RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556288.5

ATXN3-238, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 901 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-238	ENST00000556288	THAP12	O43422	761 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	BEST1	O76090	585 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	RTN3	O95197	1032 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	HMBS	P08397	361 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	IRF1	P10914	325 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	MBL2	P11226	248 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	ACO1	P21399	889 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	CD72	P21854	359 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	TBXAS1	P24557	533 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	ADCY8	P40145	1251 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	MAGEA11	P43364	429 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	RGS7	P49802	495 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	CACNA2D1	P54289	1103 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	RAD23B	P54727	409 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	TPM4	P67936	248 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	CD83	Q01151	205 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC6A3	Q01959	620 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	APBA1	Q02410	837 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	ROM1	Q03395	351 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	UBXN1	Q04323	297 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	TAF10	Q12962	218 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	STIL	Q15468	1287 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	MAN2A1	Q16706	1144 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	EXOC3L4	Q17RC7	722 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	GOLGA7B	Q2TAP0	167 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	ATP13A4	Q4VNC1	1196 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC44A4	Q53GD3	710 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	TCP11X2	Q5H9J9	407 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	RNF187	Q5TA31	235 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	ESRP1	Q6NXG1	681 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	BORA	Q6PGQ7	559 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	VSTM1	Q6UX27	236 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	GAREM2	Q75VX8	874 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	CXXC5	Q7LFL8	322 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	STRA8	Q7Z7C7	330 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	SUGP1	Q8IWZ8	645 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	UBALD2	Q8IYN6	164 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	CRYBG2	Q8N1P7	616 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	TTC39C	Q8N584	583 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	ARL14EP	Q8N8R7	260 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC4A11	Q8NBS3	891 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	LEMD2	Q8NC56	503 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	TMEM174	Q8WUU8	243 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	SMARCD2	Q92925	531 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	KAT5	Q92993	513 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	FUBP3	Q96I24	572 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	ZFYVE19	Q96K21	471 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	SLITRK1	Q96PX8	696 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	MED15	Q96RN5	788 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	TWNK	Q96RR1	684 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	TTC1	Q99614	292 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	SMO	Q99835	787 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	FOXB1	Q99853	325 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	LSM14B	Q9BX40	385 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC46A2	Q9BY10	475 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	DUSP16	Q9BY84	665 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	NDST4	Q9H3R1	872 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	TASP1	Q9H6P5	420 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	LRRC4	Q9HBW1	653 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	DMAP1	Q9NPF5	467 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	GKN1	Q9NS71	199 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	SMPD4	Q9NXE4	827 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	GDE1	Q9NZC3	331 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	EHD2	Q9NZN4	543 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	HSFX1	Q9UBD0	423 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	DNAJC12	Q9UKB3	198 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	KMT2E	Q8IZD2	1858 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	BDP1	A6H8Y1	2624 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	UNC80	Q8N2C7	3258 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	C2orf78	A6NCI8	922 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	NEMP1	O14524	444 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	P4HA2	O15460	535 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	MED7	O43513	233 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	DNAJC6	O75061	913 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	MOSPD3	O75425	235 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	APOL3	O95236	402 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	SERPINC1	P01008	464 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	PDGFB	P01127	241 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	VDR	P11473	427 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	HMGA1	P17096	107 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	PSMC3	P17980	439 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	CD40	P25942	277 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	EEF1G	P26641	437 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	PON1	P27169	355 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	APEX1	P27695	318 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	KRT9	P35527	623 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	MYL5	Q02045	173 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	ENPEP	Q07075	957 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	SIGLEC14	Q08ET2	396 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	HTR4	Q13639	388 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	UBXN2B	Q14CS0	331 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	KRT31	Q15323	416 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	CFAP221	Q4G0U5	840 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	FILIP1L	Q4L180	1135 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	C10orf120	Q5SQS8	335 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	HECTD3	Q5T447	861 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	PRAMEF9	Q5VWM5	478 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	KANK2	Q63ZY3	851 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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