RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019982.8

Gtf3c6-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c6, Length 887 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 ItgavP43406 1044 aa11.34□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Specc1lQ2KN98 1118 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fahd2Q3TC72 313 aa11.34□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Prickle1Q3U5C7 832 aa11.34□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Defb46Q4QY34 57 aa11.34□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Clec12aQ504P2 267 aa11.34□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Prss53Q571E5 552 aa11.34□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nemp1Q6ZQE4 437 aa11.34□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Kiaa1671Q8BRV5 308 aa11.34□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Trerf1Q8BXJ2 1205 aa11.34□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Prr33Q8C494 260 aa11.34□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pias2Q8C5D8 621 aa11.34□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sept10Q8C650 452 aa11.34□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 A430089I19RikQ8C9W1 407 aa11.34□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Crispld1Q8CGD2 500 aa11.34□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Upp2Q8CGR7 320 aa11.34□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Irf2bp1Q8R3Y8 584 aa11.34□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Akr1c14Q91WT7 323 aa11.34□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mgrn1Q9D074 532 aa11.34□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 ApmapQ9D7N9 415 aa11.34□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 IscuQ9D7P6 168 aa11.34□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Marveld3Q9D956 376 aa11.34□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Xpo4Q9ESJ0 1151 aa11.34□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 TesminQ9WTJ6 475 aa11.34□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pkd1l2Q7TN88 2461 aa11.33□□□□□ -0.6
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zfyve26Q5DU37 2529 aa11.33□□□□□ -0.6
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Akap13E9Q394 2776 aa11.33□□□□□ -0.6
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zfp985A2A7A5 519 aa11.33□□□□□ -0.6
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 ErmardE9Q048 622 aa11.33□□□□□ -0.6
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 IlkO55222 452 aa11.33□□□□□ -0.6
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 PrlP06879 226 aa11.33□□□□□ -0.6
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mthfd2P18155 350 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pou2f3P31362 431 aa11.33□□□□□ -0.6
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mybl1P51960 751 aa11.33□□□□□ -0.6
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fgf11P70378 225 aa11.33□□□□□ -0.6
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 AurkaP97477 395 aa11.33□□□□□ -0.6
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tle3Q08122 772 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm14685Q52KH6 695 aa11.33□□□□□ -0.6
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Bpifb1Q61114 474 aa11.33□□□□□ -0.6
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Map3k10Q66L42 940 aa11.33□□□□□ -0.6
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Naaladl1Q7M758 745 aa11.33□□□□□ -0.6
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zfp719Q8BIV1 735 aa11.33□□□□□ -0.6
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 B430218F22RikQ8BQR5 223 aa11.33□□□□□ -0.6
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sh3rf3Q8C120 878 aa11.33□□□□□ -0.6
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pex5lQ8C437 567 aa11.33□□□□□ -0.6
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc5a11Q8K0E3 673 aa11.33□□□□□ -0.6
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fermt3Q8K1B8 665 aa11.33□□□□□ -0.6
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nup85Q8R480 656 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Erlec1Q8VEH8 483 aa11.33□□□□□ -0.6
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Bzw2Q91VK1 419 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rev1Q920Q2 1249 aa11.33□□□□□ -0.6
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Eps8l2Q99K30 729 aa11.33□□□□□ -0.6
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pex6Q99LC9 981 aa11.33□□□□□ -0.6
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ergic2Q9CR89 377 aa11.33□□□□□ -0.6
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fam227bQ9D518 532 aa11.33□□□□□ -0.6
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 ParvbQ9ES46 365 aa11.33□□□□□ -0.6
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 IdeQ9JHR7 1019 aa11.33□□□□□ -0.6
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Utp3Q9JI13 469 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fhl5Q9WTX7 284 aa11.33□□□□□ -0.6
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Map3k14Q9WUL6 942 aa11.33□□□□□ -0.6
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ranbp2Q9ERU9 3053 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 C7D3YXF5 845 aa11.32□□□□□ -0.6
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 P01810 119 aa11.32□□□□□ -0.6
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Csf2rbP26955 896 aa11.32□□□□□ -0.6
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gdf5P43027 495 aa11.32□□□□□ -0.6
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Anks1aP59672 1150 aa11.32□□□□□ -0.6
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 SiaeP70665 541 aa11.32□□□□□ -0.6
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ncf4P97369 339 aa11.32□□□□□ -0.6
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 CxadrP97792 365 aa11.32□□□□□ -0.6
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Bex6Q3TZW7 114 aa11.32□□□□□ -0.6
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Prss38Q3UKY7 322 aa11.32□□□□□ -0.6
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lsmem1Q3UQS2 128 aa11.32□□□□□ -0.6
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ppm1hQ3UYC0 513 aa11.32□□□□□ -0.6
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 AcrbpQ3V140 540 aa11.32□□□□□ -0.6
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Abl2Q4JIM5 1182 aa11.32□□□□□ -0.6
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 AcdQ5EE38 416 aa11.32□□□□□ -0.6
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ostf1Q62422 215 aa11.32□□□□□ -0.6
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zic5Q7TQ40 622 aa11.32□□□□□ -0.6
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rxfp4Q7TQP4 414 aa11.32□□□□□ -0.6
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 RflnaQ7TS73 204 aa11.32□□□□□ -0.6
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gabbr2Q80T41 940 aa11.32□□□□□ -0.6
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zbtb41Q811F1 908 aa11.32□□□□□ -0.6
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Necab1Q8BG18 352 aa11.32□□□□□ -0.6
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Hpcal4Q8BGZ1 191 aa11.32□□□□□ -0.6
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nlrp4bQ8C6J9 863 aa11.32□□□□□ -0.6
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Scamp1Q8K021 338 aa11.32□□□□□ -0.6
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm42417Q8K1D0 126 aa11.32□□□□□ -0.6
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Kcnk13Q8R1P5 405 aa11.32□□□□□ -0.6
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nop14Q8R3N1 860 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pcdhb1Q91Y08 818 aa11.32□□□□□ -0.6
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ugp2Q91ZJ5 508 aa11.32□□□□□ -0.6
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gtpbp3Q923K4 492 aa11.32□□□□□ -0.6
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gprc5bQ923Z0 410 aa11.32□□□□□ -0.6
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rrp15Q9CYX7 281 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 2010109A12RikQ9D875 119 aa11.32□□□□□ -0.6
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Adam21Q9JI76 729 aa11.32□□□□□ -0.6
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rnf32Q9JIT1 368 aa11.32□□□□□ -0.6
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 PnkpQ9JLV6 522 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nfu1Q9QZ23 255 aa11.32□□□□□ -0.6
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 ArntlQ9WTL8 632 aa11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 37 ms