RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495357.1

CCDC39-AS1-201, CCDC39 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CCDC39-AS1, Length 283 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PCYT1AP49585 367 aa4.8□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SHBQ15464 509 aa4.8□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FSCBQ5H9T9 825 aa4.8□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ATG9BQ674R7 924 aa4.8□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PDXDC1Q6P996 788 aa4.8□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 BBS12Q6ZW61 710 aa4.8□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CPOQ8IVL8 374 aa4.8□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MCPH1Q8NEM0 835 aa4.8□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ELP5Q8TE02 316 aa4.8□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HSPH1Q92598 858 aa4.8□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SH3KBP1Q96B97 665 aa4.8□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP4.8□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MVB12BQ9H7P6 319 aa4.8□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IL36RNQ9UBH0 155 aa4.8□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 WNT16Q9UBV4 365 aa4.8□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CNPY2Q9Y2B0 182 aa4.8□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C4orf47A7E2U8 309 aa4.79□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EYA2O00167 538 aa4.79□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GLUD1P00367 558 aa4.79□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CHRM4P08173 479 aa4.79□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 WEE2P0C1S8 567 aa4.79□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CKMT1AP12532 417 aa4.79□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DCTDP32321 178 aa4.79□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GPR12P47775 334 aa4.79□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KCNJ4P48050 445 aa4.79□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GLUD2P49448 558 aa4.79□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ARSFP54793 590 aa4.79□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC12A1Q13621 1099 aa4.79□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF585BQ52M93 769 aa4.79□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 WDR45BQ5MNZ6 344 aa4.79□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa4.79□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NCAPH2Q6IBW4 605 aa4.79□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HERVK_113Q902F9 699 aa4.79□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 STAMQ92783 540 aa4.79□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa4.79□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TAOK3Q9H2K8 898 aa4.79□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 A0A096LPK6 155 aa4.78□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TSPAN3O60637 253 aa4.78□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NAGAP17050 411 aa4.78□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CTPS1P17812 591 aa4.78□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TTKP33981 857 aa4.78□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CCR5P51681 352 aa4.78□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MYBPC2Q14324 1141 aa4.78□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MON1BQ7L1V2 547 aa4.78□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GHDCQ8N2G8 530 aa4.78□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CLIP4Q8N3C7 705 aa4.78□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GPT2Q8TD30 523 aa4.78□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TMEM170AQ8WVE7 144 aa4.78□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RAB40AQ8WXH6 277 aa4.78□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MROH8Q9H579 483 aa4.78□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RIC8AQ9NPQ8 531 aa4.78□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SELENONQ9NZV5 590 aa4.78□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DGKBQ9Y6T7 804 aa4.78□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa4.77□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ASAP2O43150 1006 aa4.77□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HSD3B1P14060 373 aa4.77□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 AMTP48728 403 aa4.77□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NUDT6P53370 316 aa4.77□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ADORA2A-AS1P86434 159 aa4.77□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DSC1Q08554 894 aa4.77□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAM27E3Q08E93 113 aa4.77□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TRAF3Q13114 568 aa4.77□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LPIN1Q14693 890 aa4.77□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C17orf99Q6UX52 265 aa4.77□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PRSS45Q7RTY3 260 aa4.77□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa4.77□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ADHFE1Q8IWW8 467 aa4.77□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZMIZ2Q8NF64 920 aa4.77□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RASSF8Q8NHQ8 419 aa4.77□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa4.77□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MEIS3Q99687 375 aa4.77□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa4.77□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SUFUQ9UMX1 484 aa4.77□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa4.76□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa4.76□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CHL1O00533 1208 aa4.76□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PER2O15055 1255 aa4.76□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC25A17O43808 307 aa4.76□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF12P17014 697 aa4.76□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DSCR9P59020 149 aa4.76□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CHRNDQ07001 517 aa4.76□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KEAP1Q14145 624 aa4.76□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.5 ms