RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325599.12

SHQ1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SHQ1, Length 2,879 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-201ENST00000325599 C17orf99Q6UX52 265 aa16.56■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 MIPOL1Q8TD10 442 aa16.56■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 RSPH1Q8WYR4 309 aa16.56■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 TRPV6Q9H1D0 765 aa16.56■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa16.56■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 RAP2CQ9Y3L5 183 aa16.56■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa16.56■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 TMEM233B4DJY2 109 aa16.56■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 TARM1B6A8C7 271 aa16.56■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 GPR182O15218 404 aa16.56■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 MATN3O15232 486 aa16.56■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 FKBP6O75344 327 aa16.56■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 CDC16Q13042 620 aa16.56■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 SEPT6Q14141 434 aa16.56■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 EML3Q32P44 896 aa16.56■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa16.56■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa16.56■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 STYXQ8WUJ0 223 aa16.56■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 GPR78Q96P69 363 aa16.56■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 ECSITQ9BQ95 431 aa16.56■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 OSER1Q9NX31 292 aa16.56■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa16.56■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 ACOT9Q9Y305 439 aa16.56■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 HDAC3O15379 428 aa16.55■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 DDHD2O94830 711 aa16.55■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 CYP11A1P05108 521 aa16.55■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 FUT4P22083 530 aa16.55■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 ADRA1AP35348 466 aa16.55■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 NUMBP49757 651 aa16.55■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 TAS2R39P59534 338 aa16.55■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 ASPHQ12797 758 aa16.55■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 TSTD2Q5T7W7 516 aa16.55■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 SEL1L3Q68CR1 1132 aa16.55■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 TSNARE1Q96NA8 513 aa16.55■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 ADAM2Q99965 735 aa16.55■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 ATXN10Q9UBB4 475 aa16.55■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa16.55■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF510Q9Y2H8 683 aa16.55■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 CABYRO75952 493 aa16.55■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 ANXA9O76027 345 aa16.55■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 PIK3R1P27986 724 aa16.55■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 CCR1P32246 355 aa16.55■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 DSG1Q02413 1049 aa16.55■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF789Q5FWF6 425 aa16.55■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 MANEALQ5VSG8 457 aa16.55■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF470Q6ECI4 717 aa16.55■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 SNX32Q86XE0 403 aa16.55■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 SCN4BQ8IWT1 228 aa16.55■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 FBXW8Q8N3Y1 598 aa16.55■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 CCNYL1Q8N7R7 359 aa16.55■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 GATA6Q92908 595 aa16.55■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 MRGPRX2Q96LB1 330 aa16.55■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 HAPLN3Q96S86 360 aa16.55■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 FSD1LQ9BXM9 530 aa16.55■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 ABCC13Q9NSE7 274 aa16.55■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 TCAF1Q9Y4C2 921 aa16.55■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 HS3ST4Q9Y661 456 aa16.55■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 NEMP2A6NFY4 417 aa16.54■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 M0QZQ0 153 aa16.54■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 TNFRSF10BO14763 440 aa16.54■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 PSMD3O43242 534 aa16.54■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 B4GALT3O60512 393 aa16.54■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 HADHAP40939 763 aa16.54■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 RAB10P61026 200 aa16.54■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 RASIP1Q5U651 963 aa16.54■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 FAM219BQ5XKK7 198 aa16.54■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 DHDDSQ86SQ9 333 aa16.54■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 ELMO2Q96JJ3 720 aa16.54■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 CATSPER2Q96P56 530 aa16.54■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 SCOCQ9UIL1 159 aa16.54■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 HTTP42858 3142 aa16.54■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 A0A1W2PQH9 124 aa16.54■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 E9PAM4 449 aa16.54■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 APOA4P06727 396 aa16.54■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 STMN1P16949 149 aa16.54■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 NUDT2P50583 147 aa16.54■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 INHBCP55103 352 aa16.54■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 USP46P62068 366 aa16.54■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF33AQ06730 810 aa16.54■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 METTL21CQ5VZV1 264 aa16.54■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 NXNQ6DKJ4 435 aa16.54■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 AAGABQ6PD74 315 aa16.54■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 CNTN4Q8IWV2 1026 aa16.54■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa16.54■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa16.54■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 DNAJB4Q9UDY4 337 aa16.54■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 AP3B1O00203 1094 aa16.53■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 CRABP2P29373 138 aa16.53■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 CYP2C18P33260 490 aa16.53■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 CD151P48509 253 aa16.53■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.7 ms