RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439415.1

CBX1P4-201, Transcript of chromobox 1 pseudogene 4, humanhuman

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Gene CBX1P4, Length 457 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P4-201ENST00000439415 HOXB5P09067 269 aa4.84□□□□□ -1.63
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CBX1P4-201ENST00000439415 GAP43P17677 238 aa4.84□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 CASTP20810 708 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 SCP2P22307 547 aa4.84□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
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CBX1P4-201ENST00000439415 CYP1B1Q16678 543 aa4.84□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 CYP2A13Q16696 494 aa4.84□□□□□ -1.63
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CBX1P4-201ENST00000439415 PCGF3Q3KNV8 242 aa4.84□□□□□ -1.63
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CBX1P4-201ENST00000439415 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
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CBX1P4-201ENST00000439415 OTOAQ7RTW8 1153 aa4.84□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 ADCK2Q7Z695 626 aa4.84□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 NEK8Q86SG6 692 aa4.84□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM124AQ86V42 546 aa4.84□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa4.84□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 MMP21Q8N119 569 aa4.84□□□□□ -1.63
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CBX1P4-201ENST00000439415 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa4.84□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
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CBX1P4-201ENST00000439415 NSMCE1Q8WV22 266 aa4.84□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP4.84□□□□□ -1.63
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CBX1P4-201ENST00000439415 HDAC11Q96DB2 347 aa4.84□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 BOD1Q96IK1 185 aa4.84□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 TMEM237Q96Q45 408 aa4.84□□□□□ -1.63
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CBX1P4-201ENST00000439415 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa4.84□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa4.84□□□□□ -1.63
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CBX1P4-201ENST00000439415 TNMDQ9H2S6 317 aa4.84□□□□□ -1.63
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CBX1P4-201ENST00000439415 USP29Q9HBJ7 922 aa4.84□□□□□ -1.63
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CBX1P4-201ENST00000439415 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa4.84□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 NRIP3Q9NQ35 241 aa4.84□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 SETD4Q9NVD3 440 aa4.84□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 PLK2Q9NYY3 685 aa4.84□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 GDE1Q9NZC3 331 aa4.84□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 DHDHQ9UQ10 334 aa4.84□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 SH2B3Q9UQQ2 575 aa4.84□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa4.84□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 SYNJ2O15056 1496 aa4.83□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP4.83□□□□□ -1.64
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CBX1P4-201ENST00000439415 DISP3Q9P2K9 1392 aa4.83□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 IGSF1Q8N6C5 1336 aa4.83□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 TRGV11A0A075B6L2 103 aa4.83□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 LRRD1A4D1F6 860 aa4.83□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa4.83□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 OR6C76A6NM76 312 aa4.83□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 ASAP2O43150 1006 aa4.83□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 PRAMEF2O60811 474 aa4.83□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 SEC22BO75396 215 aa4.83□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 RPS6KA4O75676 772 aa4.83□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 RAD17O75943 681 aa4.83□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 CAMTA2O94983 1202 aa4.83□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 ONECUT2O95948 504 aa4.83□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 SERPINC1P01008 464 aa4.83□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 FURINP09958 794 aa4.83□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa4.83□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 PCP11498 1178 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 PTPN9P43378 593 aa4.83□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 CAPZA1P52907 286 aa4.83□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 KIAA2012Q0VF49 1180 aa4.83□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 CBX3Q13185 183 aa4.83□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 FGFBP1Q14512 234 aa4.83□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 SEMA3AQ14563 771 aa4.83□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 PPP2R5BQ15173 497 aa4.83□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 ALG11Q2TAA5 492 aa4.83□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa4.83□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 SPDYE7PQ495Y7 208 aa4.83□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa4.83□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 C1QL3Q5VWW1 255 aa4.83□□□□□ -1.64
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