RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550658.1

SYF2P1-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene SYF2P1, Length 413 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2P1-201ENST00000550658 GDAQ9Y2T3 454 aa3.65□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 ASB3Q9Y575 518 aa3.65□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 GAKO14976 1311 aa3.65□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 GAGE10A6NGK3 116 aa3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 H0Y858 1186 aa3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 PEX12O00623 359 aa3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 E2F3O00716 465 aa3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 MAN2B1O00754 1011 aa3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 KCNK3O14649 394 aa3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 FOXP2O15409 715 aa3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 NRP2O60462 931 aa3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 DIAPH2O60879 1101 aa3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 SPAG6O75602 509 aa3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 CIB2O75838 187 aa3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 KLHL18O94889 574 aa3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 ARP10275 920 aa3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 MALP21145 153 aa3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 PRKCHP24723 683 aa3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 ALDH4A1P30038 563 aa3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 MDH1P40925 334 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 CCR10P46092 362 aa3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 PITPNBP48739 271 aa3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 GPR15P49685 360 aa3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 FLT3LGP49771 235 aa3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 RGS3P49796 1198 aa3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 PEX5P50542 639 aa3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 HADHBP55084 474 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 NPEPPSP55786 919 aa3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 SOX8P57073 446 aa3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 ASIC1P78348 528 aa3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 CTAG1AP78358 180 aa3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 GRIN1Q05586 938 aa3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 PPARAQ07869 468 aa3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 PLD1Q13393 1074 aa3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 TUSC3Q13454 348 aa3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 PCLAFQ15004 111 aa3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 RCN1Q15293 331 aa3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 DGKDQ16760 1214 aa3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 HYAL4Q2M3T9 481 aa3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 CCDC57Q2TAC2 916 aa3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 LRIT3Q3SXY7 679 aa3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 SH2D4BQ5SQS7 431 aa3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 SPATA46Q5T0L3 261 aa3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 TMTC4Q5T4D3 741 aa3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 TTC22Q5TAA0 569 aa3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 CYP4A22Q5TCH4 519 aa3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 EMC10Q5UCC4 262 aa3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 SFMBT2Q5VUG0 894 aa3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 KIAA1841Q6NSI8 718 aa3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 CORO6Q6QEF8 472 aa3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 SUSD1Q6UWL2 747 aa3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 ISLR2Q6UXK2 745 aa3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 RHOT2Q8IXI1 618 aa3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 MPP5Q8N3R9 675 aa3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 GALNT4Q8N4A0 578 aa3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 ZNF366Q8N895 744 aa3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 NUDT10Q8NFP7 164 aa3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 SLC26A7Q8TE54 656 aa3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 CLEC4DQ8WXI8 215 aa3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 SGCDQ92629 289 aa3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 NCLNQ969V3 563 aa3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 HDAC11Q96DB2 347 aa3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 DTNBP1Q96EV8 351 aa3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 NUDT11Q96G61 164 aa3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 CAMK1GQ96NX5 476 aa3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 AGAP2Q99490 1192 aa3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 SSX3Q99909 188 aa3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 MGME1Q9BQP7 344 aa3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 MYL10Q9BUA6 226 aa3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 HTATIP2Q9BUP3 242 aa3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 TRIM31Q9BZY9 425 aa3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 THAP2Q9H0W7 228 aa3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 VPS16Q9H269 839 aa3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 CYP39A1Q9NYL5 469 aa3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 CFAP97Q9P2B7 532 aa3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 LRIT1Q9P2V4 623 aa3.64□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 MALT1Q9UDY8 824 aa3.64□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms