RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560715.5

TSPAN3-209, Transcript of tetraspanin 3, humanhuman

TSL 2

Gene TSPAN3, Length 2,892 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN3-209ENST00000560715 CLPTM1O96005 669 aa6.86□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 PEPDP12955 493 aa6.86□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 PHBP35232 272 aa6.86□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 FLT3LGP49771 235 aa6.86□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 PLTPP55058 493 aa6.86□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 MALLQ13021 153 aa6.86□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 CNGA3Q16281 694 aa6.86□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 MYLK3Q32MK0 819 aa6.86□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 NADK2Q4G0N4 442 aa6.86□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 KCTD21Q4G0X4 260 aa6.86□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 UGT2A3Q6UWM9 527 aa6.86□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa6.86□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 TMEM151BQ8IW70 566 aa6.86□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 THNSL1Q8IYQ7 743 aa6.86□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 MPP5Q8N3R9 675 aa6.86□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 METTL25Q8N6Q8 603 aa6.86□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 C10orf82Q8WW14 230 aa6.86□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 EDEM3Q9BZQ6 932 aa6.86□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 HPS4Q9NQG7 708 aa6.86□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 SNTG1Q9NSN8 517 aa6.86□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 PLK2Q9NYY3 685 aa6.86□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 TAF1LQ8IZX4 1826 aa6.85□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 CHD4Q14839 1912 aa6.85□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 SMIM30A4D0T7 59 aa6.85□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 PLSCR1O15162 318 aa6.85□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 FOXP2O15409 715 aa6.85□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 EFSO43281 561 aa6.85□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 GPAA1O43292 621 aa6.85□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 BUD23O43709 281 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 SLC22A3O75751 556 aa6.85□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 GGPS1O95749 300 aa6.85□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 MT-ND5P03915 603 aa6.85□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 TPOP07202 933 aa6.85□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 INHBAP08476 426 aa6.85□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 ZNF12P17014 697 aa6.85□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 VCLP18206 1134 aa6.85□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 AP2B1P63010 937 aa6.85□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 XIAPP98170 497 aa6.85□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 IL9RQ01113 521 aa6.85□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 DR1Q01658 176 aa6.85□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 MAMLD1Q13495 774 aa6.85□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 PDK3Q15120 406 aa6.85□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 CYTH1Q15438 398 aa6.85□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa6.85□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 MPP7Q5T2T1 576 aa6.85□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 RNF44Q7L0R7 432 aa6.85□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 CLNKQ7Z7G1 428 aa6.85□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 ADGRA1Q86SQ6 560 aa6.85□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 MICU3Q86XE3 530 aa6.85□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 ARMC8Q8IUR7 673 aa6.85□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 LRRC57Q8N9N7 239 aa6.85□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 LINC00116Q8NCU8 138 aa6.85□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 FBXO25Q8TCJ0 367 aa6.85□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 ABHD17AQ96GS6 310 aa6.85□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 TCTN2Q96GX1 697 aa6.85□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 BIRC8Q96P09 236 aa6.85□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 APOL6Q9BWW8 343 aa6.85□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 PCED1AQ9H1Q7 454 aa6.85□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 SLAMF7Q9NQ25 335 aa6.85□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa6.85□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 ADAM30Q9UKF2 790 aa6.85□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 DUSP12Q9UNI6 340 aa6.85□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa6.85□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 LY75O60449 1722 aa6.85□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 COL24A1Q17RW2 1714 aa6.85□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 ECM29Q5VYK3 1845 aa6.85□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 TRAV34A0A0B4J273 112 aa6.85□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 SOBPA7XYQ1 873 aa6.85□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 AP3B1O00203 1094 aa6.85□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 PHF2O75151 1096 aa6.85□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 C22orf31O95567 290 aa6.85□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 APOEP02649 317 aa6.85□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 SERPING1P05155 500 aa6.85□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 BTF3P20290 206 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 AMPD1P23109 780 aa6.85□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 ATP5OP48047 213 aa6.85□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 SULT1E1P49888 294 aa6.85□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 MXI1P50539 228 aa6.85□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 RAP1GDS1P52306 607 aa6.85□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 BCAT1P54687 386 aa6.85□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 C21orf58P58505 322 aa6.85□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 PTENP60484 403 aa6.85□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 TUBA1BP68363 451 aa6.85□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 BEX3Q00994 111 aa6.85□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms