RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492741.5

PSPC1-204, Transcript of paraspeckle component 1, humanhuman

TSL 2

Gene PSPC1, Length 1,709 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPC1-204ENST00000492741 MYO10Q9HD67 2058 aa22.31■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 OLIG2Q13516 323 aa22.31■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 CARD16Q5EG05 197 aa22.31■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 Q6ZVU0 165 aa22.31■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 CENPUQ71F23 418 aa22.31■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 TBL1YQ9BQ87 522 aa22.31■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 APOL2Q9BQE5 337 aa22.31■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa22.31■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 SUN1O94901 812 aa22.3■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 AGTP01019 485 aa22.3■■□□□ 1.16
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PSPC1-204ENST00000492741 GRIA1P42261 906 aa22.3■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 TNFRSF4P43489 277 aa22.3■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 VASPP50552 380 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 AP1S1P61966 158 aa22.3■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 RAD51Q06609 339 aa22.3■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 ZNF234Q14588 700 aa22.3■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 SLC44A4Q53GD3 710 aa22.3■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 RALGPS1Q5JS13 557 aa22.3■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 EMBQ6PCB8 327 aa22.3■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 CEP128Q6ZU80 1094 aa22.3■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 PAF1Q8N7H5 531 aa22.3■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 MRGPRX2Q96LB1 330 aa22.3■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 SERPINB12Q96P63 405 aa22.3■■□□□ 1.16
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PSPC1-204ENST00000492741 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
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PSPC1-204ENST00000492741 GSRP00390 522 aa22.29■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 MAPK8P45983 427 aa22.29■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 CSNK1DP48730 415 aa22.29■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP22.29■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 E2F5Q15329 346 aa22.29■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 BBS9Q3SYG4 887 aa22.29■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 FNBP1LQ5T0N5 605 aa22.29■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 LRRC8BQ6P9F7 803 aa22.29■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 NCEH1Q6PIU2 408 aa22.29■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 KDELC1Q6UW63 502 aa22.29■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa22.29■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa22.29■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 ZNF366Q8N895 744 aa22.29■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 OR52K1Q8NGK4 314 aa22.29■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 MYO19Q96H55 970 aa22.29■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 DUSP12Q9UNI6 340 aa22.29■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa22.29■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa22.29■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 DYNC1I1O14576 645 aa22.28■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 CA4P22748 312 aa22.28■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 SEC13P55735 322 aa22.28■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
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PSPC1-204ENST00000492741 EMC10Q5UCC4 262 aa22.28■■□□□ 1.16
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PSPC1-204ENST00000492741 SAYSD1Q9NPB0 183 aa22.28■■□□□ 1.16
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PSPC1-204ENST00000492741 BCL2L1Q07817 233 aa22.28■■□□□ 1.16
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PSPC1-204ENST00000492741 SLC14A2Q15849 920 aa22.28■■□□□ 1.16
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PSPC1-204ENST00000492741 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa22.28■■□□□ 1.16
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PSPC1-204ENST00000492741 KDM1BQ8NB78 822 aa22.28■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 MSANTD3Q96H12 275 aa22.28■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa22.28■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa22.28■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 ARFGAP3Q9NP61 516 aa22.28■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa22.28■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 SORCS3Q9UPU3 1222 aa22.28■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 RAI2Q9Y5P3 530 aa22.28■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 K7EQS6 105 aa22.27■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 AP3B1O00203 1094 aa22.27■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 MLNP12872 115 aa22.27■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 HLA-EP13747 358 aa22.27■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 DRD1P21728 446 aa22.27■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 GKP32189 559 aa22.27■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 ADRA1AP35348 466 aa22.27■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 TIE1P35590 1138 aa22.27■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 CDH17Q12864 832 aa22.27■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 TMEM196Q5HYL7 178 aa22.27■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 OR2A12Q8NGT7 310 aa22.27■■□□□ 1.16
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