RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 RHODO00212 210 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 TAF4O00268 1085 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 SLC16A2P36021 539 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 ACVRL1P37023 503 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 CREB5Q02930 508 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 ACVR2BQ13705 512 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 CFAP58Q5T655 872 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 TBC1D9BQ66K14 1250 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 TXNDC8Q6A555 127 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 SARM1Q6SZW1 724 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 CYP20A1Q6UW02 462 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM116Q8NCL8 245 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 PERPQ96FX8 193 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 STRA6Q9BX79 667 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 A0A0A0MQY5 61 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 A0A1W2PRG0 241 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 C17orf102A2RUQ5 167 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 MYO1GB0I1T2 1018 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 VILLO15195 856 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 WNT1P04628 370 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 PCNAP12004 261 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 TM4SF1P30408 202 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 PSMB10P40306 273 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 DPP6P42658 865 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 GNAQP50148 359 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 ZXDAP98168 799 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 MC1RQ01726 317 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 CHAF1BQ13112 559 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 MED22Q15528 200 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 SYTL3Q4VX76 610 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 NCAPH2Q6IBW4 605 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM154Q6P9G4 183 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 TUBB6Q9BUF5 446 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 SMYD2Q9NRG4 433 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 RNF146Q9NTX7 359 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 HAO1Q9UJM8 370 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 A0A096LPK6 155 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 LRRC3CA6NJW4 275 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 B4DLN1 442 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 USP17L23D6RBM5 183 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 CYR61O00622 381 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 UGDHO60701 494 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 PAGE4O60829 102 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 PRKCGP05129 697 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 HOXB5P09067 269 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 GPR12P47775 334 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 PTH2RP49190 550 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 RPS13P62277 151 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 GHRHRQ02643 423 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 PCSK4Q6UW60 755 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 DDIASQ8IXT1 998 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 OR8H2Q8N162 312 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 OR4N2Q8NGD1 307 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP8.09□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 SH2D4AQ9H788 454 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 KAT14Q9H8E8 782 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 UTS2RQ9UKP6 389 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM5Q9Y2B1 443 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 CBY3A6NI87 242 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 EBAG9O00559 213 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 AHCYL1O43865 530 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 TUBB4AP04350 444 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 PORP16435 677 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 BMP5P22003 454 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 CERS1P27544 350 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 TTKP33981 857 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 PBX3P40426 434 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 CENPAP49450 140 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 CFHR1Q03591 330 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 FOXF2Q12947 444 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 PPP2R5BQ15173 497 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 DUSP28Q4G0W2 176 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 TTI2Q6NXR4 508 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 GALNT16Q8N428 558 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 SLC25A41Q8N5S1 370 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 GTF3C6Q969F1 213 aa8.08□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20 ms