RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589475.1

EFTUD2-213, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 200 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-213ENST00000589475 CALCOCO2Q13137 446 aa5.55□□□□□ -1.52
EFTUD2-213ENST00000589475 SNX1Q13596 522 aa5.55□□□□□ -1.52
EFTUD2-213ENST00000589475 PTK6Q13882 451 aa5.55□□□□□ -1.52
EFTUD2-213ENST00000589475 PRPSAP1Q14558 356 aa5.55□□□□□ -1.52
EFTUD2-213ENST00000589475 LBRQ14739 615 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
EFTUD2-213ENST00000589475 GRM3Q14832 879 aa5.55□□□□□ -1.52
EFTUD2-213ENST00000589475 SLC14A2Q15849 920 aa5.55□□□□□ -1.52
EFTUD2-213ENST00000589475 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP5.55□□□□□ -1.52
EFTUD2-213ENST00000589475 FUT11Q495W5 492 aa5.55□□□□□ -1.52
EFTUD2-213ENST00000589475 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
EFTUD2-213ENST00000589475 FBXO43Q4G163 708 aa5.55□□□□□ -1.52
EFTUD2-213ENST00000589475 TEX44Q53QW1 395 aa5.55□□□□□ -1.52
EFTUD2-213ENST00000589475 FSCBQ5H9T9 825 aa5.55□□□□□ -1.52
EFTUD2-213ENST00000589475 TEX35Q5T0J7 233 aa5.55□□□□□ -1.52
EFTUD2-213ENST00000589475 MBLAC2Q68D91 279 aa5.55□□□□□ -1.52
EFTUD2-213ENST00000589475 TTC27Q6P3X3 843 aa5.55□□□□□ -1.52
EFTUD2-213ENST00000589475 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa5.55□□□□□ -1.52
EFTUD2-213ENST00000589475 CEP128Q6ZU80 1094 aa5.55□□□□□ -1.52
EFTUD2-213ENST00000589475 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
EFTUD2-213ENST00000589475 PCGF5Q86SE9 256 aa5.55□□□□□ -1.52
EFTUD2-213ENST00000589475 UBALD2Q8IYN6 164 aa5.55□□□□□ -1.52
EFTUD2-213ENST00000589475 TEX26Q8N6G2 289 aa5.55□□□□□ -1.52
EFTUD2-213ENST00000589475 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
EFTUD2-213ENST00000589475 FAM71DQ8N9W8 422 aa5.55□□□□□ -1.52
EFTUD2-213ENST00000589475 WFDC5Q8TCV5 224 aa5.55□□□□□ -1.52
EFTUD2-213ENST00000589475 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
EFTUD2-213ENST00000589475 ALG14Q96F25 216 aa5.55□□□□□ -1.52
EFTUD2-213ENST00000589475 SHDQ96IW2 340 aa5.55□□□□□ -1.52
EFTUD2-213ENST00000589475 LMLNQ96KR4 655 aa5.55□□□□□ -1.52
EFTUD2-213ENST00000589475 PSKH2Q96QS6 385 aa5.55□□□□□ -1.52
EFTUD2-213ENST00000589475 PNKPQ96T60 521 aa5.55□□□□□ -1.52
EFTUD2-213ENST00000589475 IL12RB2Q99665 862 aa5.55□□□□□ -1.52
EFTUD2-213ENST00000589475 P2RY13Q9BPV8 354 aa5.55□□□□□ -1.52
EFTUD2-213ENST00000589475 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
EFTUD2-213ENST00000589475 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
EFTUD2-213ENST00000589475 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa5.55□□□□□ -1.52
EFTUD2-213ENST00000589475 GRIP2Q9C0E4 1043 aa5.55□□□□□ -1.52
EFTUD2-213ENST00000589475 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
EFTUD2-213ENST00000589475 TSPYL1Q9H0U9 437 aa5.55□□□□□ -1.52
EFTUD2-213ENST00000589475 PDFQ9HBH1 243 aa5.55□□□□□ -1.52
EFTUD2-213ENST00000589475 USP29Q9HBJ7 922 aa5.55□□□□□ -1.52
EFTUD2-213ENST00000589475 VPS45Q9NRW7 570 aa5.55□□□□□ -1.52
EFTUD2-213ENST00000589475 FAM114A2Q9NRY5 505 aa5.55□□□□□ -1.52
EFTUD2-213ENST00000589475 ELOVL2Q9NXB9 296 aa5.55□□□□□ -1.52
EFTUD2-213ENST00000589475 GTSE1Q9NYZ3 720 aa5.55□□□□□ -1.52
EFTUD2-213ENST00000589475 SEPT10Q9P0V9 454 aa5.55□□□□□ -1.52
EFTUD2-213ENST00000589475 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
EFTUD2-213ENST00000589475 ASIC3Q9UHC3 531 aa5.55□□□□□ -1.52
EFTUD2-213ENST00000589475 VPS51Q9UID3 782 aa5.55□□□□□ -1.52
EFTUD2-213ENST00000589475 PLA2G4CQ9UP65 541 aa5.55□□□□□ -1.52
EFTUD2-213ENST00000589475 SORCS3Q9UPU3 1222 aa5.55□□□□□ -1.52
EFTUD2-213ENST00000589475 HS3ST2Q9Y278 367 aa5.55□□□□□ -1.52
EFTUD2-213ENST00000589475 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
EFTUD2-213ENST00000589475 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa5.55□□□□□ -1.52
EFTUD2-213ENST00000589475 PIAS3Q9Y6X2 628 aa5.55□□□□□ -1.52
EFTUD2-213ENST00000589475 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa5.54□□□□□ -1.52
EFTUD2-213ENST00000589475 A0A1W2PQ67 120 aa5.54□□□□□ -1.52
EFTUD2-213ENST00000589475 TBC1D3BA6NDS4 549 aa5.54□□□□□ -1.52
EFTUD2-213ENST00000589475 TMEM229AB2RXF0 380 aa5.54□□□□□ -1.52
EFTUD2-213ENST00000589475 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa5.54□□□□□ -1.52
EFTUD2-213ENST00000589475 KCNK1O00180 336 aa5.54□□□□□ -1.52
EFTUD2-213ENST00000589475 AP3B1O00203 1094 aa5.54□□□□□ -1.52
EFTUD2-213ENST00000589475 TTI1O43156 1089 aa5.54□□□□□ -1.52
EFTUD2-213ENST00000589475 RAD51CO43502 376 aa5.54□□□□□ -1.52
EFTUD2-213ENST00000589475 ZMPSTE24O75844 475 aa5.54□□□□□ -1.52
EFTUD2-213ENST00000589475 TMCC1O94876 653 aa5.54□□□□□ -1.52
EFTUD2-213ENST00000589475 KAT7O95251 611 aa5.54□□□□□ -1.52
EFTUD2-213ENST00000589475 MAP3K6O95382 1288 aa5.54□□□□□ -1.52
EFTUD2-213ENST00000589475 IGSF6O95976 241 aa5.54□□□□□ -1.52
EFTUD2-213ENST00000589475 GSRP00390 522 aa5.54□□□□□ -1.52
EFTUD2-213ENST00000589475 JCHAINP01591 159 aa5.54□□□□□ -1.52
EFTUD2-213ENST00000589475 SERPINF2P08697 491 aa5.54□□□□□ -1.52
EFTUD2-213ENST00000589475 GPC1P35052 558 aa5.54□□□□□ -1.52
EFTUD2-213ENST00000589475 ADCY8P40145 1251 aa5.54□□□□□ -1.52
EFTUD2-213ENST00000589475 OPRD1P41143 372 aa5.54□□□□□ -1.52
EFTUD2-213ENST00000589475 TNFRSF4P43489 277 aa5.54□□□□□ -1.52
EFTUD2-213ENST00000589475 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
EFTUD2-213ENST00000589475 KCNJ1P48048 391 aa5.54□□□□□ -1.52
EFTUD2-213ENST00000589475 CSNK1DP48730 415 aa5.54□□□□□ -1.52
EFTUD2-213ENST00000589475 DRG2P55039 364 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
EFTUD2-213ENST00000589475 GEMP55040 296 aa5.54□□□□□ -1.52
EFTUD2-213ENST00000589475 GDF10P55107 478 aa5.54□□□□□ -1.52
EFTUD2-213ENST00000589475 RHOAP61586 193 aa5.54□□□□□ -1.52
EFTUD2-213ENST00000589475 AP1S1P61966 158 aa5.54□□□□□ -1.52
EFTUD2-213ENST00000589475 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
EFTUD2-213ENST00000589475 SARNPP82979 210 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
EFTUD2-213ENST00000589475 CAV1Q03135 178 aa5.54□□□□□ -1.52
EFTUD2-213ENST00000589475 TFF2Q03403 129 aa5.54□□□□□ -1.52
EFTUD2-213ENST00000589475 KDSRQ06136 332 aa5.54□□□□□ -1.52
EFTUD2-213ENST00000589475 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP5.54□□□□□ -1.52
EFTUD2-213ENST00000589475 CUL1Q13616 776 aa5.54□□□□□ -1.52
EFTUD2-213ENST00000589475 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
EFTUD2-213ENST00000589475 PARP6Q2NL67 630 aa5.54□□□□□ -1.52
EFTUD2-213ENST00000589475 GAB4Q2WGN9 574 aa5.54□□□□□ -1.52
EFTUD2-213ENST00000589475 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa5.54□□□□□ -1.52
EFTUD2-213ENST00000589475 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa5.54□□□□□ -1.52
EFTUD2-213ENST00000589475 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa5.54□□□□□ -1.52
EFTUD2-213ENST00000589475 ALG1LQ6GMV1 187 aa5.54□□□□□ -1.52
EFTUD2-213ENST00000589475 C22orf39Q6P5X5 142 aa5.54□□□□□ -1.52
EFTUD2-213ENST00000589475 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa5.54□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.1 ms