RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 NEK5Q6P3R8 708 aa21.23■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 FBXL19Q6PCT2 694 aa21.23■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 SLC6A18Q96N87 628 aa21.23■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 SALL4Q9UJQ4 1053 aa21.23■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 FADS3Q9Y5Q0 445 aa21.23■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 ALG6Q9Y672 507 aa21.23■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 DNAH14Q0VDD8 3507 aa21.22■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 KNL1Q8NG31 2342 aa21.22■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 A0A1W2PQU0 124 aa21.22■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 LRRD1A4D1F6 860 aa21.22■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 MUSKO15146 869 aa21.22■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 MFSD11O43934 449 aa21.22■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP21.22■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 ABL2P42684 1182 aa21.22■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP21.22■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 SLC10A7Q0GE19 358 aa21.22■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 LBRQ14739 615 aaKnown RBP21.22■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa21.22■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 TMCO4Q5TGY1 634 aa21.22■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 LAYNQ6UX15 382 aa21.22■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP21.22■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 RHOT1Q8IXI2 618 aa21.22■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 MINDY1Q8N5J2 469 aa21.22■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 ACRBPQ8NEB7 543 aa21.22■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 RNF157Q96PX1 679 aa21.22■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 PSKH2Q96QS6 385 aa21.22■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP21.22■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa21.22■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa21.21■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 AP1G1O43747 822 aa21.21■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 PIGNO95427 931 aa21.21■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 WNT1P04628 370 aa21.21■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP21.21■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 TEAD4Q15561 434 aa21.21■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 KIF19Q2TAC6 998 aa21.21■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 UAP1L1Q3KQV9 507 aa21.21■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 SRLQ86TD4 932 aa21.21■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 HORMAD1Q86X24 394 aa21.21■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 VSIG1Q86XK7 387 aa21.21■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 LRRC49Q8IUZ0 686 aa21.21■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 ATPAF2Q8N5M1 289 aa21.21■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 RAB7BQ96AH8 199 aa21.21■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 SERAC1Q96JX3 654 aa21.21■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 GOLPH3Q9H4A6 298 aa21.21■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 DKK3Q9UBP4 350 aa21.21■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 SEPT3Q9UH03 358 aa21.21■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP21.21■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa21.21■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 DUSP10Q9Y6W6 482 aa21.21■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 DCHS1Q96JQ0 3298 aa21.21■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 A0A1W2PR77 199 aa21.2■□□□□ 0.98
ACTB-211ENST00000480301 ZNF487B1APH4 448 aa21.2■□□□□ 0.98
ACTB-211ENST00000480301 SPINT1O43278 529 aa21.2■□□□□ 0.98
ACTB-211ENST00000480301 SPOPO43791 374 aa21.2■□□□□ 0.98
ACTB-211ENST00000480301 GJB3O75712 270 aa21.2■□□□□ 0.98
ACTB-211ENST00000480301 PCDH8O95206 1070 aa21.2■□□□□ 0.98
ACTB-211ENST00000480301 TNNT1P13805 278 aa21.2■□□□□ 0.98
ACTB-211ENST00000480301 TIMP2P16035 220 aa21.2■□□□□ 0.98
ACTB-211ENST00000480301 NUDT1P36639 197 aa21.2■□□□□ 0.98
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ACTB-211ENST00000480301 ZNF284Q2VY69 593 aa21.2■□□□□ 0.98
ACTB-211ENST00000480301 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa21.2■□□□□ 0.98
ACTB-211ENST00000480301 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa21.2■□□□□ 0.98
ACTB-211ENST00000480301 KLK6Q92876 244 aa21.2■□□□□ 0.98
ACTB-211ENST00000480301 NSMCE3Q96MG7 304 aa21.2■□□□□ 0.98
ACTB-211ENST00000480301 LACRTQ9GZZ8 138 aa21.2■□□□□ 0.98
ACTB-211ENST00000480301 SUV39H2Q9H5I1 410 aa21.2■□□□□ 0.98
ACTB-211ENST00000480301 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa21.2■□□□□ 0.98
ACTB-211ENST00000480301 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP21.2■□□□□ 0.98
ACTB-211ENST00000480301 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP21.2■□□□□ 0.98
ACTB-211ENST00000480301 DMTF1Q9Y222 760 aa21.2■□□□□ 0.98
ACTB-211ENST00000480301 SNX11Q9Y5W9 270 aa21.2■□□□□ 0.98
ACTB-211ENST00000480301 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP21.19■□□□□ 0.98
ACTB-211ENST00000480301 AREL1O15033 823 aa21.19■□□□□ 0.98
ACTB-211ENST00000480301 VILLO15195 856 aa21.19■□□□□ 0.98
ACTB-211ENST00000480301 PJA2O43164 708 aa21.19■□□□□ 0.98
ACTB-211ENST00000480301 OPHN1O60890 802 aa21.19■□□□□ 0.98
ACTB-211ENST00000480301 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP21.19■□□□□ 0.98
ACTB-211ENST00000480301 KRT1P04264 644 aa21.19■□□□□ 0.98
ACTB-211ENST00000480301 CD38P28907 300 aa21.19■□□□□ 0.98
ACTB-211ENST00000480301 GARSP41250 739 aaKnown RBP21.19■□□□□ 0.98
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ACTB-211ENST00000480301 GBE1Q04446 702 aa21.19■□□□□ 0.98
ACTB-211ENST00000480301 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
ACTB-211ENST00000480301 GRM3Q14832 879 aa21.19■□□□□ 0.98
ACTB-211ENST00000480301 HLA-BQ31612 363 aa21.19■□□□□ 0.98
ACTB-211ENST00000480301 TMEM259Q4ZIN3 620 aa21.19■□□□□ 0.98
ACTB-211ENST00000480301 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
ACTB-211ENST00000480301 SEL1L3Q68CR1 1132 aa21.19■□□□□ 0.98
ACTB-211ENST00000480301 C11orf63Q6NUN7 778 aa21.19■□□□□ 0.98
ACTB-211ENST00000480301 IL27RAQ6UWB1 636 aa21.19■□□□□ 0.98
ACTB-211ENST00000480301 TTC7BQ86TV6 843 aa21.19■□□□□ 0.98
ACTB-211ENST00000480301 CAMK1DQ8IU85 385 aa21.19■□□□□ 0.98
ACTB-211ENST00000480301 PGBD5Q8N414 524 aa21.19■□□□□ 0.98
ACTB-211ENST00000480301 PLD5Q8N7P1 536 aa21.19■□□□□ 0.98
ACTB-211ENST00000480301 TPCN2Q8NHX9 752 aa21.19■□□□□ 0.98
ACTB-211ENST00000480301 HCAR2Q8TDS4 363 aa21.19■□□□□ 0.98
ACTB-211ENST00000480301 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
ACTB-211ENST00000480301 FEM1CQ96JP0 617 aa21.19■□□□□ 0.98
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