RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299314.11

GNPTAB-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 5,701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-201ENST00000299314 PPIL2Q13356 520 aa24.36■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 HYIQ5T013 277 aa24.36■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 ARMC8Q8IUR7 673 aa24.36■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa24.36■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 CPA4Q9UI42 421 aa24.36■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa24.36■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 ANKDD1BA6NHY2 528 aa24.36■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 NUDT14O95848 222 aa24.36■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 PYDC2Q56P42 97 aa24.36■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 AFTPHQ6ULP2 937 aa24.36■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP24.36■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 MYLPFQ96A32 169 aa24.36■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 MBD2Q9UBB5 411 aa24.36■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 AK5Q9Y6K8 562 aa24.36■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 BUD23O43709 281 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 CCNB1P14635 433 aa24.36■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 S100ZQ8WXG8 99 aa24.36■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 NELL1Q92832 810 aa24.36■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 STARD7Q9NQZ5 370 aa24.36■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 CLUHO75153 1309 aa24.36■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 FFAR3O14843 346 aa24.36■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 GPR42O15529 346 aa24.36■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 HGFP14210 728 aa24.36■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 CYP2C18P33260 490 aa24.36■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 MAPK9P45984 424 aa24.36■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 MMP14P50281 582 aa24.36■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 IL17AQ16552 155 aa24.36■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 QPCTQ16769 361 aa24.36■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 A0A1W2PPM1 405 aa24.36■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC28A1O00337 649 aa24.36■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 SERPINA4P29622 427 aa24.36■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 CCNIQ14094 377 aa24.36■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 SPIDRQ14159 915 aa24.36■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa24.36■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 DNAJC19Q96DA6 116 aa24.36■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 MECRQ9BV79 373 aa24.36■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 PSMD10O75832 226 aa24.35■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 RPL38P63173 70 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 TNS4Q8IZW8 715 aa24.35■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 SNX15Q9NRS6 342 aa24.35■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 PSMD11O00231 422 aa24.35■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 RECQL4O94761 1208 aa24.35■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 DEPDC4Q8N2C3 294 aa24.35■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 SENP8Q96LD8 212 aa24.35■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF670Q9BS34 389 aa24.35■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 ITSN1Q15811 1721 aa24.35■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 DHRS12A0PJE2 317 aa24.35■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 EDF1O60869 148 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 MAPKAPK2P49137 400 aa24.35■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 QPRTQ15274 297 aa24.35■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 SPATA6LQ8N4H0 392 aa24.35■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 HAS1Q92839 578 aa24.35■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa24.35■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 ZFP14Q9HCL3 533 aa24.35■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 FSCN2O14926 492 aa24.35■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 GUCY1B2O75343 617 aa24.35■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 MTA2O94776 668 aa24.35■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 ETS2P15036 469 aa24.35■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 MAGEC3Q8TD91 643 aa24.35■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 MAPRE3Q9UPY8 281 aa24.35■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 CORO2BQ9UQ03 480 aa24.35■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 DMTF1Q9Y222 760 aa24.35■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 SGTAO43765 313 aa24.34■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 IDH3BO43837 385 aa24.34■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 CYP4F2P78329 520 aa24.34■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 XIAPP98170 497 aa24.34■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 CYP4F3Q08477 520 aa24.34■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 ANGPT4Q9Y264 503 aa24.34■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa24.34■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 NPR3P17342 541 aa24.34■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 DENND6AQ8IWF6 608 aa24.34■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 GRIN3BO60391 1043 aa24.34■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 ITGA2P17301 1181 aa24.34■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 AMPD2Q01433 879 aa24.34■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 ATG14Q6ZNE5 492 aa24.34■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 BBS12Q6ZW61 710 aa24.34■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 LRRN4Q8WUT4 740 aa24.34■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 MARCH2Q9P0N8 246 aa24.34■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa24.34■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC5A9Q2M3M2 681 aa24.34■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa24.34■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 DET1Q7L5Y6 550 aa24.34■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 TRABD2AQ86V40 505 aa24.34■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 OR52L1Q8NGH7 329 aa24.34■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa24.34■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF846Q147U1 533 aa24.34■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 DEFB128Q7Z7B8 93 aa24.34■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 ELMO1Q92556 727 aa24.34■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 ASB8Q9H765 288 aa24.34■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 PNPOQ9NVS9 261 aa24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms