RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233072.9

CPS1-201, Transcript of carbamoyl-phosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CPS1, Length 5,821 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1-201ENST00000233072 DUSP10Q9Y6W6 482 aa7.28□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 ANKRD63C9JTQ0 380 aa7.28□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 AVILO75366 819 aa7.28□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 ADH1AP07327 375 aa7.28□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 PTPRAP18433 802 aa7.28□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 CYP3A5P20815 502 aa7.28□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 RBL1P28749 1068 aa7.28□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 MARSP56192 900 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 PWP1Q13610 501 aa7.28□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 LIPMQ5VYY2 423 aa7.28□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 RINLQ6ZS11 566 aa7.28□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa7.28□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 ZNF248Q8NDW4 579 aa7.28□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 DPF3Q92784 378 aa7.28□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 MTMR8Q96EF0 704 aa7.28□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 RNF145Q96MT1 663 aa7.28□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 IL25Q9H293 177 aa7.28□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa7.28□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 STON1Q9Y6Q2 735 aa7.28□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 ASTN1O14525 1302 aa7.28□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 DUOX1Q9NRD9 1551 aa7.28□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 H3BN98 237 aa7.28□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 SERPINA6P08185 405 aa7.28□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 NUDT17P0C025 328 aa7.28□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 CTSEP14091 401 aa7.28□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 KELP23276 732 aa7.28□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 GLRA2P23416 452 aa7.28□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa7.28□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 KRT77Q7Z794 578 aa7.28□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 COMMD2Q86X83 199 aa7.28□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 GATAD2AQ86YP4 633 aa7.28□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa7.28□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 FAM20CQ8IXL6 584 aa7.28□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 BHMTQ93088 406 aa7.28□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 MYLPFQ96A32 169 aa7.28□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 OR12D3Q9UGF7 316 aa7.28□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa7.28□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa7.28□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 ACSL4O60488 711 aa7.28□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 TPH1P17752 444 aa7.28□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 BDNFP23560 247 aa7.28□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 CHN2P52757 468 aa7.28□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 THOP1P52888 689 aa7.28□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 ACTR3P61158 418 aa7.28□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 KLHL35Q6PF15 583 aa7.28□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 CPA6Q8N4T0 437 aa7.28□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 RNF157Q96PX1 679 aa7.28□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 ZNF607Q96SK3 696 aa7.28□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 SEPHS2Q99611 448 aa7.28□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 TRMOQ9BU70 441 aa7.28□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 SMURF2Q9HAU4 748 aa7.28□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 UBP1Q9NZI7 540 aa7.28□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 GRM6O15303 877 aa7.27□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 DNAJA2O60884 412 aa7.27□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 PIGNO95427 931 aa7.27□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 UMPSP11172 480 aa7.27□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 COL6A2P12110 1019 aa7.27□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 CCNB1P14635 433 aa7.27□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 PSMB4P28070 264 aa7.27□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 ADSSP30520 456 aa7.27□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 MAP2K5Q13163 448 aa7.27□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 PARP15Q460N3 678 aa7.27□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 ERICH5Q6P6B1 374 aa7.27□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 FAM180AQ6UWF9 173 aa7.27□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa7.27□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 DENND6AQ8IWF6 608 aa7.27□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 COLGALT2Q8IYK4 626 aa7.27□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 PIK3C3Q8NEB9 887 aa7.27□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 EPS8L1Q8TE68 723 aa7.27□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 FNIP1Q8TF40 1166 aa7.27□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 SELENOMQ8WWX9 145 aa7.27□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 OR8D1Q8WZ84 308 aa7.27□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 KAZALD1Q96I82 304 aa7.27□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 FAXDC2Q96IV6 333 aa7.27□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 MBOAT7Q96N66 472 aa7.27□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 LACRTQ9GZZ8 138 aa7.27□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa7.27□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa7.27□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 LRRC10BA6NIK2 292 aa7.27□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 WNT10BO00744 389 aa7.27□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 COX4I1P13073 169 aa7.27□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 HTR1BP28222 390 aa7.27□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 CD86P42081 329 aa7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms