FP0CL80 117 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 GAGE12GP0CL81 117 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 GAGE12IP0CL82 117 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 TFPIP10646 304 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 IL15P40933 162 aaPredicted RBP2.87□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 GAGE1Q13065 139 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 GAGE4Q13068 117 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 LPIN1Q14693 890 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 GALNTL6Q49A17 601 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 LRRC24Q50LG9 513 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 RUNDC3AQ59EK9 446 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 FAM69BQ5VUD6 431 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 RAB11FIP2Q7L804 512 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 SYTL1Q8IYJ3 562 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 DMBX1Q8NFW5 382 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 STYXQ8WUJ0 223 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 FIG4Q92562 907 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 RSC1A1Q92681 617 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 C3orf49Q96BT1 292 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 CCDC138Q96M89 665 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 RTKNQ9BST9 563 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 BARHL1Q9BZE3 327 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 CXorf56Q9H5V9 222 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 TAAR2Q9P1P5 351 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF711Q9Y462 761 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP2.87□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 FAM157AC9JC47 383 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 PRSS1P07477 247 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 LINC00271P0C7V0 271 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 KRT5P13647 590 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 MARK3P27448 753 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 SERPINA4P29622 427 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 AVPR2P30518 371 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 HSD17B4P51659 736 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 STARD3Q14849 445 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 DENND6AQ8IWF6 608 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP2.86□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 TAS1R2Q8TE23 839 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 PARD3BQ8TEW8 1205 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 RNF183Q96D59 192 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 ABCF3Q9NUQ8 709 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 THAP1Q9NVV9 213 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLC9A2Q9UBY0 812 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 FBXO40Q9UH90 709 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 KCNS2Q9ULS6 477 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 DAPP1Q9UN19 280 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP2.86□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP2.86□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 ACTL6BO94805 426 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 ITGA2BP08514 1039 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 FGF5P12034 268 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 CHN1P15882 459 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 ABCB4P21439 1286 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 MCM3P25205 808 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 ALDH4A1P30038 563 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 CDK7P50613 346 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 FUT6P51993 359 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 HDAC4P56524 1084 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 ECT2LQ008S8 904 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 SREBF2Q12772 1141 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 PDCLQ13371 301 aa2.85□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35 ms