RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496183.5

RBM39-241, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 2

Gene RBM39, Length 632 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-241ENST00000496183 GOLGA8FQ08AF8 430 aa5.07□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 FOXO1Q12778 655 aa5.07□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 GALNTL6Q49A17 601 aa5.07□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 RUNDC3AQ59EK9 446 aa5.07□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 DCAF12L2Q5VW00 463 aa5.07□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 TMEM268Q5VZI3 342 aa5.07□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 AADACL2Q6P093 401 aa5.07□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 GALNT7Q86SF2 657 aa5.07□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 CADM3Q8N126 398 aa5.07□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 VPS52Q8N1B4 723 aa5.07□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 OR6Y1Q8NGX8 325 aa5.07□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 OIT3Q8WWZ8 545 aa5.07□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 INPP5DQ92835 1189 aa5.07□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 PAGR1Q9BTK6 254 aa5.07□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 PLAC1Q9HBJ0 212 aa5.07□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 TNS3Q68CZ2 1445 aa5.06□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 FMN2Q9NZ56 1722 aa5.06□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa5.06□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa5.06□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa5.06□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 MS4A18H0YCH9 400 aa5.06□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 SYN3O14994 580 aa5.06□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 SPRY3O43610 288 aa5.06□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 STRNO43815 780 aa5.06□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 MMP3P08254 477 aa5.06□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 TNNT1P13805 278 aa5.06□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 CHRNB2P17787 502 aa5.06□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 ARRB2P32121 409 aa5.06□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 MORC3Q14149 939 aa5.06□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 ASIC2Q16515 512 aa5.06□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 FSCBQ5H9T9 825 aa5.06□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 ASPHD1Q5U4P2 390 aa5.06□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 NCAPH2Q6IBW4 605 aa5.06□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 TANGO2Q6ICL3 276 aa5.06□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 SULT6B1Q6IMI4 303 aa5.06□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 GPSM1Q86YR5 675 aa5.06□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 LRRC57Q8N9N7 239 aa5.06□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 SCAMP5Q8TAC9 235 aa5.06□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 ELP5Q8TE02 316 aa5.06□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 POF1BQ8WVV4 589 aa5.06□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 GOLGA1Q92805 767 aa5.06□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 MIB2Q96AX9 1013 aa5.06□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 MED30Q96HR3 178 aa5.06□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 ZNF479Q96JC4 524 aa5.06□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 IL21RQ9HBE5 538 aa5.06□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 SAYSD1Q9NPB0 183 aa5.06□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 DHDHQ9UQ10 334 aa5.06□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 ADGRB2O60241 1585 aa5.06□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 SLIT2O94813 1529 aa5.06□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 USP32Q8NFA0 1604 aa5.05□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa5.05□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa5.05□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 ACOT8O14734 319 aa5.05□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 RNMTO43148 476 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 PRKCHP24723 683 aa5.05□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 TNFSF8P32971 234 aa5.05□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 CLCNKBP51801 687 aa5.05□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 MTFR2Q6P444 385 aa5.05□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa5.05□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 UNC5CLQ8IV45 518 aa5.05□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa5.05□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 TMEM217Q8N7C4 229 aa5.05□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 OR1N1Q8NGS0 311 aa5.05□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 FAR1Q8WVX9 515 aa5.05□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 HDHD5Q9BXW7 423 aa5.05□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 CLPBQ9H078 707 aa5.05□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 MAGEH1Q9H213 219 aa5.05□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 TMEM248Q9NWD8 314 aa5.05□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa5.05□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 LZTS1Q9Y250 596 aa5.05□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa5.05□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 INSL5Q9Y5Q6 135 aa5.05□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 NWD2Q9ULI1 1742 aa5.05□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 BCL9LQ86UU0 1499 aa5.05□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 GPRASP1Q5JY77 1395 aa5.04□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 NPIPB13A6NJU9 1138 aa5.04□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 NPIPB5A8MRT5 1133 aa5.04□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 NPIPB4C9JG80 1138 aa5.04□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 STMND1H3BQB6 276 aa5.04□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 PRSS2P07478 247 aa5.04□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 FCGR2AP12318 317 aa5.04□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 UNGP13051 313 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 TYK2P29597 1187 aa5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms