RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597315.5

BRD4-208, Transcript of bromodomain containing 4, humanhuman

TSL 5

Gene BRD4, Length 892 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD4-208ENST00000597315 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa27.37■■□□□ 1.97
BRD4-208ENST00000597315 NEK5Q6P3R8 708 aa27.37■■□□□ 1.97
BRD4-208ENST00000597315 TMCO3Q6UWJ1 677 aa27.37■■□□□ 1.97
BRD4-208ENST00000597315 TRIM69Q86WT6 500 aa27.37■■□□□ 1.97
BRD4-208ENST00000597315 SLC6A18Q96N87 628 aa27.37■■□□□ 1.97
BRD4-208ENST00000597315 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa27.37■■□□□ 1.97
BRD4-208ENST00000597315 RBSNQ9H1K0 784 aa27.37■■□□□ 1.97
BRD4-208ENST00000597315 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa27.37■■□□□ 1.97
BRD4-208ENST00000597315 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
BRD4-208ENST00000597315 PROSCO94903 275 aa27.36■■□□□ 1.97
BRD4-208ENST00000597315 CD38P28907 300 aa27.36■■□□□ 1.97
BRD4-208ENST00000597315 CDH6P55285 790 aa27.36■■□□□ 1.97
BRD4-208ENST00000597315 SLC14A1Q13336 389 aa27.36■■□□□ 1.97
BRD4-208ENST00000597315 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
BRD4-208ENST00000597315 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa27.36■■□□□ 1.97
BRD4-208ENST00000597315 DMTF1Q9Y222 760 aa27.36■■□□□ 1.97
BRD4-208ENST00000597315 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa27.36■■□□□ 1.97
BRD4-208ENST00000597315 PCDH15Q96QU1 1955 aa27.36■■□□□ 1.97
BRD4-208ENST00000597315 PRAMEF11O60813 436 aa27.35■■□□□ 1.97
BRD4-208ENST00000597315 ADRB3P13945 408 aa27.35■■□□□ 1.97
BRD4-208ENST00000597315 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
BRD4-208ENST00000597315 SERPINB6P35237 376 aa27.35■■□□□ 1.97
BRD4-208ENST00000597315 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
BRD4-208ENST00000597315 DPYSQ14117 519 aa27.35■■□□□ 1.97
BRD4-208ENST00000597315 HLA-BQ31612 363 aa27.35■■□□□ 1.97
BRD4-208ENST00000597315 ZNF805Q5CZA5 627 aa27.35■■□□□ 1.97
BRD4-208ENST00000597315 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa27.35■■□□□ 1.97
BRD4-208ENST00000597315 POLNQ7Z5Q5 900 aa27.35■■□□□ 1.97
BRD4-208ENST00000597315 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa27.34■■□□□ 1.97
BRD4-208ENST00000597315 J3KR12 359 aa27.34■■□□□ 1.97
BRD4-208ENST00000597315 NEMP1O14524 444 aa27.34■■□□□ 1.97
BRD4-208ENST00000597315 LATO43561 262 aa27.34■■□□□ 1.97
BRD4-208ENST00000597315 PALMO75781 387 aa27.34■■□□□ 1.97
BRD4-208ENST00000597315 UGT2B4P06133 528 aa27.34■■□□□ 1.97
BRD4-208ENST00000597315 AMPD1P23109 780 aa27.34■■□□□ 1.97
BRD4-208ENST00000597315 GKP32189 559 aa27.34■■□□□ 1.97
BRD4-208ENST00000597315 ZNF75DP51815 510 aa27.34■■□□□ 1.97
BRD4-208ENST00000597315 STAT4Q14765 748 aa27.34■■□□□ 1.97
BRD4-208ENST00000597315 KIF19Q2TAC6 998 aa27.34■■□□□ 1.97
BRD4-208ENST00000597315 RHOT2Q8IXI1 618 aa27.34■■□□□ 1.97
BRD4-208ENST00000597315 CSPG4P5Q96PW8 444 aa27.34■■□□□ 1.97
BRD4-208ENST00000597315 ORAI3Q9BRQ5 295 aa27.34■■□□□ 1.97
BRD4-208ENST00000597315 EBF2Q9HAK2 575 aa27.34■■□□□ 1.97
BRD4-208ENST00000597315 PCDH18Q9HCL0 1135 aa27.34■■□□□ 1.97
BRD4-208ENST00000597315 SNX11Q9Y5W9 270 aa27.34■■□□□ 1.97
BRD4-208ENST00000597315 A0A1W2PQU0 124 aa27.33■■□□□ 1.97
BRD4-208ENST00000597315 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
BRD4-208ENST00000597315 C16orf96A6NNT2 1141 aa27.33■■□□□ 1.97
BRD4-208ENST00000597315 VILLO15195 856 aa27.33■■□□□ 1.97
