RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462125.5

C9orf3-210, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-210ENST00000462125 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 AKT2P31751 481 aa13.41□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 IL9RQ01113 521 aa13.41□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 BNIP3Q12983 259 aa13.41□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 FGL2Q14314 439 aa13.41□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 ST3GAL2Q16842 350 aa13.41□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 INAVAQ3KP66 663 aa13.41□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 BOLA3Q53S33 107 aa13.41□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 SEL1L3Q68CR1 1132 aa13.41□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa13.41□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 GATAD2AQ86YP4 633 aa13.41□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 OR6K2Q8NGY2 324 aa13.41□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 HCAR2Q8TDS4 363 aa13.41□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 CPLX3Q8WVH0 158 aa13.41□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 KLK6Q92876 244 aa13.41□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 BMFQ96LC9 184 aa13.41□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa13.41□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 SLC39A8Q9C0K1 460 aa13.41□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 KLHL11Q9NVR0 708 aa13.41□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 IFNKQ9P0W0 207 aa13.41□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 MYO1AQ9UBC5 1043 aa13.41□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 CA5BQ9Y2D0 317 aa13.41□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 TMEM131Q92545 1883 aa13.41□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 DOCK9Q9BZ29 2069 aa13.4□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 A0A087X0T9 212 aa13.4□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 J3KR12 359 aa13.4□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 PRAMEF11O60813 436 aa13.4□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 GYPCP04921 128 aa13.4□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 FAM228BP0C875 321 aa13.4□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 THEGLP0DJG4 465 aa13.4□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 ERCC2P18074 760 aa13.4□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 ABL2P42684 1182 aa13.4□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 RAD51Q06609 339 aa13.4□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 HS1BP3Q53T59 392 aa13.4□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 GDPD4Q6W3E5 623 aa13.4□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 RFX8Q6ZV50 586 aa13.4□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa13.4□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 VPS36Q86VN1 386 aa13.4□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 ZNF354CQ86Y25 554 aa13.4□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa13.4□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa13.4□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 KLHL32Q96NJ5 620 aa13.4□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP13.4□□□□□ -0.264e-6■■■■□ 23.2
C9orf3-210ENST00000462125 THAP2Q9H0W7 228 aa13.4□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 GPR27Q9NS67 375 aa13.4□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 DKK3Q9UBP4 350 aa13.4□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 LHX3Q9UBR4 397 aa13.4□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 TMEM8BA6NDV4 472 aa13.39□□□□□ -0.27
C9orf3-210ENST00000462125 ARHGAP42A6NI28 874 aa13.39□□□□□ -0.27
C9orf3-210ENST00000462125 SPINT1O43278 529 aa13.39□□□□□ -0.27
C9orf3-210ENST00000462125 IGSF6O95976 241 aa13.39□□□□□ -0.27
C9orf3-210ENST00000462125 CAPNS1P04632 268 aa13.39□□□□□ -0.27
C9orf3-210ENST00000462125 CYP1A2P05177 515 aa13.39□□□□□ -0.27
C9orf3-210ENST00000462125 UGT2B4P06133 528 aa13.39□□□□□ -0.27
C9orf3-210ENST00000462125 TIMP2P16035 220 aa13.39□□□□□ -0.27
C9orf3-210ENST00000462125 IL1R2P27930 398 aa13.39□□□□□ -0.27
C9orf3-210ENST00000462125 CSNK1DP48730 415 aa13.39□□□□□ -0.27
C9orf3-210ENST00000462125 SUOXP51687 545 aa13.39□□□□□ -0.27
C9orf3-210ENST00000462125 RHOAP61586 193 aa13.39□□□□□ -0.27
C9orf3-210ENST00000462125 DPYSQ14117 519 aa13.39□□□□□ -0.27
C9orf3-210ENST00000462125 GRM3Q14832 879 aa13.39□□□□□ -0.27
C9orf3-210ENST00000462125 DPYSL2Q16555 572 aa13.39□□□□□ -0.27
C9orf3-210ENST00000462125 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
C9orf3-210ENST00000462125 GCNT7Q6ZNI0 430 aa13.39□□□□□ -0.27
C9orf3-210ENST00000462125 TTC7BQ86TV6 843 aa13.39□□□□□ -0.27
C9orf3-210ENST00000462125 LZTR1Q8N653 840 aa13.39□□□□□ -0.27
C9orf3-210ENST00000462125 NIPA2Q8N8Q9 360 aa13.39□□□□□ -0.27
C9orf3-210ENST00000462125 RNF214Q8ND24 703 aa13.39□□□□□ -0.27
C9orf3-210ENST00000462125 TSC1Q92574 1164 aa13.39□□□□□ -0.27
C9orf3-210ENST00000462125 ARHGEF26Q96DR7 871 aa13.39□□□□□ -0.27
C9orf3-210ENST00000462125 IFT43Q96FT9 208 aa13.39□□□□□ -0.27
C9orf3-210ENST00000462125 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
C9orf3-210ENST00000462125 PDLIM2Q96JY6 352 aa13.39□□□□□ -0.27
C9orf3-210ENST00000462125 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
C9orf3-210ENST00000462125 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
C9orf3-210ENST00000462125 NENFQ9UMX5 172 aa13.39□□□□□ -0.27
C9orf3-210ENST00000462125 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa13.39□□□□□ -0.27
C9orf3-210ENST00000462125 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP13.39□□□□□ -0.27
C9orf3-210ENST00000462125 CEP295Q9C0D2 2601 aa13.39□□□□□ -0.27
C9orf3-210ENST00000462125 IGLON5A6NGN9 336 aa13.38□□□□□ -0.27
C9orf3-210ENST00000462125 RAD51BO15315 384 aa13.38□□□□□ -0.27
C9orf3-210ENST00000462125 DAPK3O43293 454 aa13.38□□□□□ -0.27
C9orf3-210ENST00000462125 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
C9orf3-210ENST00000462125 CASP14P31944 242 aa13.38□□□□□ -0.27
C9orf3-210ENST00000462125 CLDN2P57739 230 aa13.38□□□□□ -0.27
C9orf3-210ENST00000462125 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP13.38□□□□□ -0.27
C9orf3-210ENST00000462125 SGCGQ13326 291 aa13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms