RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424089.5

POLR1A-204, Transcript of RNA polymerase I subunit A, human

TSL 3

Gene POLR1A, Length 576 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
POLR1A-204	ENST00000424089	SLC22A17	Q8WUG5	538 aa		10.18	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	AUTS2	Q8WXX7	1259 aa		10.18	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	AZIN2	Q96A70	460 aa		10.18	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	CELF6	Q96J87	481 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	FAM111A	Q96PZ2	611 aa		10.18	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	TBL1Y	Q9BQ87	522 aa		10.18	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	TUBB6	Q9BUF5	446 aa		10.18	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	TRIM55	Q9BYV6	548 aa		10.18	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	CEP41	Q9BYV8	373 aa		10.18	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	PRKD2	Q9BZL6	878 aa		10.18	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	OSER1	Q9NX31	292 aa		10.18	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	DLL3	Q9NYJ7	618 aa		10.18	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	SLC17A7	Q9P2U7	560 aa		10.18	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	MTRR	Q9UBK8	725 aa		10.18	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	DPP7	Q9UHL4	492 aa		10.18	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	IPO11	Q9UI26	975 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	FRYL	O94915	3013 aa		10.18	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	EP300	Q09472	2414 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	PATJ	Q8NI35	1801 aa		10.17	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	ZCWPW2	A0A1B0GU75	182 aa		10.17	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	HMX2	A2RU54	273 aa		10.17	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	SLC38A8	A6NNN8	435 aa		10.17	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	C2CD2L	O14523	706 aa		10.17	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	HNRNPCL1	O60812	293 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	PIAS1	O75925	651 aa		10.17	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	MOCS2	O96007	188 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	MPO	P05164	745 aa		10.17	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	ITGA2B	P08514	1039 aa		10.17	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	NEFH	P12036	1026 aa		10.17	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	SDHB	P21912	280 aa		10.17	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	GPR15	P49685	360 aa		10.17	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	PGF	P49763	221 aa		10.17	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	LIG3	P49916	1009 aa		10.17	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	PAPOLA	P51003	745 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	USP46	P62068	366 aa		10.17	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	PDE1B	Q01064	536 aa		10.17	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	BNIP1	Q12981	228 aa		10.17	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	LAMB3	Q13751	1172 aa		10.17	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	UGP2	Q16851	508 aa		10.17	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	C5orf22	Q49AR2	442 aa		10.17	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	RTP2	Q5QGT7	225 aa		10.17	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	C10orf120	Q5SQS8	335 aa		10.17	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	MROH9	Q5TGP6	573 aa		10.17	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	TMCO4	Q5TGY1	634 aa		10.17	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	PIK3R6	Q5UE93	754 aa		10.17	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	CGB2	Q6NT52	195 aa		10.17	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	PKN3	Q6P5Z2	889 aa		10.17	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	RNF19B	Q6ZMZ0	732 aa		10.17	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	CCDC91	Q7Z6B0	441 aa		10.17	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	RNF168	Q8IYW5	571 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	DCLK2	Q8N568	766 aa		10.17	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	TEX26	Q8N6G2	289 aa		10.17	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	STKLD1	Q8NE28	680 aa		10.17	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	NXPE3	Q969Y0	559 aa		10.17	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	ZNF669	Q96BR6	464 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	IGSF21	Q96ID5	467 aa		10.17	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	C7orf26	Q96N11	449 aa		10.17	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	ZNF599	Q96NL3	588 aa		10.17	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	PGLYRP2	Q96PD5	576 aa		10.17	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	KLF6	Q99612	283 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	SEPT5	Q99719	369 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	SIKE1	Q9BRV8	207 aa		10.17	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	TSSK1B	Q9BXA7	367 aa		10.17	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	SLC25A51	Q9H1U9	297 aa		10.17	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	ARNT2	Q9HBZ2	717 aa		10.17	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	RBM22	Q9NW64	420 aa	Known RBP eCLIP	10.17	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	SIRPG	Q9P1W8	387 aa		10.17	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	AFF4	Q9UHB7	1163 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	DNMT3L	Q9UJW3	386 aa		10.17	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	MTO1	Q9Y2Z2	717 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	CAPN7	Q9Y6W3	813 aa		10.17	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	FANCM	Q8IYD8	2048 aa		10.17	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	TPR	P12270	2363 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	SLC12A8	A0AV02	714 aa		10.16	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	ANKRD65	E5RJM6	399 aa		10.16	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	PAM	P19021	973 aa		10.16	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	ADRA1A	P35348	466 aa		10.16	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	ATP5C1	P36542	298 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	MAGEA12	P43365	314 aa		10.16	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	SLC11A2	P49281	568 aa		10.16	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	SERPINB8	P50452	374 aa		10.16	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	LIMK2	P53671	638 aa		10.16	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	ARPP19	P56211	112 aa		10.16	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	IL10RB	Q08334	325 aa		10.16	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	DUSP4	Q13115	394 aa		10.16	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	COL9A2	Q14055	689 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	SLC14A2	Q15849	920 aa		10.16	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	PSMD5	Q16401	504 aa		10.16	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	CCDC153	Q494R4	210 aa		10.16	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	TEDDM1	Q5T9Z0	273 aa		10.16	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	MARC1	Q5VT66	337 aa		10.16	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	SDHAF4	Q5VUM1	108 aa		10.16	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	RANBP10	Q6VN20	620 aa		10.16	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	FAM47E	Q6ZV65	393 aa		10.16	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	NLRP9	Q7RTR0	991 aa		10.16	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	OTOA	Q7RTW8	1153 aa		10.16	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	C14orf80	Q86SX3	495 aa		10.16	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	NUDCD3	Q8IVD9	361 aa		10.16	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	NETO2	Q8NC67	525 aa		10.16	□□□□□ -0.78
POLR1A-204	ENST00000424089	PPHLN1	Q8NEY8	458 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms