RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375175.1

TMOD1-202, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TMOD1, Length 2,516 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-202ENST00000375175 GAD1Q99259 594 aa13.35□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 RTKNQ9BST9 563 aa13.35□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 RMI1Q9H9A7 625 aa13.35□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 CLEC11AQ9Y240 323 aa13.35□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 AK5Q9Y6K8 562 aa13.35□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 PIGNO95427 931 aa13.34□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 APOA4P06727 396 aa13.34□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 EPHA3P29320 983 aa13.34□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 NUDT2P50583 147 aa13.34□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 RPL14P50914 215 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 NAGLUP54802 743 aa13.34□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 POU6F1Q14863 301 aa13.34□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 LIPMQ5VYY2 423 aa13.34□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 SEL1L3Q68CR1 1132 aa13.34□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 NXNQ6DKJ4 435 aa13.34□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa13.34□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 KCTD4Q8WVF5 259 aa13.34□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 TBCCD1Q9NVR7 557 aa13.34□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 RAB26Q9ULW5 256 aa13.34□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa13.34□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 RAP2CQ9Y3L5 183 aa13.34□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 TSC2P49815 1807 aa13.34□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 THP07101 528 aa13.34□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 FAM58BPP0C7Q3 252 aa13.34□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 THRAP10827 490 aa13.34□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 CD1EP15812 388 aa13.34□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 PIK3R1P27986 724 aa13.34□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 HADHAP40939 763 aa13.34□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 CXCR3P49682 368 aa13.34□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 CCR3P51677 355 aa13.34□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 NR1H2P55055 460 aa13.34□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 CDKL1Q00532 357 aa13.34□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 ITGA7Q13683 1181 aa13.34□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 RAB41Q5JT25 222 aa13.34□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 BORAQ6PGQ7 559 aa13.34□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 ZYG11AQ6WRX3 759 aa13.34□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 Q6ZNX1 250 aa13.34□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 LINC00523Q86TU6 105 aa13.34□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 SNX32Q86XE0 403 aa13.34□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 TMEM86AQ8N2M4 240 aa13.34□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 IPMKQ8NFU5 416 aa13.34□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 LPPQ93052 612 aa13.34□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 TMIGD2Q96BF3 282 aa13.34□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 GPR22Q99680 433 aa13.34□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 NUF2Q9BZD4 464 aa13.34□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 SLC38A7Q9NVC3 462 aa13.34□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa13.34□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 RRN3Q9NYV6 651 aa13.34□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 PSMD13Q9UNM6 376 aa13.34□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa13.34□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 MATN2O00339 956 aa13.33□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 HDAC3O15379 428 aa13.33□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP13.33□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 AHSGP02765 367 aa13.33□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 GLDCP23378 1020 aa13.33□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 GSTM4Q03013 218 aa13.33□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 CTBP1Q13363 440 aa13.33□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 SLC12A1Q13621 1099 aa13.33□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 PPM1LQ5SGD2 360 aa13.33□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa13.33□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 TAC4Q86UU9 113 aa13.33□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 CNTD1Q8N815 330 aa13.33□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 DDI1Q8WTU0 396 aa13.33□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 SMARCD1Q96GM5 515 aa13.33□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 DRC3Q9H069 523 aa13.33□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 AP5M1Q9H0R1 490 aa13.33□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 RHOJQ9H4E5 214 aa13.33□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 CROCCQ5TZA2 2017 aa13.33□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 TRIM43BA6NCK2 446 aa13.33□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 CASTOR2A6NHX0 329 aa13.33□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 AP3B1O00203 1094 aa13.33□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 PSMD3O43242 534 aa13.33□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 CABYRO75952 493 aa13.33□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 DDHD2O94830 711 aa13.33□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 VAPBO95292 243 aa13.33□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 PORP16435 677 aaPredicted RBP13.33□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 TFEBP19484 476 aa13.33□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 MTTPP55157 894 aa13.33□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF460Q14592 562 aa13.33□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 KDELC2Q7Z4H8 507 aa13.33□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 SPATA6LQ8N4H0 392 aa13.33□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 CCNYL1Q8N7R7 359 aa13.33□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 KIFC1Q9BW19 673 aa13.33□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 MIOSQ9NXC5 875 aa13.33□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP13.33□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa13.33□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 CDH9Q9ULB4 789 aa13.33□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa13.33□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 SH3PXD2BA1X283 911 aa13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.9 ms