RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463041.1

PTPRF-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRF, Length 298 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-210ENST00000463041 NEMP1O14524 444 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 RASA4O43374 803 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 TMCC1O94876 653 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 MYBL1P10243 752 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 PRLRP16471 622 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 CKMT2P17540 419 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 DGKAP23743 735 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 PSMA2P25787 234 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 HCAR3P49019 387 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP7.39□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 E2F1Q01094 437 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 OGDHQ02218 1023 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 GRM3Q14832 879 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 CYTH1Q15438 398 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 KLHL40Q2TBA0 621 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 HS1BP3Q53T59 392 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 SEL1L3Q68CR1 1132 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 GDPD4Q6W3E5 623 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 Q6ZSR6 202 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 SLC25A45Q8N413 288 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 IQCDQ96DY2 449 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 TRIM11Q96F44 468 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 KLHL32Q96NJ5 620 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 ISCUQ9H1K1 167 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 LRRC19Q9H756 370 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 DKK3Q9UBP4 350 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 DKK4Q9UBT3 224 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 CA5BQ9Y2D0 317 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 ACTL7AQ9Y615 435 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 SCINQ9Y6U3 715 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 A0A1W2PQJ5 194 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 POM121BA6NF01 834 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 TRABD2BA6NFA1 517 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 ARHGAP42A6NI28 874 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 A6NNZ2 444 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 TAF4O00268 1085 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 TOR1BO14657 336 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 FPGTO14772 594 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 AREL1O15033 823 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 DAPK3O43293 454 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 PRPSAP2O60256 369 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 RFPL3O75679 317 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 IGSF6O95976 241 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 UGT2B4P06133 528 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 ALPPL2P10696 532 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 SKILP12757 684 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 JUPP14923 745 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 TIMP2P16035 220 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 PTMSP20962 102 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 ACP1P24666 158 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 MIPP30301 263 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 GKP32189 559 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 RABIFP47224 123 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 CSNK1DP48730 415 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 UBASH3AP57075 661 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 CLDN2P57739 230 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 TPI1P60174 286 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 RHOAP61586 193 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 YPEL5P62699 121 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 FANCCQ00597 558 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP7.38□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 CAMK2BQ13554 666 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 FGL2Q14314 439 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 BOLA3Q53S33 107 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 CCDC157Q569K6 752 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 DHRS13Q6UX07 377 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 LEKR1Q6ZMV7 388 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 GCNT7Q6ZNI0 430 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 VPS36Q86VN1 386 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 PROSER1Q86XN7 944 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 DNAAF5Q86Y56 855 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 LZTR1Q8N653 840 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 DENND6BQ8NEG7 585 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 OR13H1Q8NG92 308 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 OR6K2Q8NGY2 324 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 VOPP1Q96AW1 172 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 CENPTQ96BT3 561 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 HMCESQ96FZ2 354 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 CALN1Q9BXU9 219 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 SLC39A8Q9C0K1 460 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 KLC2Q9H0B6 622 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 SUV39H2Q9H5I1 410 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 CBX8Q9HC52 389 aa7.38□□□□□ -1.23
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