RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489475.5

HOXB3-210, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,845 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-210ENST00000489475 SLC20A2Q08357 652 aa27.12■■□□□ 1.93
HOXB3-210ENST00000489475 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP27.12■■□□□ 1.93
HOXB3-210ENST00000489475 POU6F1Q14863 301 aa27.12■■□□□ 1.93
HOXB3-210ENST00000489475 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
HOXB3-210ENST00000489475 LRRC6Q86X45 466 aa27.12■■□□□ 1.93
HOXB3-210ENST00000489475 TTC17Q96AE7 1141 aa27.12■■□□□ 1.93
HOXB3-210ENST00000489475 DHRS4Q9BTZ2 278 aa27.12■■□□□ 1.93
HOXB3-210ENST00000489475 SLC2A11Q9BYW1 496 aa27.12■■□□□ 1.93
HOXB3-210ENST00000489475 TRPV4Q9HBA0 871 aa27.12■■□□□ 1.93
HOXB3-210ENST00000489475 OBP2AQ9NY56 170 aa27.12■■□□□ 1.93
HOXB3-210ENST00000489475 GGA2Q9UJY4 613 aa27.12■■□□□ 1.93
HOXB3-210ENST00000489475 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
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HOXB3-210ENST00000489475 DHCR24Q15392 516 aa27.11■■□□□ 1.93
HOXB3-210ENST00000489475 CES3Q6UWW8 571 aa27.11■■□□□ 1.93
HOXB3-210ENST00000489475 RNF135Q8IUD6 432 aa27.11■■□□□ 1.93
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HOXB3-210ENST00000489475 CLEC1BQ9P126 229 aa27.11■■□□□ 1.93
HOXB3-210ENST00000489475 LHX3Q9UBR4 397 aa27.11■■□□□ 1.93
HOXB3-210ENST00000489475 FAM159BA6NKW6 160 aa27.11■■□□□ 1.93
HOXB3-210ENST00000489475 ADH1CP00326 375 aa27.11■■□□□ 1.93
HOXB3-210ENST00000489475 INHBAP08476 426 aa27.11■■□□□ 1.93
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HOXB3-210ENST00000489475 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa27.11■■□□□ 1.93
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HOXB3-210ENST00000489475 CYP4X1Q8N118 509 aa27.11■■□□□ 1.93
HOXB3-210ENST00000489475 PPM1NQ8N819 430 aa27.11■■□□□ 1.93
HOXB3-210ENST00000489475 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP27.11■■□□□ 1.93
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HOXB3-210ENST00000489475 SLC44A1Q8WWI5 657 aa27.11■■□□□ 1.93
HOXB3-210ENST00000489475 MIA3Q5JRA6 1907 aa27.1■■□□□ 1.93
HOXB3-210ENST00000489475 HEPACAM2A8MVW5 462 aa27.1■■□□□ 1.93
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HOXB3-210ENST00000489475 NR1H3Q13133 447 aa27.1■■□□□ 1.93
HOXB3-210ENST00000489475 FUT11Q495W5 492 aa27.1■■□□□ 1.93
HOXB3-210ENST00000489475 SIRPB2Q5JXA9 342 aa27.1■■□□□ 1.93
HOXB3-210ENST00000489475 ARMC3Q5W041 872 aa27.1■■□□□ 1.93
HOXB3-210ENST00000489475 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
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HOXB3-210ENST00000489475 EP400NLQ6ZTU2 488 aa27.1■■□□□ 1.93
HOXB3-210ENST00000489475 TAOK1Q7L7X3 1001 aa27.1■■□□□ 1.93
HOXB3-210ENST00000489475 DCAKDQ8WVC6 231 aa27.1■■□□□ 1.93
HOXB3-210ENST00000489475 CDKL2Q92772 493 aa27.1■■□□□ 1.93
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HOXB3-210ENST00000489475 K7ERQ8 282 aa27.09■■□□□ 1.93
HOXB3-210ENST00000489475 CYP17A1P05093 508 aa27.09■■□□□ 1.93
HOXB3-210ENST00000489475 ADH5P11766 374 aa27.09■■□□□ 1.93
HOXB3-210ENST00000489475 DMC1Q14565 340 aa27.09■■□□□ 1.93
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HOXB3-210ENST00000489475 SLC26A11Q86WA9 606 aa27.09■■□□□ 1.93
HOXB3-210ENST00000489475 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa27.09■■□□□ 1.93
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HOXB3-210ENST00000489475 FGF1P05230 155 aa27.09■■□□□ 1.93
HOXB3-210ENST00000489475 ADRA1DP25100 572 aa27.09■■□□□ 1.93
HOXB3-210ENST00000489475 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
HOXB3-210ENST00000489475 RALGPS1Q5JS13 557 aa27.09■■□□□ 1.93
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HOXB3-210ENST00000489475 S1PR5Q9H228 398 aa27.09■■□□□ 1.93
HOXB3-210ENST00000489475 ZFP14Q9HCL3 533 aa27.09■■□□□ 1.93
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HOXB3-210ENST00000489475 TCAF1Q9Y4C2 921 aa27.09■■□□□ 1.93
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HOXB3-210ENST00000489475 ZNF449Q6P9G9 518 aa27.08■■□□□ 1.93
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HOXB3-210ENST00000489475 EXOC3L1Q86VI1 746 aa27.08■■□□□ 1.93
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HOXB3-210ENST00000489475 SLC25A13Q9UJS0 675 aa27.08■■□□□ 1.93
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HOXB3-210ENST00000489475 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 TBX10O75333 385 aa27.07■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 NDST3O95803 873 aa27.07■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 PPP2R2AP63151 447 aa27.07■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 MGAT5Q09328 741 aa27.07■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 SEPT6Q14141 434 aa27.07■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 ATP2A3Q93084 1043 aa27.07■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 E2F7Q96AV8 911 aa27.07■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 HEATR9A2RTY3 570 aa27.06■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 FCARP24071 287 aa27.06■■□□□ 1.92
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