RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000364056.1

RNU6-960P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 960, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-960P, Length 120 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-960P-201ENST00000364056 CAMK1DQ8IU85 385 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-960P-201ENST00000364056 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
RNU6-960P-201ENST00000364056 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
RNU6-960P-201ENST00000364056 METTL6Q8TCB7 284 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-960P-201ENST00000364056 GPT2Q8TD30 523 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-960P-201ENST00000364056 PIGOQ8TEQ8 1089 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-960P-201ENST00000364056 TMEM79Q9BSE2 394 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-960P-201ENST00000364056 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-960P-201ENST00000364056 FZD3Q9NPG1 666 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-960P-201ENST00000364056 RNF146Q9NTX7 359 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-960P-201ENST00000364056 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
RNU6-960P-201ENST00000364056 ZNF521Q96K83 1311 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-960P-201ENST00000364056 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-960P-201ENST00000364056 A0A096LPK6 155 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-960P-201ENST00000364056 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-960P-201ENST00000364056 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-960P-201ENST00000364056 MDM4O15151 490 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-960P-201ENST00000364056 ATP2C2O75185 946 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-960P-201ENST00000364056 HEXAP06865 529 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-960P-201ENST00000364056 PSG1P11464 419 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-960P-201ENST00000364056 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-960P-201ENST00000364056 ABCD1P33897 745 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-960P-201ENST00000364056 RYKP34925 604 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-960P-201ENST00000364056 THPOP40225 353 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-960P-201ENST00000364056 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-960P-201ENST00000364056 CENPAP49450 140 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-960P-201ENST00000364056 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-960P-201ENST00000364056 CDH12P55289 794 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-960P-201ENST00000364056 P2RX3P56373 397 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-960P-201ENST00000364056 SELENOVP59797 346 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-960P-201ENST00000364056 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-960P-201ENST00000364056 PPATQ06203 517 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-960P-201ENST00000364056 LMOD3Q0VAK6 560 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-960P-201ENST00000364056 GRIK3Q13003 919 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-960P-201ENST00000364056 RUNX2Q13950 521 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-960P-201ENST00000364056 LPIN1Q14693 890 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-960P-201ENST00000364056 VEPH1Q14D04 833 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-960P-201ENST00000364056 RALBP1Q15311 655 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-960P-201ENST00000364056 DUSP6Q16828 381 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-960P-201ENST00000364056 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-960P-201ENST00000364056 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-960P-201ENST00000364056 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-960P-201ENST00000364056 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-960P-201ENST00000364056 PARM1Q6UWI2 310 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-960P-201ENST00000364056 RRM2BQ7LG56 351 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-960P-201ENST00000364056 NOXA1Q86UR1 476 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-960P-201ENST00000364056 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-960P-201ENST00000364056 ANKRD52Q8NB46 1076 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-960P-201ENST00000364056 C11orf65Q8NCR3 313 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-960P-201ENST00000364056 MCPH1Q8NEM0 835 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-960P-201ENST00000364056 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-960P-201ENST00000364056 MPLKIPQ8TAP9 179 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-960P-201ENST00000364056 TMEM170AQ8WVE7 144 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-960P-201ENST00000364056 KLHL29Q96CT2 875 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-960P-201ENST00000364056 RNF183Q96D59 192 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-960P-201ENST00000364056 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-960P-201ENST00000364056 PERPQ96FX8 193 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-960P-201ENST00000364056 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-960P-201ENST00000364056 ZNF333Q96JL9 665 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-960P-201ENST00000364056 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-960P-201ENST00000364056 MSTO1Q9BUK6 570 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-960P-201ENST00000364056 PDCL3Q9H2J4 239 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-960P-201ENST00000364056 ZHX3Q9H4I2 956 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-960P-201ENST00000364056 POT1Q9NUX5 634 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-960P-201ENST00000364056 TAS2R10Q9NYW0 307 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-960P-201ENST00000364056 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-960P-201ENST00000364056 PSAT1Q9Y617 370 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-960P-201ENST00000364056 PIAS3Q9Y6X2 628 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-960P-201ENST00000364056 HSPB2A8KAH6 182 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-960P-201ENST00000364056 SOCS2O14508 198 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-960P-201ENST00000364056 LIASO43766 372 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-960P-201ENST00000364056 USO1O60763 962 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-960P-201ENST00000364056 RGS11O94810 467 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-960P-201ENST00000364056 SYF2O95926 243 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-960P-201ENST00000364056 SPARCP09486 303 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-960P-201ENST00000364056 TMEM191BP0C7N4 346 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-960P-201ENST00000364056 TFPIP10646 304 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-960P-201ENST00000364056 SRD5A1P18405 259 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-960P-201ENST00000364056 CAPN3P20807 821 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-960P-201ENST00000364056 MAN1A1P33908 653 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-960P-201ENST00000364056 GPR12P47775 334 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-960P-201ENST00000364056 GNAQP50148 359 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-960P-201ENST00000364056 BLKP51451 505 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-960P-201ENST00000364056 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-960P-201ENST00000364056 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-960P-201ENST00000364056 MYBPC2Q14324 1141 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-960P-201ENST00000364056 PPP2R5BQ15173 497 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-960P-201ENST00000364056 HSPB2Q16082 182 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-960P-201ENST00000364056 SOWAHAQ2M3V2 549 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-960P-201ENST00000364056 LEXMQ3ZCV2 418 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-960P-201ENST00000364056 DCAF12L2Q5VW00 463 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-960P-201ENST00000364056 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-960P-201ENST00000364056 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-960P-201ENST00000364056 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-960P-201ENST00000364056 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-960P-201ENST00000364056 Q6ZTK2 550 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-960P-201ENST00000364056 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-960P-201ENST00000364056 TBC1D26Q86UD7 250 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-960P-201ENST00000364056 PIM3Q86V86 326 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-960P-201ENST00000364056 TMC8Q8IU68 726 aa3.39□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23 ms