RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479003.5

CHKB-208, Transcript of choline kinase beta, human

TSL 2

Gene CHKB, Length 2,114 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHKB-208	ENST00000479003	RHOJ	Q9H4E5	214 aa		27.85	■■■□□ 2.05
CHKB-208	ENST00000479003	OXSM	Q9NWU1	459 aa		27.85	■■■□□ 2.05
CHKB-208	ENST00000479003	PRKAG2	Q9UGJ0	569 aa		27.85	■■■□□ 2.05
CHKB-208	ENST00000479003	SLC39A10	Q9ULF5	831 aa		27.85	■■■□□ 2.05
CHKB-208	ENST00000479003	MTMR11	A4FU01	709 aa		27.85	■■■□□ 2.05
CHKB-208	ENST00000479003		H7C4K7	107 aa		27.85	■■■□□ 2.05
CHKB-208	ENST00000479003	ADAM12	O43184	909 aa		27.85	■■■□□ 2.05
CHKB-208	ENST00000479003	SOAT2	O75908	522 aa		27.85	■■■□□ 2.05
CHKB-208	ENST00000479003	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		27.85	■■■□□ 2.05
CHKB-208	ENST00000479003	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	27.85	■■■□□ 2.05
CHKB-208	ENST00000479003	AP2B1	P63010	937 aa		27.85	■■■□□ 2.05
CHKB-208	ENST00000479003	USP4	Q13107	963 aa		27.85	■■■□□ 2.05
CHKB-208	ENST00000479003	GPR17	Q13304	367 aa		27.85	■■■□□ 2.05
CHKB-208	ENST00000479003	TMCO4	Q5TGY1	634 aa		27.85	■■■□□ 2.05
CHKB-208	ENST00000479003	RWDD4	Q6NW29	188 aa	Known RBP	27.85	■■■□□ 2.05
CHKB-208	ENST00000479003	ARHGAP36	Q6ZRI8	547 aa		27.85	■■■□□ 2.05
CHKB-208	ENST00000479003	ARHGAP12	Q8IWW6	846 aa		27.85	■■■□□ 2.05
CHKB-208	ENST00000479003	ZNF558	Q96NG5	402 aa		27.85	■■■□□ 2.05
CHKB-208	ENST00000479003	YME1L1	Q96TA2	773 aa		27.85	■■■□□ 2.05
CHKB-208	ENST00000479003	C1QTNF1	Q9BXJ1	281 aa		27.85	■■■□□ 2.05
CHKB-208	ENST00000479003	GOLGA8T	H3BQL2	631 aa		27.84	■■■□□ 2.05
CHKB-208	ENST00000479003	MAP3K7	O43318	606 aa		27.84	■■■□□ 2.05
CHKB-208	ENST00000479003	PRDX6	P30041	224 aa		27.84	■■■□□ 2.05
CHKB-208	ENST00000479003	PCID2	Q5JVF3	399 aa		27.84	■■■□□ 2.05
CHKB-208	ENST00000479003	CMTR2	Q8IYT2	770 aa	Known RBP	27.84	■■■□□ 2.05
CHKB-208	ENST00000479003	SLC39A11	Q8N1S5	342 aa		27.84	■■■□□ 2.05
CHKB-208	ENST00000479003	FCRL5	Q96RD9	977 aa		27.84	■■■□□ 2.05
CHKB-208	ENST00000479003	HAPLN3	Q96S86	360 aa		27.84	■■■□□ 2.05
CHKB-208	ENST00000479003	TBL1Y	Q9BQ87	522 aa		27.84	■■■□□ 2.05
CHKB-208	ENST00000479003	GATA5	Q9BWX5	397 aa	Predicted RBP	27.84	■■■□□ 2.05
CHKB-208	ENST00000479003	SLC27A5	Q9Y2P5	690 aa		27.84	■■■□□ 2.05
CHKB-208	ENST00000479003	DFFA	O00273	331 aa		27.83	■■■□□ 2.05
CHKB-208	ENST00000479003	IRAK2	O43187	625 aa		27.83	■■■□□ 2.05
CHKB-208	ENST00000479003	CCNT2	O60583	730 aa	Known RBP	27.83	■■■□□ 2.05
CHKB-208	ENST00000479003	NCF2	P19878	526 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.05
CHKB-208	ENST00000479003	HOXC13	P31276	330 aa		27.83	■■■□□ 2.05
CHKB-208	ENST00000479003	PGF	P49763	221 aa		27.83	■■■□□ 2.05
CHKB-208	ENST00000479003	KLC1	Q07866	573 aa		27.83	■■■□□ 2.05
CHKB-208	ENST00000479003	CFAP157	Q5JU67	520 aa		27.83	■■■□□ 2.05
CHKB-208	ENST00000479003	BRMS1L	Q5PSV4	323 aa		27.83	■■■□□ 2.05
CHKB-208	ENST00000479003	LCA5	Q86VQ0	697 aa		27.83	■■■□□ 2.05
CHKB-208	ENST00000479003	GPR152	Q8TDT2	470 aa		27.83	■■■□□ 2.05
CHKB-208	ENST00000479003	FKBP6	O75344	327 aa		27.83	■■■□□ 2.05
CHKB-208	ENST00000479003	HTR7	P34969	479 aa		27.83	■■■□□ 2.05
CHKB-208	ENST00000479003	BTK	Q06187	659 aa		27.83	■■■□□ 2.05
CHKB-208	ENST00000479003	FSCB	Q5H9T9	825 aa		27.83	■■■□□ 2.05
CHKB-208	ENST00000479003	METTL21C	Q5VZV1	264 aa		27.83	■■■□□ 2.05
CHKB-208	ENST00000479003	IRGC	Q6NXR0	463 aa		27.83	■■■□□ 2.05
CHKB-208	ENST00000479003	PKN3	Q6P5Z2	889 aa		27.83	■■■□□ 2.05
CHKB-208	ENST00000479003	ZYG11A	Q6WRX3	759 aa		27.83	■■■□□ 2.05
CHKB-208	ENST00000479003	ATPAF2	Q8N5M1	289 aa		27.83	■■■□□ 2.05
CHKB-208	ENST00000479003	TDRD5	Q8NAT2	981 aa	Known RBP	27.83	■■■□□ 2.05
CHKB-208	ENST00000479003	FBXO22	Q8NEZ5	403 aa		27.83	■■■□□ 2.05
CHKB-208	ENST00000479003	SPATA22	Q8NHS9	363 aa		27.83	■■■□□ 2.05
CHKB-208	ENST00000479003	IL12RB2	Q99665	862 aa		27.83	■■■□□ 2.05
CHKB-208	ENST00000479003	SIK2	Q9H0K1	926 aa		27.83	■■■□□ 2.05
CHKB-208	ENST00000479003	TLK1	Q9UKI8	766 aa		27.83	■■■□□ 2.05
CHKB-208	ENST00000479003	PDHA1	P08559	390 aa		27.82	■■■□□ 2.04
CHKB-208	ENST00000479003	MAGEA11	P43364	429 aa		27.82	■■■□□ 2.04
CHKB-208	ENST00000479003	IRX1	P78414	480 aa	Predicted RBP	27.82	■■■□□ 2.04
CHKB-208	ENST00000479003	FPGS	Q05932	587 aa		27.82	■■■□□ 2.04
CHKB-208	ENST00000479003	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	27.82	■■■□□ 2.04	9e-8	■■□□□ 12.8
CHKB-208	ENST00000479003	SLC9B1	Q4ZJI4	515 aa		27.82	■■■□□ 2.04
CHKB-208	ENST00000479003	PGM2L1	Q6PCE3	622 aa		27.82	■■■□□ 2.04
CHKB-208	ENST00000479003	CNTN4	Q8IWV2	1026 aa		27.82	■■■□□ 2.04
CHKB-208	ENST00000479003	TMEM151A	Q8N4L1	468 aa		27.82	■■■□□ 2.04
CHKB-208	ENST00000479003	C8orf48	Q96LL4	319 aa		27.82	■■■□□ 2.04
CHKB-208	ENST00000479003	ACE2	Q9BYF1	805 aa	Predicted RBP	27.82	■■■□□ 2.04
CHKB-208	ENST00000479003	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	27.82	■■■□□ 2.04
CHKB-208	ENST00000479003	MTRR	Q9UBK8	725 aa		27.82	■■■□□ 2.04
CHKB-208	ENST00000479003	MYO16	Q9Y6X6	1858 aa		27.82	■■■□□ 2.04
CHKB-208	ENST00000479003	MYLK	Q15746	1914 aa		27.82	■■■□□ 2.04
CHKB-208	ENST00000479003	PRKAA2	P54646	552 aa		27.82	■■■□□ 2.04
CHKB-208	ENST00000479003	PSMD5	Q16401	504 aa		27.82	■■■□□ 2.04
CHKB-208	ENST00000479003	RALGPS1	Q5JS13	557 aa		27.82	■■■□□ 2.04
CHKB-208	ENST00000479003	CAPRIN2	Q6IMN6	1127 aa	Known RBP	27.82	■■■□□ 2.04
CHKB-208	ENST00000479003	AAGAB	Q6PD74	315 aa		27.82	■■■□□ 2.04
CHKB-208	ENST00000479003	RAPH1	Q70E73	1250 aa		27.82	■■■□□ 2.04
CHKB-208	ENST00000479003	C7orf61	Q8IZ16	206 aa		27.82	■■■□□ 2.04
CHKB-208	ENST00000479003	LZTR1	Q8N653	840 aa		27.82	■■■□□ 2.04
CHKB-208	ENST00000479003	ACTRT2	Q8TDY3	377 aa		27.82	■■■□□ 2.04
CHKB-208	ENST00000479003	TMEM169	Q96HH4	297 aa		27.82	■■■□□ 2.04
CHKB-208	ENST00000479003	TASP1	Q9H6P5	420 aa		27.82	■■■□□ 2.04
CHKB-208	ENST00000479003	GLOD4	Q9HC38	313 aa		27.82	■■■□□ 2.04
CHKB-208	ENST00000479003	CPSF2	Q9P2I0	782 aa	Known RBP	27.82	■■■□□ 2.04
CHKB-208	ENST00000479003	FGF10	O15520	208 aa	Predicted RBP	27.81	■■■□□ 2.04
CHKB-208	ENST00000479003	ANXA9	O76027	345 aa		27.81	■■■□□ 2.04
CHKB-208	ENST00000479003	FGB	P02675	491 aa		27.81	■■■□□ 2.04
CHKB-208	ENST00000479003	DNAJB1	P25685	340 aa		27.81	■■■□□ 2.04
CHKB-208	ENST00000479003	NUMB	P49757	651 aa		27.81	■■■□□ 2.04
CHKB-208	ENST00000479003	MANEAL	Q5VSG8	457 aa		27.81	■■■□□ 2.04
CHKB-208	ENST00000479003	CCDC117	Q8IWD4	279 aa	Predicted RBP	27.81	■■■□□ 2.04
CHKB-208	ENST00000479003	PHTF2	Q8N3S3	785 aa		27.81	■■■□□ 2.04
CHKB-208	ENST00000479003	MAPK15	Q8TD08	544 aa		27.81	■■■□□ 2.04
CHKB-208	ENST00000479003	ABCC13	Q9NSE7	274 aa		27.81	■■■□□ 2.04
CHKB-208	ENST00000479003	KIAA1671	Q9BY89	1806 aa		27.8	■■■□□ 2.04
CHKB-208	ENST00000479003	MAFK	O60675	156 aa		27.8	■■■□□ 2.04
CHKB-208	ENST00000479003	SOD2	P04179	222 aa		27.8	■■■□□ 2.04
CHKB-208	ENST00000479003	SBK3	P0C264	359 aa		27.8	■■■□□ 2.04
CHKB-208	ENST00000479003	LAG3	P18627	525 aa		27.8	■■■□□ 2.04

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