RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC39A8Q9C0K1 460 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC28A3Q9HAS3 691 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 SASH3O75995 380 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM187BQ17R55 369 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 MPPE1Q53F39 396 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 PLPP4Q5VZY2 271 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 NPAS4Q8IUM7 802 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 MAB21L3Q8N8X9 362 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 NDOR1Q9UHB4 597 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 PEX10O60683 326 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 GNA13Q14344 377 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 TEX44Q53QW1 395 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 HGSNATQ68CP4 663 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 RBFAQ8N0V3 343 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 EPS8L2Q9H6S3 715 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 GMIPQ9P107 970 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 UNCXA6NJT0 531 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 CYP7B1O75881 506 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 FGBP02675 491 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 LILRA4P59901 499 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 FUT10Q6P4F1 479 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 CYP20A1Q6UW02 462 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF621Q6ZSS3 439 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 MON1BQ7L1V2 547 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 EID3Q8N140 333 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 OR4L1Q8NH43 312 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 TLE6Q9H808 572 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 BPIFA1Q9NP55 256 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 ARMCX1Q9P291 453 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 CFAP97Q9P2B7 532 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 SHBGP04278 402 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 PIRTP0C851 137 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 PTPN9P43378 593 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 GPR158Q5T848 1215 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF384Q8TF68 577 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 RSPH1Q8WYR4 309 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 HDAC10Q969S8 669 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 LIMD1Q9UGP4 676 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 RABGEF1Q9UJ41 708 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 KNDC1Q76NI1 1749 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 LRCH4O75427 683 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 EOMESO95936 686 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 CLTBP09497 229 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 COX7A2P14406 83 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 RHOQP17081 205 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP16.46■□□□□ 0.232e-7■□□□□ 10.2
SH3BP4-201ENST00000344528 SH3D19Q5HYK7 790 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 HEXDCQ8WVB3 486 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 CXorf40BQ96DE9 158 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 ABCC6O95255 1503 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 MSI1O43347 362 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 OR4Q2P0C623 313 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 CLCNKBP51801 687 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 NCF4Q15080 339 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 TXNDC11Q6PKC3 985 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 GPR141Q7Z602 305 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC24A3Q9HC58 644 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 SYBUQ9NX95 663 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 NDUFS2O75306 463 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 ULK1O75385 1050 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 EPN2O95208 641 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 C22orf31O95567 290 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 NTSP30990 170 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM26Q6ZUK4 368 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 RASGEF1CQ8N431 466 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC4A11Q8NBS3 891 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP16.46■□□□□ 0.233e-7■■□□□ 14.2
SH3BP4-201ENST00000344528 TIFAQ96CG3 184 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 PPP3R2Q96LZ3 170 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 FZD8Q9H461 694 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 EVA1BQ9NVM1 165 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 RWDD3Q9Y3V2 267 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 GRM6O15303 877 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 NOL4O94818 638 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF544Q6NX49 715 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 TRPC4APQ8TEL6 797 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 KLHL5Q96PQ7 755 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 CDRT15Q96T59 188 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 NDNQ99608 321 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 DMAC2Q9NW81 257 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 SLIT2O94813 1529 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 IZUMO2Q6UXV1 221 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 DET1Q7L5Y6 550 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF398Q8TD17 642 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM216Q9P0N5 145 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 MDM4O15151 490 aa16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.2 ms