BRD4-208ENST00000597315 KRT7P08729 469 aa27.33■■□□□ 1.97
BRD4-208ENST00000597315 CEACAM1P13688 526 aa27.33■■□□□ 1.97
BRD4-208ENST00000597315 TAS2R38P59533 333 aa27.33■■□□□ 1.97
BRD4-208ENST00000597315 MESDQ14696 234 aa27.33■■□□□ 1.97
BRD4-208ENST00000597315 GRM3Q14832 879 aa27.33■■□□□ 1.97
BRD4-208ENST00000597315 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa27.33■■□□□ 1.97
BRD4-208ENST00000597315 LAYNQ6UX15 382 aa27.33■■□□□ 1.97
BRD4-208ENST00000597315 GDPD4Q6W3E5 623 aa27.33■■□□□ 1.97
BRD4-208ENST00000597315 HORMAD1Q86X24 394 aa27.33■■□□□ 1.97
BRD4-208ENST00000597315 MAP7D3Q8IWC1 876 aa27.33■■□□□ 1.97
BRD4-208ENST00000597315 NETO2Q8NC67 525 aa27.33■■□□□ 1.97
BRD4-208ENST00000597315 KCTD6Q8NC69 237 aa27.33■■□□□ 1.97
BRD4-208ENST00000597315 DEFB124Q8NES8 71 aa27.33■■□□□ 1.97
BRD4-208ENST00000597315 SLC35G2Q8TBE7 412 aa27.33■■□□□ 1.97
BRD4-208ENST00000597315 RAB7BQ96AH8 199 aa27.33■■□□□ 1.97
BRD4-208ENST00000597315 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa27.33■■□□□ 1.97
BRD4-208ENST00000597315 KLHL32Q96NJ5 620 aa27.33■■□□□ 1.97
BRD4-208ENST00000597315 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
BRD4-208ENST00000597315 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
BRD4-208ENST00000597315 DCHS1Q96JQ0 3298 aa27.33■■□□□ 1.96
BRD4-208ENST00000597315 CACNA1EQ15878 2313 aa27.32■■□□□ 1.96
BRD4-208ENST00000597315 UPK3BL1B0FP48 263 aa27.32■■□□□ 1.96
BRD4-208ENST00000597315 UPK3BL2E5RIL1 263 aa27.32■■□□□ 1.96
BRD4-208ENST00000597315 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa27.32■■□□□ 1.96
BRD4-208ENST00000597315 MAGEC1O60732 1142 aa27.32■■□□□ 1.96
BRD4-208ENST00000597315 XPAP23025 273 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
BRD4-208ENST00000597315 IL10RBQ08334 325 aa27.32■■□□□ 1.96
BRD4-208ENST00000597315 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
BRD4-208ENST00000597315 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
BRD4-208ENST00000597315 CYTH1Q15438 398 aa27.32■■□□□ 1.96
BRD4-208ENST00000597315 CFAP58Q5T655 872 aa27.32■■□□□ 1.96
BRD4-208ENST00000597315 AFMIDQ63HM1 303 aa27.32■■□□□ 1.96
BRD4-208ENST00000597315 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
BRD4-208ENST00000597315 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa27.32■■□□□ 1.96
BRD4-208ENST00000597315 NPWQ8N729 165 aa27.32■■□□□ 1.96
BRD4-208ENST00000597315 PAF1Q8N7H5 531 aa27.32■■□□□ 1.96
BRD4-208ENST00000597315 NSMCE1Q8WV22 266 aa27.32■■□□□ 1.96
BRD4-208ENST00000597315 FEM1CQ96JP0 617 aa27.32■■□□□ 1.96
BRD4-208ENST00000597315 EXOC2Q96KP1 924 aa27.32■■□□□ 1.96
BRD4-208ENST00000597315 CALN1Q9BXU9 219 aa27.32■■□□□ 1.96
BRD4-208ENST00000597315 PDFQ9HBH1 243 aa27.32■■□□□ 1.96
BRD4-208ENST00000597315 TM7SF3Q9NS93 570 aa27.32■■□□□ 1.96
BRD4-208ENST00000597315 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
BRD4-208ENST00000597315 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa27.32■■□□□ 1.96
BRD4-208ENST00000597315 RNF103O00237 685 aa27.31■■□□□ 1.96
BRD4-208ENST00000597315 SLC31A1O15431 190 aa27.31■■□□□ 1.96
BRD4-208ENST00000597315 DFNA5O60443 496 aa27.31■■□□□ 1.96
BRD4-208ENST00000597315 MAN1A1P33908 653 aa27.31■■□□□ 1.96
BRD4-208ENST00000597315 BNC1Q01954 994 aa27.31■■□□□ 1.96
BRD4-208ENST00000597315 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa27.31■■□□□ 1.96
BRD4-208ENST00000597315 TC2NQ8N9U0 490 aa27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.3 ms