RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574322.5

CTDNEP1-210, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-210ENST00000574322 PIGWQ7Z7B1 504 aa28.82■■■□□ 2.2
CTDNEP1-210ENST00000574322 ELMOD1Q8N336 334 aa28.82■■■□□ 2.2
CTDNEP1-210ENST00000574322 GDPD5Q8WTR4 605 aa28.82■■■□□ 2.2
CTDNEP1-210ENST00000574322 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP28.82■■■□□ 2.2
CTDNEP1-210ENST00000574322 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP28.82■■■□□ 2.2
CTDNEP1-210ENST00000574322 SMPD4Q9NXE4 827 aa28.82■■■□□ 2.2
CTDNEP1-210ENST00000574322 TCP11X1B4DZS4 312 aa28.81■■■□□ 2.2
CTDNEP1-210ENST00000574322 VIMP08670 466 aaKnown RBP28.81■■■□□ 2.2
CTDNEP1-210ENST00000574322 DHRS4L1P0CG22 281 aa28.81■■■□□ 2.2
CTDNEP1-210ENST00000574322 TAC1P20366 129 aa28.81■■■□□ 2.2
CTDNEP1-210ENST00000574322 CD86P42081 329 aa28.81■■■□□ 2.2
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZXDBP98169 803 aa28.81■■■□□ 2.2
CTDNEP1-210ENST00000574322 DSC2Q02487 901 aa28.81■■■□□ 2.2
CTDNEP1-210ENST00000574322 PDK4Q16654 411 aa28.81■■■□□ 2.2
CTDNEP1-210ENST00000574322 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa28.81■■■□□ 2.2
CTDNEP1-210ENST00000574322 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP28.81■■■□□ 2.2
CTDNEP1-210ENST00000574322 LVRNQ6Q4G3 990 aa28.81■■■□□ 2.2
CTDNEP1-210ENST00000574322 OR7D4Q8NG98 312 aa28.81■■■□□ 2.2
CTDNEP1-210ENST00000574322 ACMSDQ8TDX5 336 aa28.81■■■□□ 2.2
CTDNEP1-210ENST00000574322 RANBP9Q96S59 729 aa28.81■■■□□ 2.2
CTDNEP1-210ENST00000574322 CPQQ9Y646 472 aa28.81■■■□□ 2.2
CTDNEP1-210ENST00000574322 CHD7Q9P2D1 2997 aa28.81■■■□□ 2.2
CTDNEP1-210ENST00000574322 CSPG5O95196 566 aa28.8■■■□□ 2.2
CTDNEP1-210ENST00000574322 RHOCP08134 193 aa28.8■■■□□ 2.2
CTDNEP1-210ENST00000574322 ADRA1DP25100 572 aa28.8■■■□□ 2.2
CTDNEP1-210ENST00000574322 NMBRP28336 390 aa28.8■■■□□ 2.2
CTDNEP1-210ENST00000574322 FOXN2P32314 431 aa28.8■■■□□ 2.2
CTDNEP1-210ENST00000574322 ETV4P43268 484 aa28.8■■■□□ 2.2
CTDNEP1-210ENST00000574322 MAXP61244 160 aa28.8■■■□□ 2.2
CTDNEP1-210ENST00000574322 IHHQ14623 411 aa28.8■■■□□ 2.2
CTDNEP1-210ENST00000574322 HHATQ5VTY9 493 aa28.8■■■□□ 2.2
CTDNEP1-210ENST00000574322 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP28.8■■■□□ 2.2
CTDNEP1-210ENST00000574322 HS6ST3Q8IZP7 471 aa28.8■■■□□ 2.2
CTDNEP1-210ENST00000574322 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP28.8■■■□□ 2.2
CTDNEP1-210ENST00000574322 VPS11Q9H270 941 aa28.8■■■□□ 2.2
CTDNEP1-210ENST00000574322 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP28.8■■■□□ 2.2
CTDNEP1-210ENST00000574322 GRID1Q9ULK0 1009 aa28.8■■■□□ 2.2
CTDNEP1-210ENST00000574322 TCAF1Q9Y4C2 921 aa28.8■■■□□ 2.2
CTDNEP1-210ENST00000574322 PSAT1Q9Y617 370 aa28.8■■■□□ 2.2
CTDNEP1-210ENST00000574322 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa28.8■■■□□ 2.2
CTDNEP1-210ENST00000574322 ALADP13716 330 aa28.8■■■□□ 2.2
CTDNEP1-210ENST00000574322 DNAJB1P25685 340 aa28.8■■■□□ 2.2
CTDNEP1-210ENST00000574322 ITKQ08881 620 aa28.8■■■□□ 2.2
CTDNEP1-210ENST00000574322 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP28.8■■■□□ 2.2
CTDNEP1-210ENST00000574322 BMPR2Q13873 1038 aa28.8■■■□□ 2.2
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF697Q5TEC3 545 aa28.8■■■□□ 2.2
CTDNEP1-210ENST00000574322 MROH9Q5TGP6 573 aa28.8■■■□□ 2.2
CTDNEP1-210ENST00000574322 PDPK2PQ6A1A2 396 aa28.8■■■□□ 2.2
CTDNEP1-210ENST00000574322 BBS5Q8N3I7 341 aa28.8■■■□□ 2.2
CTDNEP1-210ENST00000574322 PRKD2Q9BZL6 878 aa28.8■■■□□ 2.2
