RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	GDF9	O60383	454 aa		17.99	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	MAFK	O60675	156 aa		17.99	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	PCDH8	O95206	1070 aa		17.99	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	MAT2A	P31153	395 aa	Known RBP	17.99	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	NEK3	P51956	506 aa		17.99	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	DYNLT1	P63172	113 aa		17.99	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	SLC10A7	Q0GE19	358 aa		17.99	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	LLGL1	Q15334	1064 aa		17.99	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	IFI16	Q16666	785 aa	Known RBP	17.99	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	ZNF805	Q5CZA5	627 aa		17.99	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	CFAP58	Q5T655	872 aa		17.99	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	CCDC50	Q8IVM0	306 aa		17.99	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	BBS5	Q8N3I7	341 aa		17.99	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	CCDC112	Q8NEF3	446 aa		17.99	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	ZNF830	Q96NB3	372 aa	Predicted RBP	17.99	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	ZNF599	Q96NL3	588 aa		17.99	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	HDAC8	Q9BY41	377 aa		17.99	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	KDM4C	Q9H3R0	1056 aa		17.99	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	FSCN3	Q9NQT6	498 aa		17.99	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	TRIM10	Q9UDY6	481 aa		17.99	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	SLC6A14	Q9UN76	642 aa		17.99	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902		A0A1B0GTW7	788 aa		17.98	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	C3orf70	A6NLC5	250 aa	Predicted RBP	17.98	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	C16orf96	A6NNT2	1141 aa		17.98	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	SLC30A4	O14863	429 aa		17.98	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	NRDC	O43847	1150 aa		17.98	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	NEBL	O76041	1014 aa		17.98	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	IGHV4-34	P06331	123 aa		17.98	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	SERPINF2	P08697	491 aa		17.98	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	CD27	P26842	260 aa		17.98	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	GARS	P41250	739 aa	Known RBP	17.98	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	SCNN1B	P51168	640 aa		17.98	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	RENBP	P51606	427 aa		17.98	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	ATXN3	P54252	364 aa	Predicted RBP	17.98	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	TAS2R38	P59533	333 aa		17.98	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	GBE1	Q04446	702 aa		17.98	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	GALNT2	Q10471	571 aa		17.98	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	PEAR1	Q5VY43	1037 aa	Predicted RBP	17.98	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	KAZN	Q674X7	775 aa		17.98	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	SLC23A3	Q6PIS1	610 aa		17.98	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	MFSD7	Q6UXD7	560 aa		17.98	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	PARS2	Q7L3T8	475 aa	Known RBP	17.98	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	SRL	Q86TD4	932 aa		17.98	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	LRRC49	Q8IUZ0	686 aa		17.98	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	CCNY	Q8ND76	341 aa		17.98	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	EDEM2	Q9BV94	578 aa		17.98	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	GTPBP2	Q9BX10	602 aa	Known RBP	17.98	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	PREB	Q9HCU5	417 aa		17.98	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	RXFP3	Q9NSD7	469 aa		17.98	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902		A0A0U1RQJ8	604 aa		17.97	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	MED19	A0JLT2	244 aa	Predicted RBP	17.97	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	LNP1	A1A4G5	178 aa		17.97	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	NEMP1	O14524	444 aa		17.97	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	ARHGAP6	O43182	974 aa		17.97	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	RNGTT	O60942	597 aa	Known RBP	17.97	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	ZRANB2	O95218	330 aa	Known RBP eCLIP	17.97	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	PIGN	O95427	931 aa		17.97	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	ADRB3	P13945	408 aa		17.97	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	ZFX	P17010	805 aa	Predicted RBP	17.97	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	MX2	P20592	715 aa		17.97	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	XPA	P23025	273 aa	Predicted RBP	17.97	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	MAPK8	P45983	427 aa		17.97	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	RGR	P47804	291 aa		17.97	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	MARCKSL1	P49006	195 aa		17.97	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	CCR5	P51681	352 aa		17.97	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	PPP2CB	P62714	309 aa		17.97	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	PPP2CA	P67775	309 aa		17.97	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	ITK	Q08881	620 aa		17.97	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	GRM3	Q14832	879 aa		17.97	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	MARC1	Q5VT66	337 aa		17.97	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	TIGD7	Q6NT04	549 aa	Predicted RBP	17.97	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	ADAT2	Q7Z6V5	191 aa	Known RBP	17.97	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	TTC7B	Q86TV6	843 aa		17.97	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	PRPF39	Q86UA1	669 aa	Known RBP	17.97	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	LRRC8A	Q8IWT6	810 aa		17.97	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	RCOR2	Q8IZ40	523 aa		17.97	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	LRRN4	Q8WUT4	740 aa		17.97	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	ANP32B	Q92688	251 aa	Known RBP	17.97	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	FAM131C	Q96AQ9	280 aa		17.97	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	PSKH2	Q96QS6	385 aa		17.97	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	CPEB1	Q9BZB8	566 aa	Known RBP	17.97	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	ATP13A3	Q9H7F0	1226 aa		17.97	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	SPTBN2	O15020	2390 aa		17.97	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	TP53BP1	Q12888	1972 aa	Predicted RBP	17.97	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	NCOR2	Q9Y618	2525 aa		17.96	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902		A0A1W2PPC4	97 aa		17.96	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902		A0A1W2PQU0	124 aa		17.96	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	TTC24	A2A3L6	582 aa	Predicted RBP	17.96	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	ZNF487	B1APH4	448 aa		17.96	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	MUSK	O15146	869 aa		17.96	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	KRT10	P13645	584 aa		17.96	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	ENG	P17813	658 aa		17.96	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	MMP13	P45452	471 aa		17.96	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	AFF3	P51826	1226 aa	Known RBP	17.96	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	LIMK1	P53667	647 aa		17.96	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	SLC10A2	Q12908	348 aa	Predicted RBP	17.96	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	TEAD4	Q15561	434 aa		17.96	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	LRRC73	Q5JTD7	316 aa		17.96	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	SPOCD1	Q6ZMY3	1216 aa		17.96	■□□□□ 0.47
USP19-210	ENST00000465902	VSIG1	Q86XK7	387 aa		17.96	■□□□□ 0.47

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