RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415055.2

PTPRK-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-210ENST00000415055 CCT2P78371 535 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 CYP4A11Q02928 519 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 MBTD1Q05BQ5 628 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 FCHO2Q0JRZ9 810 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 NOMO1Q15155 1222 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 TAF12Q16514 161 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 MAPK6Q16659 721 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 TMEM196Q5HYL7 178 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 FAM209BQ5JX69 171 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 TRIM68Q6AZZ1 485 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 USP51Q70EK9 711 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 LPCAT2Q7L5N7 544 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 KBTBD2Q8IY47 623 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 KLHL36Q8N4N3 616 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 LEMD2Q8NC56 503 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 OR5AN1Q8NGI8 311 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 BPIFB1Q8TDL5 484 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 SNX33Q8WV41 574 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 EXOC4Q96A65 974 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 TMEM41AQ96HV5 264 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 DYDC2Q96IM9 177 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 TCEANC2Q96MN5 208 aa4.87□□□□□ -1.63
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PTPRK-210ENST00000415055 PGLYRP2Q96PD5 576 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 GCNAQ96QF7 691 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 ADPGKQ9BRR6 497 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 CRB3Q9BUF7 120 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 ZMYND12Q9H0C1 365 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 VPS11Q9H270 941 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 CXCL16Q9H2A7 254 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 DEF6Q9H4E7 631 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 EBF3Q9H4W6 596 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 BCO1Q9HAY6 547 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 SERHLQ9NQF3 203 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 LMBRD1Q9NUN5 540 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 PNPOQ9NVS9 261 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 RAI2Q9Y5P3 530 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 SNX13Q9Y5W8 968 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 OBSL1O75147 1896 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 A0A1B0GUA9 196 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 H3BUI4 141 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 MYO1FO00160 1098 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 ARHGAP6O43182 974 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 AKR1B10O60218 316 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 PRAMEF12O95522 483 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 TDP2O95551 362 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 SLPIP03973 132 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 TYRP14679 529 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 DRD1P21728 446 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 CTSSP25774 331 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 GABRR2P28476 465 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 ABCG1P45844 678 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 STT3AP46977 705 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 MCM2P49736 904 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 RENBPP51606 427 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 NLRP5P59047 1200 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 BFSP1Q12934 665 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 SEMA3BQ13214 749 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 PLD1Q13393 1074 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 IL10RAQ13651 578 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 RUNX3Q13761 415 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 CAPSQ13938 189 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 DAG1Q14118 895 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 CNGA2Q16280 664 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 WDR72Q3MJ13 1102 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 TPGS2Q68CL5 300 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 TMEM200BQ69YZ2 307 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 NCAPH2Q6IBW4 605 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 GRAMD4Q6IC98 578 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 SLC8B1Q6J4K2 584 aa4.86□□□□□ -1.63
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PTPRK-210ENST00000415055 ZNF585AQ6P3V2 769 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 SYT13Q7L8C5 426 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 PIP4P1Q86T03 277 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 SYT12Q8IV01 421 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 DEFB119Q8N690 84 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 CCDC148Q8NFR7 591 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 OR2I1PQ8NGU4 316 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 TBCKQ8TEA7 893 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 RLN3Q8WXF3 142 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 CHFRQ96EP1 664 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 SLC35A4Q96G79 324 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 CLPTM1LQ96KA5 538 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 MRGPRX4Q96LA9 322 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 LRRC3BQ96PB8 259 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 P2RY13Q9BPV8 354 aa4.86□□□□□ -1.63
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