RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398073.6

CTDSP2-201, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 4,795 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-201ENST00000398073 MAPK10P53779 464 aa16.53■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 CDC16Q13042 620 aa16.53■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 KCTD21Q4G0X4 260 aa16.53■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 STXBP5Q5T5C0 1151 aa16.53■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 CUZD1Q86UP6 607 aa16.53■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 MCRS1Q96EZ8 462 aa16.53■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 TMEM216Q9P0N5 145 aa16.53■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 SLC7A8Q9UHI5 535 aa16.53■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 NUDT5Q9UKK9 219 aa16.53■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 TMCC3Q9ULS5 477 aa16.53■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 VWA7Q9Y334 891 aa16.53■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 PDHXO00330 501 aa16.52■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 DHX15O43143 795 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 DDR2Q16832 855 aa16.52■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 STK40Q8N2I9 435 aa16.52■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 PLEKHO2Q8TD55 490 aa16.52■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF112Q9UJU3 913 aa16.52■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 POMPQ9Y244 141 aa16.52■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 ATRNL1Q5VV63 1379 aa16.52■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 BBIP1A8MTZ0 92 aa16.52■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 KRT20P35900 424 aa16.52■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 POLD2P49005 469 aa16.52■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 RAP1GDS1P52306 607 aa16.52■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 PRKG2Q13237 762 aa16.52■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 PPIL2Q13356 520 aa16.52■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 FAM47BQ8NA70 645 aa16.52■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 TSPAN18Q96SJ8 248 aa16.52■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 ARHGEF4Q9NR80 690 aa16.52■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 INVSQ9Y283 1065 aa16.52■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 RRM2P31350 389 aa16.52■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 IDH3AP50213 366 aa16.52■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 C9orf57Q5W0N0 161 aa16.52■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 ADCK2Q7Z695 626 aa16.52■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa16.52■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 CARNMT1Q8N4J0 409 aa16.52■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 TBC1D19Q8N5T2 526 aa16.52■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa16.52■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 TMCO1Q9UM00 188 aa16.52■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 GPR25O00155 361 aa16.51■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 TSPAN8P19075 237 aa16.51■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 PIK3CGP48736 1102 aa16.51■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 ST13P50502 369 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 LMO3Q8TAP4 145 aa16.51■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 NAT14Q8WUY8 206 aa16.51■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 DGCR6LQ9BY27 220 aa16.51■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 GLOD4Q9HC38 313 aa16.51■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 SLC15A5A6NIM6 579 aa16.51■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 KLF11O14901 512 aa16.51■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 SERPIND1P05546 499 aa16.51■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 IDO1P14902 403 aa16.51■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 TJAP1Q5JTD0 557 aa16.51■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 GALNT15Q8N3T1 639 aa16.51■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 CLDN5O00501 218 aa16.51■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 FGFR1P11362 822 aa16.51■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 S100A3P33764 101 aa16.51■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 WNT3AP56704 352 aa16.51■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 PSMD5Q16401 504 aa16.51■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 RALGPS1Q5JS13 557 aa16.51■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 RETSATQ6NUM9 610 aa16.51■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 C3orf18Q9UK00 162 aa16.51■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 IRF6O14896 467 aa16.51■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 TSPAN3O60637 253 aa16.51■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 KCNH1O95259 989 aa16.51■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 ANXA6P08133 673 aa16.51■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 ZYG11AQ6WRX3 759 aa16.51■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 GK5Q6ZS86 529 aa16.51■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 FAM35AQ86V20 835 aa16.51■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 GLIS1Q8NBF1 620 aa16.51■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 FBXO30Q8TB52 745 aa16.51■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 OPTCQ9UBM4 332 aa16.51■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 TRPV2Q9Y5S1 764 aa16.51■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa16.5■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 HERC6Q8IVU3 1022 aa16.5■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF781Q8N8C0 355 aa16.5■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 OR52K2Q8NGK3 314 aa16.5■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 TBCDQ9BTW9 1192 aa16.5■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 RIBC2Q9H4K1 309 aa16.5■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa16.5■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 C8orf4Q9NR00 106 aa16.5■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 CHRAC1Q9NRG0 131 aa16.5■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 KANSL3Q9P2N6 904 aa16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms