RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000499624.3

GABPB1-AS1-202, GABPB1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GABPB1-AS1, Length 16,182 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 LBX2Q6XYB7 198 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SCAIQ8N9R8 606 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SLC44A5Q8NCS7 719 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 NSMCE3Q96MG7 304 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TMEM117Q9H0C3 514 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ANKHQ9HCJ1 492 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PLD2O14939 933 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CKMP06732 381 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SLC35G6P0C7Q6 338 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PET100P0DJ07 73 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PLIN5Q00G26 463 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 XKR4Q5GH76 650 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 GALNT13Q8IUC8 556 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TBC1D16Q8TBP0 767 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CGRRF1Q99675 332 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CCDC3Q9BQI4 270 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CCM2Q9BSQ5 444 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 DBNDD1Q9H9R9 158 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 USP29Q9HBJ7 922 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TMCC3Q9ULS5 477 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ALPIP09923 528 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PCYT1AP49585 367 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 GHRHRQ02643 423 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CHRNB3Q05901 458 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PNOCQ13519 176 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 DPYSQ14117 519 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ADHFE1Q8IWW8 467 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CARFQ8N187 725 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MKL1Q969V6 931 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 WASHC1A8K0Z3 465 aa4.57□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 WASH3PC4AMC7 463 aa4.57□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 H0YGN5 161 aa4.57□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 GRM6O15303 877 aa4.57□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CFLARO15519 480 aa4.57□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 RAD17O75943 681 aa4.57□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 GUCY1A3Q02108 690 aa4.57□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 KCNMA1Q12791 1236 aa4.57□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 WDR72Q3MJ13 1102 aa4.57□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 FAM153CQ494X1 144 aa4.57□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 WASH2PQ6VEQ5 465 aa4.57□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ADGRF4Q8IZF3 695 aa4.57□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ADSSL1Q8N142 457 aa4.57□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa4.57□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SGF29Q96ES7 293 aa4.57□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 BTF3L4Q96K17 158 aa4.57□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TRIB3Q96RU7 358 aa4.57□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PLIN2Q99541 437 aa4.57□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 STX7O15400 261 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TMEM253P0C7T8 217 aa4.57□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 RPL10P27635 214 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 GAD2Q05329 585 aa4.57□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TIGD2Q4W5G0 525 aa4.57□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 OR56A4Q8NGH8 313 aa4.57□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 KCND1Q9NSA2 647 aa4.57□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PLXNB2O15031 1838 aa4.57□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 COQ9O75208 318 aa4.57□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 IFNB1P01574 187 aa4.57□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 HEXAP06865 529 aa4.57□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 LYNP07948 512 aa4.57□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CCDC166P0CW27 439 aa4.57□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 NUBP1P53384 320 aa4.57□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CDH13P55290 713 aa4.57□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MZT2AQ6P582 158 aa4.57□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SLFN11Q7Z7L1 901 aa4.57□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SLC26A11Q86WA9 606 aa4.57□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 NPAS4Q8IUM7 802 aa4.57□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TRIM9Q9C026 710 aa4.57□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 BHMT2Q9H2M3 363 aa4.57□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 B4GALT7Q9UBV7 327 aa4.57□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SPO11Q9Y5K1 396 aa4.57□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ZNF536O15090 1300 aa4.57□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ACSL3O95573 720 aa4.57□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CFL1P23528 166 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PRR5P85299 388 aa4.57□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 GRIK5Q16478 980 aa4.57□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 BEND5Q7L4P6 421 aa4.57□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TREML1Q86YW5 311 aa4.57□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 LSMEM2Q8N112 164 aa4.57□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 FERD3LQ96RJ6 166 aa4.57□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms