RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 CAMK1GQ96NX5 476 aa19.01■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP19.01■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 TRIM5Q9C035 493 aa19.01■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 FZD3Q9NPG1 666 aa19.01■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa19.01■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 IP6K2Q9UHH9 426 aa19.01■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 ITM2BQ9Y287 266 aa19.01■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa19.01■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 PTPRBP23467 1997 aa19.01■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 A0A1W2PR77 199 aa19■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 KRIT1O00522 736 aa19■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 INSIG1O15503 277 aa19■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 AKR1B10O60218 316 aa19■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP19■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 UGT2B4P06133 528 aa19■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 ADRB1P08588 477 aa19■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 ADRB3P13945 408 aa19■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 PRLRP16471 622 aa19■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 RGRP47804 291 aa19■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP19■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 TAS2R40P59535 323 aa19■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 RHOAP61586 193 aa19■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 RACK1P63244 317 aaKnown RBP19■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM193AP78312 1265 aa19■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 IL9RQ01113 521 aa19■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 ACAP1Q15027 740 aa19■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 CYTH1Q15438 398 aa19■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP19■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 SEL1L3Q68CR1 1132 aa19■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 POLNQ7Z5Q5 900 aa19■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP19■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 SERAC1Q96JX3 654 aa19■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 CSPG4P5Q96PW8 444 aa19■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 HDAC8Q9BY41 377 aa19■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP19■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 PCDH18Q9HCL0 1135 aa19■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 PREBQ9HCU5 417 aa19■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 DYRK4Q9NR20 520 aa19■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa19■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP19■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP19■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 A0A1W2PQU0 124 aa18.99■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP18.99■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 H3BRJ5 948 aa18.99■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 DFFAO00273 331 aa18.99■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 DAPK3O43293 454 aa18.99■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 PRAMEF11O60813 436 aa18.99■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 PIGNO95427 931 aa18.99■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 CER1O95813 267 aa18.99■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 TPM1P09493 284 aa18.99■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 AMPD1P23109 780 aa18.99■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 CTSKP43235 329 aa18.99■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 NEK3P51956 506 aa18.99■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 NDST2P52849 883 aa18.99■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 MMRN1Q13201 1228 aa18.99■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa18.99■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 TC2NQ8N9U0 490 aa18.99■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP18.99■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 TSC1Q92574 1164 aa18.99■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 PPP1R16AQ96I34 528 aa18.99■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa18.99■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa18.99■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 KDM4CQ9H3R0 1056 aa18.99■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP18.99■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa18.98■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa18.98■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 H0Y8X5 98 aa18.98■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 IGSF6O95976 241 aa18.98■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM253P0C7T8 217 aa18.98■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 SSR1P43307 286 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 FOXK2Q01167 660 aa18.98■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 TEAD4Q15561 434 aa18.98■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa18.98■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa18.98■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 CNGA4Q8IV77 575 aa18.98■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 TEKT4Q8WW24 435 aa18.98■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 KLHL32Q96NJ5 620 aa18.98■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 CAAP1Q9H8G2 361 aa18.98■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 ARHGAP42A6NI28 874 aa18.97■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 MYO1FO00160 1098 aa18.97■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 MUSKO15146 869 aa18.97■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 VILLO15195 856 aa18.97■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 SH3BP5O60239 455 aa18.97■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 PROSCO94903 275 aa18.97■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 H2AFZP0C0S5 128 aa18.97■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 CD38P28907 300 aa18.97■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 HCAR3P49019 387 aa18.97■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 ARSEP51690 589 aa18.97■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 CDH6P55285 790 aa18.97■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 FGL2Q14314 439 aa18.97■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF284Q2VY69 593 aa18.97■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 MYLK3Q32MK0 819 aa18.97■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM259Q4ZIN3 620 aa18.97■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 KDM7AQ6ZMT4 941 aa18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms