RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495615.5

CBWD5-231, Transcript of COBW domain containing 5, human

TSL 3

Gene CBWD5, Length 993 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CBWD5-231	ENST00000495615	FAM90A12P	A8MX19	464 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CBWD5-231	ENST00000495615	FAM90A23P	A8MXZ1	464 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CBWD5-231	ENST00000495615	NCAM2	O15394	837 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CBWD5-231	ENST00000495615	HOXC6	P09630	235 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CBWD5-231	ENST00000495615	PCNA	P12004	261 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CBWD5-231	ENST00000495615	ZNF8	P17098	575 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CBWD5-231	ENST00000495615	GNLY	P22749	145 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CBWD5-231	ENST00000495615	CNTF	P26441	200 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CBWD5-231	ENST00000495615	PCYT1A	P49585	367 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CBWD5-231	ENST00000495615	PDLIM4	P50479	330 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CBWD5-231	ENST00000495615	CRYZ	Q08257	329 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CBWD5-231	ENST00000495615	ATG9B	Q674R7	924 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CBWD5-231	ENST00000495615	NAPEPLD	Q6IQ20	393 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CBWD5-231	ENST00000495615	FAM83H	Q6ZRV2	1179 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CBWD5-231	ENST00000495615	CPO	Q8IVL8	374 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CBWD5-231	ENST00000495615	RBFA	Q8N0V3	343 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CBWD5-231	ENST00000495615	IQCF1	Q8N6M8	205 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CBWD5-231	ENST00000495615	LSM14A	Q8ND56	463 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CBWD5-231	ENST00000495615	OR4N2	Q8NGD1	307 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CBWD5-231	ENST00000495615	GDPD5	Q8WTR4	605 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CBWD5-231	ENST00000495615	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CBWD5-231	ENST00000495615	CTAGE1	Q96RT6	745 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CBWD5-231	ENST00000495615	EYA3	Q99504	573 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CBWD5-231	ENST00000495615	HNRNPUL1	Q9BUJ2	856 aa	Known RBP eCLIP	4.97	□□□□□ -1.61
CBWD5-231	ENST00000495615	INTS2	Q9H0H0	1204 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CBWD5-231	ENST00000495615	SPATS2L	Q9NUQ6	558 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CBWD5-231	ENST00000495615	WNT16	Q9UBV4	365 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CBWD5-231	ENST00000495615	TBX20	Q9UMR3	447 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CBWD5-231	ENST00000495615	GTF2A1L	Q9UNN4	478 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CBWD5-231	ENST00000495615	PCDHGB5	Q9Y5G0	923 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CBWD5-231	ENST00000495615	EVPL	Q92817	2033 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CBWD5-231	ENST00000495615	TYW5	A2RUC4	315 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CBWD5-231	ENST00000495615	TSPAN4	O14817	238 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CBWD5-231	ENST00000495615	ITM2A	O43736	263 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CBWD5-231	ENST00000495615	CTPS1	P17812	591 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CBWD5-231	ENST00000495615	CENPA	P49450	140 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CBWD5-231	ENST00000495615	CCR5	P51681	352 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CBWD5-231	ENST00000495615	EGR4	Q05215	589 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CBWD5-231	ENST00000495615	RUNX2	Q13950	521 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CBWD5-231	ENST00000495615	GPR68	Q15743	365 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CBWD5-231	ENST00000495615	FBXO43	Q4G163	708 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CBWD5-231	ENST00000495615	RRM2B	Q7LG56	351 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CBWD5-231	ENST00000495615	RBM23	Q86U06	439 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CBWD5-231	ENST00000495615	DENND6A	Q8IWF6	608 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CBWD5-231	ENST00000495615	TEX45	Q8NA69	505 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CBWD5-231	ENST00000495615	ZCCHC10	Q8TBK6	192 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CBWD5-231	ENST00000495615	ELP5	Q8TE02	316 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CBWD5-231	ENST00000495615	PHF21B	Q96EK2	531 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CBWD5-231	ENST00000495615	LMAN2L	Q9H0V9	348 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CBWD5-231	ENST00000495615	CDT1	Q9H211	546 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CBWD5-231	ENST00000495615	WDR6	Q9NNW5	1121 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CBWD5-231	ENST00000495615	BEX4	Q9NWD9	120 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CBWD5-231	ENST00000495615	TMEM160	Q9NX00	188 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CBWD5-231	ENST00000495615	HCN3	Q9P1Z3	774 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CBWD5-231	ENST00000495615	PROCR	Q9UNN8	238 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CBWD5-231	ENST00000495615	PAM16	Q9Y3D7	125 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CBWD5-231	ENST00000495615	GAGE10	A6NGK3	116 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CBWD5-231	ENST00000495615	KDM4E	B2RXH2	506 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CBWD5-231	ENST00000495615	CHL1	O00533	1208 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CBWD5-231	ENST00000495615	EBAG9	O00559	213 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CBWD5-231	ENST00000495615	HOXC11	O43248	304 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CBWD5-231	ENST00000495615	SLC25A17	O43808	307 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CBWD5-231	ENST00000495615	MTA2	O94776	668 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CBWD5-231	ENST00000495615	POLB	P06746	335 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CBWD5-231	ENST00000495615	TFPI	P10646	304 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CBWD5-231	ENST00000495615	SLC2A4	P14672	509 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CBWD5-231	ENST00000495615	NAGA	P17050	411 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CBWD5-231	ENST00000495615	PTPN2	P17706	415 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CBWD5-231	ENST00000495615	MYF6	P23409	242 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CBWD5-231	ENST00000495615	ITGB8	P26012	769 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CBWD5-231	ENST00000495615	ARL1	P40616	181 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CBWD5-231	ENST00000495615	LIFR	P42702	1097 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CBWD5-231	ENST00000495615	CDH15	P55291	814 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CBWD5-231	ENST00000495615	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CBWD5-231	ENST00000495615	ZNF324B	Q6AW86	544 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CBWD5-231	ENST00000495615	SLC22A25	Q6T423	547 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CBWD5-231	ENST00000495615	ADHFE1	Q8IWW8	467 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CBWD5-231	ENST00000495615	C11orf65	Q8NCR3	313 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CBWD5-231	ENST00000495615	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CBWD5-231	ENST00000495615	GPT2	Q8TD30	523 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CBWD5-231	ENST00000495615	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CBWD5-231	ENST00000495615	MED30	Q96HR3	178 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CBWD5-231	ENST00000495615	SEZ6L	Q9BYH1	1024 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CBWD5-231	ENST00000495615	SLCO5A1	Q9H2Y9	848 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CBWD5-231	ENST00000495615	SLC32A1	Q9H598	525 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CBWD5-231	ENST00000495615	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CBWD5-231	ENST00000495615	PPP1R14D	Q9NXH3	145 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CBWD5-231	ENST00000495615	HSF4	Q9ULV5	492 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CBWD5-231	ENST00000495615	SOX30	O94993	753 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CBWD5-231	ENST00000495615	PRSS2	P07478	247 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CBWD5-231	ENST00000495615	POU1F1	P28069	291 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CBWD5-231	ENST00000495615	NUDT6	P53370	316 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CBWD5-231	ENST00000495615	RPP30	P78346	268 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CBWD5-231	ENST00000495615	SLC18A2	Q05940	514 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CBWD5-231	ENST00000495615	FAM27E3	Q08E93	113 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CBWD5-231	ENST00000495615	ST3GAL1	Q11201	340 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CBWD5-231	ENST00000495615	CAMK1	Q14012	370 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CBWD5-231	ENST00000495615	KEAP1	Q14145	624 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CBWD5-231	ENST00000495615	NEK10	Q6ZWH5	1172 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CBWD5-231	ENST00000495615	TADA2B	Q86TJ2	420 aa		4.94	□□□□□ -1.62

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