RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000281171.8

PTPRO-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRO, Length 5,301 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-201ENST00000281171 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 GLT1D1Q96MS3 346 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 EXD2Q9NVH0 621 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 FAM220BPB1ANY3 271 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 TSPAN1O60635 241 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 PLCL1Q15111 1095 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 PLEKHH3Q7Z736 793 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 ATG4CQ96DT6 458 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 ERGIC3Q9Y282 383 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 A0A1B0GVG6 124 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 S100A2P29034 98 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 MAPKAPK2P49137 400 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 HARS2P49590 506 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 CCNIQ14094 377 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 CNSTQ6PJW8 725 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 SPESP1Q6UW49 350 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 PDSS2Q86YH6 399 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 WDR49Q8IV35 697 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 ARMC7Q9H6L4 198 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 STARD7Q9NQZ5 370 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 K7EPI3 171 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 PSMA3P25788 255 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 CDC42P60953 191 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 CSNK2BP67870 215 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 TBC1D25Q3MII6 688 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 GALNTL6Q49A17 601 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 DDI2Q5TDH0 399 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 PARP8Q8N3A8 854 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 SNX27Q96L92 541 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 RCCD1A6NED2 376 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 TOR1BO14657 336 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 RGS10O43665 173 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 AVILO75366 819 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 DPEP1P16444 411 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 SEC23AQ15436 765 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 GPAT2Q6NUI2 795 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 FAM122CQ6P4D5 195 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 PKN3Q6P5Z2 889 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 SLC2A7Q6PXP3 512 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 REEP1Q9H902 201 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 ANKHQ9HCJ1 492 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 SNTG2Q9NY99 539 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF112Q9UJU3 913 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 TNS2Q63HR2 1409 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 NCAM2O15394 837 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 TIPRLO75663 272 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 PRDX6P30041 224 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 FEN1P39748 380 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 STX4Q12846 297 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 GRB10Q13322 594 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 SEMA3AQ14563 771 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 NODALQ96S42 347 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 SEMA6BQ9H3T3 888 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 KLHL1Q9NR64 748 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 PLA2G4CQ9UP65 541 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 AXLP30530 894 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 SDC2P34741 201 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 CLK3P49761 638 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 TTLL9Q3SXZ7 439 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 XKR5Q6UX68 686 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 DPP10Q8N608 796 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 PRAMEF10O60809 474 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP14.47□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 WDR59Q6PJI9 974 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 ARPC5LQ9BPX5 153 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 MTRRQ9UBK8 725 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 ERCC2P18074 760 aa14.46□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 AVPR1AP37288 418 aa14.46□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 LHX1P48742 406 aa14.46□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 MAB21L1Q13394 359 aa14.46□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 TIGD2Q4W5G0 525 aa14.46□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 DIRAS2Q96HU8 199 aa14.46□□□□□ -0.09
PTPRO-201ENST00000281171 ADI1Q9BV57 179 aa14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms