RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489895.5

NISCH-213, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 5,350 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-213ENST00000489895 NPAS4Q8IUM7 802 aa17.2■□□□□ 0.34
NISCH-213ENST00000489895 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa17.2■□□□□ 0.34
NISCH-213ENST00000489895 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa17.2■□□□□ 0.34
NISCH-213ENST00000489895 CST3P01034 146 aaPredicted RBP17.19■□□□□ 0.34
NISCH-213ENST00000489895 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP17.19■□□□□ 0.34
NISCH-213ENST00000489895 POU1F1P28069 291 aa17.19■□□□□ 0.34
NISCH-213ENST00000489895 PTPN9P43378 593 aa17.19■□□□□ 0.34
NISCH-213ENST00000489895 PCYT1AP49585 367 aa17.19■□□□□ 0.34
NISCH-213ENST00000489895 NAGLUP54802 743 aa17.19■□□□□ 0.34
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NISCH-213ENST00000489895 SLC24A3Q9HC58 644 aa17.19■□□□□ 0.34
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NISCH-213ENST00000489895 KLHL20Q9Y2M5 609 aa17.19■□□□□ 0.34
NISCH-213ENST00000489895 DCXO43602 365 aa17.19■□□□□ 0.34
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NISCH-213ENST00000489895 OR4L1Q8NH43 312 aa17.19■□□□□ 0.34
NISCH-213ENST00000489895 USP7Q93009 1102 aa17.19■□□□□ 0.34
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NISCH-213ENST00000489895 NTSP30990 170 aa17.19■□□□□ 0.34
NISCH-213ENST00000489895 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP17.19■□□□□ 0.34
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NISCH-213ENST00000489895 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP17.19■□□□□ 0.34
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NISCH-213ENST00000489895 SAC3D1A6NKF1 404 aa17.18■□□□□ 0.34
NISCH-213ENST00000489895 ATP6V1G2O95670 118 aa17.18■□□□□ 0.34
NISCH-213ENST00000489895 SLC34A1Q06495 639 aa17.18■□□□□ 0.34
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NISCH-213ENST00000489895 TEX44Q53QW1 395 aa17.18■□□□□ 0.34
NISCH-213ENST00000489895 TTMPQ5BVD1 217 aa17.18■□□□□ 0.34
NISCH-213ENST00000489895 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP17.18■□□□□ 0.34
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NISCH-213ENST00000489895 TPSAB1Q15661 275 aa17.18■□□□□ 0.34
NISCH-213ENST00000489895 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP17.18■□□□□ 0.34
NISCH-213ENST00000489895 C11orf74Q86VG3 221 aa17.18■□□□□ 0.34
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NISCH-213ENST00000489895 MDM4O15151 490 aa17.18■□□□□ 0.34
NISCH-213ENST00000489895 INPP4BO15327 924 aa17.18■□□□□ 0.34
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NISCH-213ENST00000489895 IZUMO2Q6UXV1 221 aa17.18■□□□□ 0.34
NISCH-213ENST00000489895 CXorf40BQ96DE9 158 aa17.18■□□□□ 0.34
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NISCH-213ENST00000489895 WARSP23381 471 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
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NISCH-213ENST00000489895 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
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NISCH-213ENST00000489895 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa17.17■□□□□ 0.34
NISCH-213ENST00000489895 USE1Q9NZ43 259 aa17.17■□□□□ 0.34
NISCH-213ENST00000489895 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
NISCH-213ENST00000489895 BUD23O43709 281 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
NISCH-213ENST00000489895 SLC5A3P53794 718 aa17.17■□□□□ 0.34
NISCH-213ENST00000489895 GPR158Q5T848 1215 aa17.17■□□□□ 0.34
NISCH-213ENST00000489895 HGSNATQ68CP4 663 aa17.17■□□□□ 0.34
NISCH-213ENST00000489895 FUT10Q6P4F1 479 aa17.17■□□□□ 0.34
NISCH-213ENST00000489895 ZNF621Q6ZSS3 439 aa17.17■□□□□ 0.34
NISCH-213ENST00000489895 MAB21L3Q8N8X9 362 aa17.17■□□□□ 0.34
NISCH-213ENST00000489895 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP17.17■□□□□ 0.34
NISCH-213ENST00000489895 FZD8Q9H461 694 aa17.17■□□□□ 0.34
NISCH-213ENST00000489895 CFAP97Q9P2B7 532 aa17.17■□□□□ 0.34
NISCH-213ENST00000489895 SLC28A1O00337 649 aa17.17■□□□□ 0.34
NISCH-213ENST00000489895 LGR5O75473 907 aa17.17■□□□□ 0.34
NISCH-213ENST00000489895 KCNH1O95259 989 aa17.17■□□□□ 0.34
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