RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466245.1

TTLL3-223, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 3

Gene TTLL3, Length 616 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-223	ENST00000466245	AKR1B10	O60218	316 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-223	ENST00000466245	PRPSAP2	O60256	369 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-223	ENST00000466245	RAMP2	O60895	175 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-223	ENST00000466245	C6	P13671	934 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-223	ENST00000466245	CKMT2	P17540	419 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-223	ENST00000466245	C5AR1	P21730	350 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-223	ENST00000466245	CD38	P28907	300 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-223	ENST00000466245	EPHA8	P29322	1005 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-223	ENST00000466245	EPHB2	P29323	1055 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-223	ENST00000466245	MAN1A1	P33908	653 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-223	ENST00000466245	CTSO	P43234	321 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-223	ENST00000466245	SERPINH1	P50454	418 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-223	ENST00000466245	ZNF75D	P51815	510 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-223	ENST00000466245	NDST2	P52849	883 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-223	ENST00000466245	HADHB	P55084	474 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-223	ENST00000466245	INO80D	Q53TQ3	878 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-223	ENST00000466245	SCYL2	Q6P3W7	929 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-223	ENST00000466245	TFAP2D	Q7Z6R9	452 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-223	ENST00000466245	RHOT2	Q8IXI1	618 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-223	ENST00000466245	CCDC170	Q8IYT3	715 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-223	ENST00000466245	FAM181A	Q8N9Y4	354 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-223	ENST00000466245	ARHGEF2	Q92974	986 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-223	ENST00000466245	CCDC42	Q96M95	316 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-223	ENST00000466245	SLC6A18	Q96N87	628 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-223	ENST00000466245	PANX2	Q96RD6	677 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-223	ENST00000466245	FAM129B	Q96TA1	746 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-223	ENST00000466245	SNRNP25	Q9BV90	132 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-223	ENST00000466245	NUP85	Q9BW27	656 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-223	ENST00000466245	PABPC3	Q9H361	631 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-223	ENST00000466245	KDM4C	Q9H3R0	1056 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-223	ENST00000466245	DEF6	Q9H4E7	631 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-223	ENST00000466245	NHEJ1	Q9H9Q4	299 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-223	ENST00000466245	SNX10	Q9Y5X0	201 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-223	ENST00000466245	FAM170A	A1A519	330 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-223	ENST00000466245	TTC34	A8MYJ7	566 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-223	ENST00000466245	ZNF487	B1APH4	448 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-223	ENST00000466245		B8ZZF3	427 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-223	ENST00000466245	SLC28A2	O43868	658 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-223	ENST00000466245	PROSC	O94903	275 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-223	ENST00000466245	CDC25B	P30305	580 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-223	ENST00000466245	ARHGAP25	P42331	645 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-223	ENST00000466245	STK19	P49842	368 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-223	ENST00000466245	ADK	P55263	362 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-223	ENST00000466245	TPI1	P60174	286 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-223	ENST00000466245	ARF5	P84085	180 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-223	ENST00000466245	DAB2	P98082	770 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-223	ENST00000466245	SLC25A11	Q02978	314 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-223	ENST00000466245	DLG2	Q15700	870 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-223	ENST00000466245	CST6	Q15828	149 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-223	ENST00000466245	FAM46C	Q5VWP2	391 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-223	ENST00000466245	AFMID	Q63HM1	303 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-223	ENST00000466245	RWDD4	Q6NW29	188 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-223	ENST00000466245	POLN	Q7Z5Q5	900 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-223	ENST00000466245	VSIG1	Q86XK7	387 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-223	ENST00000466245	LZTR1	Q8N653	840 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-223	ENST00000466245	PCDH20	Q8N6Y1	951 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-223	ENST00000466245	TMIE	Q8NEW7	156 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-223	ENST00000466245	OR2T34	Q8NGX1	318 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-223	ENST00000466245	ZNF564	Q8TBZ8	553 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-223	ENST00000466245	SAP25	Q8TEE9	199 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-223	ENST00000466245	KCNE4	Q8WWG9	221 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-223	ENST00000466245	RFFL	Q8WZ73	363 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-223	ENST00000466245	OR8D1	Q8WZ84	308 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-223	ENST00000466245	CALR3	Q96L12	384 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-223	ENST00000466245	RPL10L	Q96L21	214 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-223	ENST00000466245	PEBP4	Q96S96	227 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-223	ENST00000466245	CHP1	Q99653	195 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-223	ENST00000466245	OMD	Q99983	421 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-223	ENST00000466245	TRIM7	Q9C029	511 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-223	ENST00000466245	NOL6	Q9H6R4	1146 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-223	ENST00000466245	ERVMER34-1	Q9H9K5	563 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-223	ENST00000466245	ATP13A1	Q9HD20	1204 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-223	ENST00000466245	LUC7L	Q9NQ29	371 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-223	ENST00000466245	NDFIP2	Q9NV92	336 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-223	ENST00000466245	FBXL12	Q9NXK8	326 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-223	ENST00000466245	ANAPC7	Q9UJX3	599 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-223	ENST00000466245	PPM1H	Q9ULR3	514 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-223	ENST00000466245	HEMK1	Q9Y5R4	338 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-223	ENST00000466245	EEF2K	O00418	725 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-223	ENST00000466245	KDELR3	O43731	214 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-223	ENST00000466245	IGHV4-34	P06331	123 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-223	ENST00000466245	NUDT1	P36639	197 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-223	ENST00000466245	CCDC15	Q0P6D6	951 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-223	ENST00000466245	POLD3	Q15054	466 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-223	ENST00000466245	HADH	Q16836	314 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-223	ENST00000466245	KCNT1	Q5JUK3	1230 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-223	ENST00000466245	ARHGAP40	Q5TG30	622 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-223	ENST00000466245	TMCO4	Q5TGY1	634 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-223	ENST00000466245	C22orf39	Q6P5X5	142 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-223	ENST00000466245	KDM7A	Q6ZMT4	941 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-223	ENST00000466245	RFX8	Q6ZV50	586 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-223	ENST00000466245	ZSCAN30	Q86W11	494 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-223	ENST00000466245	PYROXD2	Q8N2H3	581 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-223	ENST00000466245	ZNF366	Q8N895	744 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-223	ENST00000466245	ATP11C	Q8NB49	1132 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-223	ENST00000466245	OR7D4	Q8NG98	312 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-223	ENST00000466245	OR2A12	Q8NGT7	310 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-223	ENST00000466245	TSC1	Q92574	1164 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-223	ENST00000466245	ARHGEF26	Q96DR7	871 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-223	ENST00000466245	CCDC97	Q96F63	343 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77

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