RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466048.6

USP54-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 54, humanhuman

TSL 5

Gene USP54, Length 4,674 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP54-210ENST00000466048 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
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USP54-210ENST00000466048 HTR3CQ8WXA8 447 aa7.75□□□□□ -1.17
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USP54-210ENST00000466048 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa7.75□□□□□ -1.17
USP54-210ENST00000466048 SFXN1Q9H9B4 322 aa7.75□□□□□ -1.17
USP54-210ENST00000466048 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa7.75□□□□□ -1.17
USP54-210ENST00000466048 ETNK2Q9NVF9 386 aa7.75□□□□□ -1.17
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USP54-210ENST00000466048 SPATA13Q96N96 652 aa7.75□□□□□ -1.17
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USP54-210ENST00000466048 ADRA1BP35368 520 aa7.75□□□□□ -1.17
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USP54-210ENST00000466048 CNTFP26441 200 aa7.74□□□□□ -1.17
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USP54-210ENST00000466048 C21orf59P57076 290 aa7.74□□□□□ -1.17
USP54-210ENST00000466048 XIAPP98170 497 aa7.74□□□□□ -1.17
USP54-210ENST00000466048 GPR17Q13304 367 aa7.74□□□□□ -1.17
USP54-210ENST00000466048 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
USP54-210ENST00000466048 PARP6Q2NL67 630 aa7.74□□□□□ -1.17
USP54-210ENST00000466048 ZNF284Q2VY69 593 aa7.74□□□□□ -1.17
USP54-210ENST00000466048 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa7.74□□□□□ -1.17
USP54-210ENST00000466048 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa7.74□□□□□ -1.17
USP54-210ENST00000466048 LPCAT2Q7L5N7 544 aa7.74□□□□□ -1.17
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