RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437078.6

RABGEF1-210, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene RABGEF1, Length 4,319 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-210ENST00000437078 C4orf22Q6V702 233 aa13.71□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP13.71□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 PHC3Q8NDX5 983 aa13.71□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 RNF208Q9H0X6 261 aa13.71□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 NDE1Q9NXR1 346 aa13.71□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa13.71□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 CA12O43570 354 aa13.71□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 TIMM44O43615 452 aa13.71□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 B4GALT3O60512 393 aa13.71□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 STAMBPO95630 424 aa13.71□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 TAS2R39P59534 338 aa13.71□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 PIM3Q86V86 326 aa13.71□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 SERINC5Q86VE9 423 aa13.71□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 RELL1Q8IUW5 271 aa13.71□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 PHTF2Q8N3S3 785 aa13.71□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 SERPINB11Q96P15 392 aa13.71□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 NAT9Q9BTE0 207 aa13.71□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP13.71□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 GBA3Q9H227 469 aa13.71□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 HACD3Q9P035 362 aa13.71□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 PRKAG3Q9UGI9 489 aa13.71□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 PRELID1Q9Y255 219 aa13.71□□□□□ -0.21
RABGEF1-210ENST00000437078 H0Y626 953 aa13.71□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 MTSS1O43312 755 aa13.71□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 CKBP12277 381 aa13.71□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 CTPS1P17812 591 aa13.71□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 CRHR1P34998 444 aa13.71□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 CD151P48509 253 aa13.71□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 HARS2P49590 506 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 PTPRRQ15256 657 aa13.71□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 BBS5Q8N3I7 341 aa13.71□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa13.71□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 SIKE1Q9BRV8 207 aa13.71□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 IL22Q9GZX6 179 aa13.71□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 ARHGEF3Q9NR81 526 aa13.71□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa13.71□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 TLL2Q9Y6L7 1015 aa13.71□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 ARHGEF37A1IGU5 675 aa13.71□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 IRAK2O43187 625 aa13.71□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 RHOBTB1O94844 696 aa13.71□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 GJA1P17302 382 aa13.71□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP13.71□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 FAM83EQ2M2I3 478 aa13.71□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa13.71□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF789Q5FWF6 425 aa13.71□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP13.71□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 SEL1L3Q68CR1 1132 aa13.71□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 SLC24A5Q71RS6 500 aa13.71□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 HPS6Q86YV9 775 aa13.71□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 SHKBP1Q8TBC3 707 aa13.71□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 PPP1R14BQ96C90 147 aa13.71□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 MIPEPQ99797 713 aa13.71□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 ATP13A1Q9HD20 1204 aa13.71□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 E5RI56 91 aa13.7□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 DCLK1O15075 740 aa13.7□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 AHSGP02765 367 aa13.7□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 DLDP09622 509 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 T-ENOLP0DO92 83 aa13.7□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 CLEC6AQ6EIG7 209 aa13.7□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 LINC00523Q86TU6 105 aa13.7□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 ANKLE1Q8NAG6 615 aa13.7□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 ARNTL2Q8WYA1 636 aa13.7□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 ZBED2Q9BTP6 218 aa13.7□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 BEGAINQ9BUH8 593 aa13.7□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 APOL5Q9BWW9 433 aa13.7□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 MAF1Q9H063 256 aa13.7□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP13.7□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa13.7□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 NCAM2O15394 837 aa13.7□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP13.7□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 LRPAP1P30533 357 aa13.7□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 CYP2C18P33260 490 aa13.7□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 LRRC73Q5JTD7 316 aa13.7□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP13.7□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 CYP2R1Q6VVX0 501 aa13.7□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa13.7□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 HIC2Q96JB3 615 aa13.7□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 OR52B2Q96RD2 323 aa13.7□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 RBBP8Q99708 897 aa13.7□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP13.7□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa13.7□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 GIMAP2Q9UG22 337 aa13.7□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 TRHDEQ9UKU6 1024 aa13.7□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 ARL5AQ9Y689 179 aa13.7□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 NDUFS3O75489 264 aa13.7□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 CKMP06732 381 aa13.7□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 PRKCHP24723 683 aa13.7□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 HOXD10P28358 340 aa13.7□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 SLC1A2P43004 574 aa13.7□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 RAB27AP51159 221 aa13.7□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 RGS18Q9NS28 235 aa13.7□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 KANSL3Q9P2N6 904 aa13.7□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 A0A0D9SEW6 157 aa13.69□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 INHAP05111 366 aa13.69□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 ACSBG2Q5FVE4 666 aa13.69□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 GPR158Q5T848 1215 aa13.69□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP13.69□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 OR13C4Q8NGS5 318 aa13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms