RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000224140.5

SETX-201, Transcript of senataxin, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SETX, Length 11,100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETX-201ENST00000224140 HSD3B7Q9H2F3 369 aa6.4□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 SMYD3Q9H7B4 428 aa6.4□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 ANLNQ9NQW6 1124 aa6.4□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 KCNE2Q9Y6J6 123 aa6.4□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 KCNH1O95259 989 aa6.4□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 RUNX1T1Q06455 604 aa6.4□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 KCNC3Q14003 757 aa6.4□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 PCSK7Q16549 785 aa6.4□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 PACS1Q6VY07 963 aa6.4□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 MAB21L3Q8N8X9 362 aa6.4□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 C3orf18Q9UK00 162 aa6.4□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 DHX15O43143 795 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 EPB42P16452 691 aa6.39□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 TNK2Q07912 1038 aa6.39□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 SEMA5AQ13591 1074 aa6.39□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa6.39□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 LONP2Q86WA8 852 aa6.39□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 CNTD1Q8N815 330 aa6.39□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa6.39□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 Q96MT0 163 aa6.39□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 SCN4AP35499 1836 aa6.39□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 ADM5C9JUS6 153 aa6.39□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 KREMEN1Q96MU8 473 aa6.39□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa6.39□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 FBXW11Q9UKB1 542 aa6.39□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 TPRKBQ9Y3C4 175 aa6.39□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa6.39□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa6.39□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 BTBD19C9JJ37 291 aa6.39□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 ITGA2BP08514 1039 aa6.39□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 LBPP18428 481 aa6.39□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 AUHQ13825 339 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 TREML2Q5T2D2 321 aa6.39□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 TRIM8Q9BZR9 551 aa6.39□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 PDZD7Q9H5P4 517 aa6.39□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 TMCC3Q9ULS5 477 aa6.39□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 ZNF623O75123 536 aa6.39□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 NSG1P42857 185 aa6.39□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 LRRC34Q8IZ02 419 aa6.39□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 FIBCD1Q8N539 461 aa6.39□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 C1orf127Q8N9H9 656 aa6.39□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 ATG4AQ8WYN0 398 aa6.39□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 SUSD3Q96L08 255 aa6.39□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 NSMCE2Q96MF7 247 aa6.39□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 POLD4Q9HCU8 107 aa6.39□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa6.39□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 KCNU1A8MYU2 1149 aa6.39□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 LIMK2P53671 638 aa6.39□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 C6orf10Q5SRN2 563 aa6.39□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 ANXA8L1Q5VT79 327 aa6.39□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 EMC1Q8N766 993 aa6.39□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 TTLQ8NG68 377 aa6.39□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 TRPM4Q8TD43 1214 aa6.39□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 CASS4Q9NQ75 786 aa6.39□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 A0A0U1RQF3 1178 aa6.39□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 CASTOR2A6NHX0 329 aa6.39□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 GOLGA8RI6L899 631 aa6.39□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 BDNFP23560 247 aa6.39□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 LRPAP1P30533 357 aa6.39□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 CDH8P55286 799 aa6.39□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 POU6F1Q14863 301 aa6.39□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 PTPN20Q4JDL3 420 aa6.39□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 CDK20Q8IZL9 346 aa6.39□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 FCRL5Q96RD9 977 aa6.39□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 TRIB3Q96RU7 358 aa6.39□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 SLC40A1Q9NP59 571 aa6.39□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 NFICP08651 508 aa6.39□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 SSTR1P30872 391 aa6.39□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 GRIK2Q13002 908 aa6.39□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 ERICH5Q6P6B1 374 aa6.39□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 NECAB2Q7Z6G3 386 aa6.39□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 P2RY11Q96G91 374 aa6.39□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 RNF145Q96MT1 663 aa6.39□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa6.39□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 NT5MQ9NPB1 228 aa6.39□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 UBP1Q9NZI7 540 aa6.39□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 AURKCQ9UQB9 309 aa6.39□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 ARHGAP1Q07960 439 aa6.39□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 GPSM1Q86YR5 675 aa6.39□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa6.39□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 OR4L1Q8NH43 312 aa6.39□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa6.39□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa6.39□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 TBC1D23Q9NUY8 699 aa6.39□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms