RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368632.6

HDAC2-201, Transcript of histone deacetylase 2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HDAC2, Length 2,084 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2-201ENST00000368632 POMKQ9H5K3 350 aa20.38■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa20.38■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 RAB26Q9ULW5 256 aa20.38■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 CD151P48509 253 aa20.37■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 GTSE1Q9NYZ3 720 aa20.37■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa20.36■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 SDHDO14521 159 aa20.36■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 PMLP29590 882 aa20.36■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 SLC12A2P55011 1212 aa20.36■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 TAS2R39P59534 338 aa20.36■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 ZNF470Q6ECI4 717 aa20.36■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 HEXDCQ8WVB3 486 aa20.36■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 SGF29Q96ES7 293 aa20.36■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa20.36■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 NPAS2Q99743 824 aa20.36■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 VCX3AQ9NNX9 186 aa20.36■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa20.36■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa20.36■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa20.36■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 TCAF2A6NFQ2 919 aa20.36■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 MATN3O15232 486 aa20.36■□□□□ 0.85
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HDAC2-201ENST00000368632 DNAJA2O60884 412 aa20.36■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 ADRA1AP35348 466 aa20.36■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 CPT1AP50416 773 aa20.36■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 DNAJB13P59910 316 aa20.36■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 TRIM67Q6ZTA4 783 aa20.36■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 ADCY4Q8NFM4 1077 aa20.36■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 CEP70Q8NHQ1 597 aa20.36■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 NAT14Q8WUY8 206 aa20.36■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 FSD1LQ9BXM9 530 aa20.36■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 FAM105AQ9NUU6 356 aa20.36■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 MIOSQ9NXC5 875 aa20.36■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 CLIC5Q9NZA1 410 aa20.36■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa20.35■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 PMPCBO75439 489 aa20.35■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 CRTAMO95727 393 aa20.35■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 SMIM18P0DKX4 95 aa20.35■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 BDNFP23560 247 aa20.35■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 BEX3Q00994 111 aa20.35■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 POU4F1Q01851 419 aa20.35■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 FAM110CQ1W6H9 321 aa20.35■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 SATL1Q86VE3 508 aa20.35■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 LPPQ93052 612 aa20.35■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 SLC39A8Q9C0K1 460 aa20.35■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 TRPV6Q9H1D0 765 aa20.35■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa20.35■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 ZNF408Q9H9D4 720 aa20.35■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 TREX1Q9NSU2 369 aa20.35■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 CASTOR2A6NHX0 329 aa20.34■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 IGLV3-25P01717 112 aa20.34■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 HLA-DQB2P05538 268 aa20.34■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 CPB1P15086 417 aa20.34■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 SEPT6Q14141 434 aa20.34■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 CNSTQ6PJW8 725 aa20.34■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 TICAM1Q8IUC6 712 aa20.34■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 LILRA2Q8N149 483 aa20.34■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 LZTR1Q8N653 840 aa20.34■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 HAPLN3Q96S86 360 aa20.34■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 RTP3Q9BQQ7 232 aa20.34■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 TRIM62Q9BVG3 475 aa20.34■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 KATNAL1Q9BW62 490 aa20.34■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 NDUFA13Q9P0J0 144 aa20.34■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 FBXO5Q9UKT4 447 aa20.34■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 AP4B1Q9Y6B7 739 aa20.34■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa20.34■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 TRIM38O00635 465 aa20.34■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 PTK2BQ14289 1009 aa20.34■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 TIGD5Q53EQ6 642 aa20.34■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 GK5Q6ZS86 529 aa20.34■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 SCML4Q8N228 414 aa20.34■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 PELI3Q8N2H9 469 aa20.34■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 KLHL32Q96NJ5 620 aa20.34■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 PKP2Q99959 881 aa20.34■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 IGSF5Q9NSI5 407 aa20.34■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP20.34■□□□□ 0.854e-7■■■■■ 29.9
HDAC2-201ENST00000368632 ACOT8O14734 319 aa20.33■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 IRAK2O43187 625 aa20.33■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 PAGE1O75459 146 aa20.33■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 PGM3O95394 542 aa20.33■□□□□ 0.85
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