RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482056.2

C9orf3-218, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene C9orf3, Length 1,951 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-218ENST00000482056 BTBD8Q5XKL5 378 aa15.53■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 FAM171BQ6P995 826 aa15.53■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa15.53■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa15.53■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 LSMEM2Q8N112 164 aa15.53■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 CEP70Q8NHQ1 597 aa15.53■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 PIDD1Q9HB75 910 aa15.53■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 CLIC5Q9NZA1 410 aa15.53■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 UTRNP46939 3433 aa15.53■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 IQCA1LA6NCM1 817 aa15.53■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 CFLARO15519 480 aa15.53■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 MAFKO60675 156 aa15.53■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 PAX3P23760 479 aa15.53■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 ADRA1AP35348 466 aa15.53■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 SLC1A2P43004 574 aa15.53■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 SCNN1GP51170 649 aa15.53■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 THOP1P52888 689 aa15.53■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 FOLH1Q04609 750 aa15.53■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 SEPT6Q14141 434 aa15.53■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 UPP1Q16831 310 aa15.53■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 SH2D4BQ5SQS7 431 aa15.53■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 ZNF470Q6ECI4 717 aa15.53■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 DENND5AQ6IQ26 1287 aa15.53■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 KLC3Q6P597 504 aa15.53■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 CEP97Q8IW35 865 aa15.53■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 TSPAN17Q96FV3 270 aa15.53■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 GPR78Q96P69 363 aa15.53■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 POMKQ9H5K3 350 aa15.53■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP15.53■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 EPS15L1Q9UBC2 864 aa15.53■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 CLEC11AQ9Y240 323 aa15.53■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 ARHGEF37A1IGU5 675 aa15.52■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 PMPCBO75439 489 aa15.52■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 PAGE1O75459 146 aa15.52■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 CPB1P15086 417 aa15.52■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 HSPA13P48723 471 aa15.52■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 FKBP1BP68106 108 aa15.52■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 DLG1Q12959 904 aa15.52■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 CNGA3Q16281 694 aa15.52■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 AGAP9Q5VTM2 703 aa15.52■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 THEM5Q8N1Q8 247 aa15.52■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 LPPQ93052 612 aa15.52■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 DCUN1D1Q96GG9 259 aa15.52■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 SLC39A8Q9C0K1 460 aa15.52■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 TRPV6Q9H1D0 765 aa15.52■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 ACSS2Q9NR19 701 aa15.52■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 MIOSQ9NXC5 875 aa15.52■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 GTSE1Q9NYZ3 720 aa15.52■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 NDUFA13Q9P0J0 144 aa15.52■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 FBXO5Q9UKT4 447 aa15.52■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 NEU3Q9UQ49 428 aa15.52■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 HEATR9A2RTY3 570 aa15.51■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 KPNA6O60684 536 aa15.51■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 CYP11A1P05108 521 aa15.51■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 CLCN2P51788 898 aa15.51■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 PURAQ00577 322 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 TSPY1Q01534 308 aa15.51■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 ADGRE1Q14246 886 aa15.51■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 ZNF460Q14592 562 aa15.51■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 PSMD5Q16401 504 aa15.51■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 NEPROQ6NW34 567 aa15.51■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 TRIM67Q6ZTA4 783 aa15.51■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 KDM1BQ8NB78 822 aa15.51■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 ADCY4Q8NFM4 1077 aa15.51■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 MOCOSQ96EN8 888 aa15.51■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 RTP3Q9BQQ7 232 aa15.51■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 SPATA16Q9BXB7 569 aa15.51■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 FTHL17Q9BXU8 183 aa15.51■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 SMOC2Q9H3U7 446 aa15.51■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 TREX1Q9NSU2 369 aa15.51■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 FLRT1Q9NZU1 646 aa15.51■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 FNIP2Q9P278 1114 aa15.51■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 RAB26Q9ULW5 256 aa15.51■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 GPR182O15218 404 aa15.51■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 DENRO43583 198 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 AP1G1O43747 822 aa15.51■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 HLA-DQB2P05538 268 aa15.51■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 ARNTP27540 789 aa15.51■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 CLCN5P51795 746 aa15.51■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 TAS2R39P59534 338 aa15.51■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 MANEALQ5VSG8 457 aa15.51■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 TMEM198Q66K66 360 aa15.51■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 HEXDCQ8WVB3 486 aa15.51■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 VCX3AQ9NNX9 186 aa15.51■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa15.51■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.9 ms