CTDNEP1-210ENST00000574322 TLR9Q9NR96 1032 aa28.8■■■□□ 2.2
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF510Q9Y2H8 683 aa28.8■■■□□ 2.2
CTDNEP1-210ENST00000574322 HIDE1A8MVS5 230 aa28.79■■■□□ 2.2
CTDNEP1-210ENST00000574322 RFXAPO00287 272 aa28.79■■■□□ 2.2
CTDNEP1-210ENST00000574322 EPOP01588 193 aa28.79■■■□□ 2.2
CTDNEP1-210ENST00000574322 CLCN4P51793 760 aa28.79■■■□□ 2.2
CTDNEP1-210ENST00000574322 OXCT1P55809 520 aa28.79■■■□□ 2.2
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF235Q14590 738 aa28.79■■■□□ 2.2
CTDNEP1-210ENST00000574322 IL31Q6EBC2 164 aa28.79■■■□□ 2.2
CTDNEP1-210ENST00000574322 HTR3DQ70Z44 454 aa28.79■■■□□ 2.2
CTDNEP1-210ENST00000574322 KCNMB4Q86W47 210 aa28.79■■■□□ 2.2
CTDNEP1-210ENST00000574322 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP28.79■■■□□ 2.2
CTDNEP1-210ENST00000574322 SEC16BQ96JE7 1060 aa28.79■■■□□ 2.2
CTDNEP1-210ENST00000574322 PSKH2Q96QS6 385 aa28.79■■■□□ 2.2
CTDNEP1-210ENST00000574322 MGME1Q9BQP7 344 aa28.79■■■□□ 2.2
CTDNEP1-210ENST00000574322 MCMBPQ9BTE3 642 aa28.79■■■□□ 2.2
CTDNEP1-210ENST00000574322 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa28.79■■■□□ 2.2
CTDNEP1-210ENST00000574322 SEPT3Q9UH03 358 aa28.79■■■□□ 2.2
CTDNEP1-210ENST00000574322 MIA3Q5JRA6 1907 aa28.79■■■□□ 2.2
CTDNEP1-210ENST00000574322 COPEO14579 308 aa28.78■■■□□ 2.2
CTDNEP1-210ENST00000574322 EPHA5P54756 1037 aa28.78■■■□□ 2.2
CTDNEP1-210ENST00000574322 CYP4F8P98187 520 aa28.78■■■□□ 2.2
CTDNEP1-210ENST00000574322 ISL2Q96A47 359 aa28.78■■■□□ 2.2
CTDNEP1-210ENST00000574322 TXNDC16Q9P2K2 825 aa28.78■■■□□ 2.2
CTDNEP1-210ENST00000574322 SLC17A6Q9P2U8 582 aa28.78■■■□□ 2.2
CTDNEP1-210ENST00000574322 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP28.78■■■□□ 2.2
CTDNEP1-210ENST00000574322 MUSKO15146 869 aa28.77■■■□□ 2.2
CTDNEP1-210ENST00000574322 TSPAN3O60637 253 aa28.77■■■□□ 2.2
CTDNEP1-210ENST00000574322 ITGA2BP08514 1039 aa28.77■■■□□ 2.2
CTDNEP1-210ENST00000574322 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
CTDNEP1-210ENST00000574322 POU6F1Q14863 301 aa28.77■■■□□ 2.2
CTDNEP1-210ENST00000574322 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa28.77■■■□□ 2.2
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF778Q96MU6 729 aa28.77■■■□□ 2.2
CTDNEP1-210ENST00000574322 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
CTDNEP1-210ENST00000574322 RBBP8Q99708 897 aa28.77■■■□□ 2.2
CTDNEP1-210ENST00000574322 SEMA3CQ99985 751 aa28.77■■■□□ 2.2
CTDNEP1-210ENST00000574322 TREX1Q9NSU2 369 aa28.77■■■□□ 2.2
CTDNEP1-210ENST00000574322 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP28.77■■■□□ 2.2
CTDNEP1-210ENST00000574322 SLC17A7Q9P2U7 560 aa28.77■■■□□ 2.2
CTDNEP1-210ENST00000574322 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
CTDNEP1-210ENST00000574322 CRHR1P34998 444 aa28.77■■■□□ 2.2
CTDNEP1-210ENST00000574322 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
CTDNEP1-210ENST00000574322 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
CTDNEP1-210ENST00000574322 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa28.77■■■□□ 2.2
CTDNEP1-210ENST00000574322 PLPP4Q5VZY2 271 aa28.77■■■□□ 2.2
CTDNEP1-210ENST00000574322 CNTN4Q8IWV2 1026 aa28.77■■■□□ 2.2
CTDNEP1-210ENST00000574322 CPXM2Q8N436 756 aa28.77■■■□□ 2.2
CTDNEP1-210ENST00000574322 FEM1CQ96JP0 617 aa28.77■■■□□ 2.2
CTDNEP1-210ENST00000574322 GCNAQ96QF7 691 aa28.77■■■□□ 2.2
CTDNEP1-210ENST00000574322 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.8 ms