RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522702.5

FAM49B-222, Transcript of family with sequence similarity 49 member B, human

TSL 4

Gene FAM49B, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM49B-222	ENST00000522702	C19orf81	C9J6K1	198 aa		4.19	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702		M0QZQ0	153 aa		4.19	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	RTCA	O00442	366 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF213	O14771	459 aa		4.19	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	YY2	O15391	372 aa		4.19	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	ALDOA	P04075	364 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	STMN1	P16949	149 aa		4.19	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	CDH2	P19022	906 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	TLX1	P31314	330 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC15A1	P46059	708 aa		4.19	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	HSD17B4	P51659	736 aa		4.19	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	DGKQ	P52824	942 aa		4.19	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	ARHGAP8	P85298	464 aa		4.19	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	CEBPZ	Q03701	1054 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	AP1B1	Q10567	949 aa		4.19	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	AIMP2	Q13155	320 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	FRG1	Q14331	258 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	CYP1B1	Q16678	543 aa		4.19	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	ST3GAL2	Q16842	350 aa		4.19	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	DNAJC21	Q5F1R6	531 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF667	Q5HYK9	610 aa		4.19	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	SH2D4B	Q5SQS7	431 aa		4.19	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	TREML2	Q5T2D2	321 aa		4.19	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		4.19	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	TEDDM1	Q5T9Z0	273 aa		4.19	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	GKAP1	Q5VSY0	366 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	FAM90A2P	Q658T7	463 aa		4.19	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	KRT80	Q6KB66	452 aa		4.19	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	TMEM81	Q6P7N7	255 aa		4.19	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC30A9	Q6PML9	568 aa		4.19	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	PET117	Q6UWS5	81 aa		4.19	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC46A3	Q7Z3Q1	461 aa		4.19	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	CAND1	Q86VP6	1230 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	EPHX4	Q8IUS5	362 aa		4.19	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	UNC45B	Q8IWX7	931 aa		4.19	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	SPC24	Q8NBT2	197 aa		4.19	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	OR8H1	Q8NGG4	311 aa		4.19	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	GSDMB	Q8TAX9	411 aa		4.19	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	PRPF31	Q8WWY3	499 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	SECISBP2L	Q93073	1101 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC22A18	Q96BI1	424 aa		4.19	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	FAM149B1	Q96BN6	582 aa		4.19	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	RMDN1	Q96DB5	314 aa		4.19	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	VPS50	Q96JG6	964 aa		4.19	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	PBK	Q96KB5	322 aa		4.19	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	WDFY2	Q96P53	400 aa		4.19	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	GCNA	Q96QF7	691 aa		4.19	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	CITED2	Q99967	270 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		4.19	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	POLR1B	Q9H9Y6	1135 aa		4.19	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	KCNK9	Q9NPC2	374 aa		4.19	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	PEMT	Q9UBM1	199 aa		4.19	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	NKX1-2	Q9UD57	310 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	CD207	Q9UJ71	328 aa		4.19	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC25A13	Q9UJS0	675 aa		4.19	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	ODF2L	Q9ULJ1	636 aa		4.19	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	PPIE	Q9UNP9	301 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	PTRH2	Q9Y3E5	179 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	TRPV2	Q9Y5S1	764 aa		4.19	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	SESN1	Q9Y6P5	492 aa		4.19	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	EEA1	Q15075	1411 aa		4.19	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		4.18	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	GLOD5	A6NK44	160 aa		4.18	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702		A8MVJ9	347 aa		4.18	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	KCNJ18	B7U540	433 aa		4.18	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	PSMD9	O00233	223 aa		4.18	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	MPPED1	O15442	326 aa		4.18	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	TACC1	O75410	805 aa		4.18	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	TJP3	O95049	919 aa		4.18	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	CSPG5	O95196	566 aa		4.18	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	GOSR1	O95249	250 aa		4.18	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	FES	P07332	822 aa		4.18	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	CELA2A	P08217	269 aa		4.18	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	IFNAR1	P17181	557 aa		4.18	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	CD72	P21854	359 aa		4.18	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	MMP8	P22894	467 aa		4.18	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	CPT2	P23786	658 aa		4.18	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	TBXAS1	P24557	533 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	PSMA3	P25788	255 aa		4.18	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	ITPKB	P27987	946 aa		4.18	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	HNF1B	P35680	557 aa		4.18	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	LIG4	P49917	911 aa		4.18	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	BPIFB3	P59826	476 aa		4.18	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	TLE3	Q04726	772 aa		4.18	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	BYSL	Q13895	437 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	KCNJ12	Q14500	433 aa		4.18	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	E2F5	Q15329	346 aa		4.18	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	ADIPOQ	Q15848	244 aa		4.18	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	AP5B1	Q2VPB7	878 aa		4.18	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	DPCR1	Q3MIW9	517 aa		4.18	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	AASDH	Q4L235	1098 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF805	Q5CZA5	627 aa		4.18	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	C9orf152	Q5JTZ5	239 aa		4.18	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	ISM2	Q6H9L7	571 aa		4.18	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	WDR93	Q6P2C0	686 aa		4.18	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	PLBD1	Q6P4A8	553 aa		4.18	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	SARM1	Q6SZW1	724 aa		4.18	□□□□□ -1.74

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