RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558534.5

RABGGTA-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTA, Length 753 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-205ENST00000558534 RALGPS1Q5JS13 557 aa16.04■□□□□ 0.16
RABGGTA-205ENST00000558534 CFAP58Q5T655 872 aa16.04■□□□□ 0.16
RABGGTA-205ENST00000558534 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa16.04■□□□□ 0.16
RABGGTA-205ENST00000558534 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa16.04■□□□□ 0.16
RABGGTA-205ENST00000558534 FBXL19Q6PCT2 694 aa16.04■□□□□ 0.16
RABGGTA-205ENST00000558534 IL27RAQ6UWB1 636 aa16.04■□□□□ 0.16
RABGGTA-205ENST00000558534 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
RABGGTA-205ENST00000558534 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
RABGGTA-205ENST00000558534 AADATQ8N5Z0 425 aa16.04■□□□□ 0.16
RABGGTA-205ENST00000558534 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa16.04■□□□□ 0.16
RABGGTA-205ENST00000558534 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa16.04■□□□□ 0.16
RABGGTA-205ENST00000558534 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
RABGGTA-205ENST00000558534 TM6SF2Q9BZW4 377 aa16.04■□□□□ 0.16
RABGGTA-205ENST00000558534 TSGA10Q9BZW7 698 aa16.04■□□□□ 0.16
RABGGTA-205ENST00000558534 PDFQ9HBH1 243 aa16.04■□□□□ 0.16
RABGGTA-205ENST00000558534 PARD6AQ9NPB6 346 aa16.04■□□□□ 0.16
RABGGTA-205ENST00000558534 CD93Q9NPY3 652 aa16.04■□□□□ 0.16
RABGGTA-205ENST00000558534 DMTF1Q9Y222 760 aa16.04■□□□□ 0.16
RABGGTA-205ENST00000558534 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
RABGGTA-205ENST00000558534 A0A1W2PQ67 120 aa16.03■□□□□ 0.16
RABGGTA-205ENST00000558534 LRRD1A4D1F6 860 aa16.03■□□□□ 0.16
RABGGTA-205ENST00000558534 FAM47DPA6NHR8 397 aa16.03■□□□□ 0.16
RABGGTA-205ENST00000558534 KRIT1O00522 736 aa16.03■□□□□ 0.16
RABGGTA-205ENST00000558534 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
RABGGTA-205ENST00000558534 MAGEC1O60732 1142 aa16.03■□□□□ 0.16
RABGGTA-205ENST00000558534 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
RABGGTA-205ENST00000558534 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
RABGGTA-205ENST00000558534 NEBLO76041 1014 aa16.03■□□□□ 0.16
RABGGTA-205ENST00000558534 FSBPO95073 299 aa16.03■□□□□ 0.16
RABGGTA-205ENST00000558534 CD160O95971 181 aa16.03■□□□□ 0.16
RABGGTA-205ENST00000558534 TGM1P22735 817 aa16.03■□□□□ 0.16
RABGGTA-205ENST00000558534 KDELR1P24390 212 aa16.03■□□□□ 0.16
RABGGTA-205ENST00000558534 DRD3P35462 400 aa16.03■□□□□ 0.16
RABGGTA-205ENST00000558534 CETN2P41208 172 aa16.03■□□□□ 0.16
RABGGTA-205ENST00000558534 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
RABGGTA-205ENST00000558534 CNTN1Q12860 1018 aa16.03■□□□□ 0.16
RABGGTA-205ENST00000558534 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
RABGGTA-205ENST00000558534 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
RABGGTA-205ENST00000558534 ZNF805Q5CZA5 627 aa16.03■□□□□ 0.16
RABGGTA-205ENST00000558534 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa16.03■□□□□ 0.16
RABGGTA-205ENST00000558534 NCEH1Q6PIU2 408 aa16.03■□□□□ 0.16
RABGGTA-205ENST00000558534 GDPD4Q6W3E5 623 aa16.03■□□□□ 0.16
RABGGTA-205ENST00000558534 DAAM2Q86T65 1068 aa16.03■□□□□ 0.16
RABGGTA-205ENST00000558534 TRIM69Q86WT6 500 aa16.03■□□□□ 0.16
RABGGTA-205ENST00000558534 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa16.03■□□□□ 0.16
RABGGTA-205ENST00000558534 SYCE1Q8N0S2 351 aa16.03■□□□□ 0.16
RABGGTA-205ENST00000558534 DEFB119Q8N690 84 aa16.03■□□□□ 0.16
RABGGTA-205ENST00000558534 FAM174AQ8TBP5 190 aa16.03■□□□□ 0.16
RABGGTA-205ENST00000558534 FAF2Q96CS3 445 aa16.03■□□□□ 0.16
RABGGTA-205ENST00000558534 RTKNQ9BST9 563 aa16.03■□□□□ 0.16
RABGGTA-205ENST00000558534 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa16.03■□□□□ 0.16
RABGGTA-205ENST00000558534 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
RABGGTA-205ENST00000558534 AMACRQ9UHK6 382 aa16.03■□□□□ 0.16
RABGGTA-205ENST00000558534 WASF2Q9Y6W5 498 aa16.03■□□□□ 0.16
RABGGTA-205ENST00000558534 SHROOM3Q8TF72 1996 aa16.03■□□□□ 0.16
RABGGTA-205ENST00000558534 CACNA1EQ15878 2313 aa16.03■□□□□ 0.16
RABGGTA-205ENST00000558534 GON4LQ3T8J9 2241 aa16.03■□□□□ 0.16
RABGGTA-205ENST00000558534 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
RABGGTA-205ENST00000558534 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa16.02■□□□□ 0.16
RABGGTA-205ENST00000558534 PJA2O43164 708 aa16.02■□□□□ 0.16
RABGGTA-205ENST00000558534 AP1G1O43747 822 aa16.02■□□□□ 0.16
RABGGTA-205ENST00000558534 KRT1P04264 644 aa16.02■□□□□ 0.16
RABGGTA-205ENST00000558534 COMTP21964 271 aa16.02■□□□□ 0.16
RABGGTA-205ENST00000558534 XPAP23025 273 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
RABGGTA-205ENST00000558534 CES1P23141 567 aa16.02■□□□□ 0.16
RABGGTA-205ENST00000558534 SERPINA4P29622 427 aa16.02■□□□□ 0.16
RABGGTA-205ENST00000558534 ARSEP51690 589 aa16.02■□□□□ 0.16
RABGGTA-205ENST00000558534 TAS2R40P59535 323 aa16.02■□□□□ 0.16
RABGGTA-205ENST00000558534 AP1S1P61966 158 aa16.02■□□□□ 0.16
RABGGTA-205ENST00000558534 TFDP2Q14188 446 aa16.02■□□□□ 0.16
RABGGTA-205ENST00000558534 LBRQ14739 615 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
RABGGTA-205ENST00000558534 NUMA1Q14980 2115 aa16.02■□□□□ 0.16
RABGGTA-205ENST00000558534 AGBL4Q5VU57 503 aa16.02■□□□□ 0.16
RABGGTA-205ENST00000558534 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa16.02■□□□□ 0.16
RABGGTA-205ENST00000558534 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
RABGGTA-205ENST00000558534 NPWQ8N729 165 aa16.02■□□□□ 0.16
RABGGTA-205ENST00000558534 PAF1Q8N7H5 531 aa16.02■□□□□ 0.16
RABGGTA-205ENST00000558534 CHST14Q8NCH0 376 aa16.02■□□□□ 0.16
RABGGTA-205ENST00000558534 FATE1Q969F0 183 aa16.02■□□□□ 0.16
RABGGTA-205ENST00000558534 BIRC7Q96CA5 298 aa16.02■□□□□ 0.16
RABGGTA-205ENST00000558534 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
RABGGTA-205ENST00000558534 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
RABGGTA-205ENST00000558534 EDEM2Q9BV94 578 aa16.02■□□□□ 0.16
RABGGTA-205ENST00000558534 KLC2Q9H0B6 622 aa16.02■□□□□ 0.16
RABGGTA-205ENST00000558534 BRD8Q9H0E9 1235 aa16.02■□□□□ 0.16
RABGGTA-205ENST00000558534 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa16.02■□□□□ 0.16
RABGGTA-205ENST00000558534 TMEM9BQ9NQ34 198 aa16.02■□□□□ 0.16
RABGGTA-205ENST00000558534 DKK3Q9UBP4 350 aa16.02■□□□□ 0.16
RABGGTA-205ENST00000558534 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
RABGGTA-205ENST00000558534 SARDHQ9UL12 918 aa16.02■□□□□ 0.16
RABGGTA-205ENST00000558534 ALG6Q9Y672 507 aa16.02■□□□□ 0.16
RABGGTA-205ENST00000558534 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 A0A1W2PPC4 97 aa16.01■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 J3KR12 359 aa16.01■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 ARHGAP6O43182 974 aa16.01■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 TSPAN6O43657 245 aa16.01■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 CER1O95813 267 aa16.01■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 CTSLP07711 333 aa16.01■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 ADRB3P13945 408 aa16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.5 ms