RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489343.5

NPHP3-AS1-201, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,957 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 VEGFBP49765 207 aa15.74■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF460Q14592 562 aa15.74■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CFAP157Q5JU67 520 aa15.74■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PIK3R6Q5UE93 754 aa15.74■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PM20D1Q6GTS8 502 aa15.74■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RAPH1Q70E73 1250 aa15.74■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RNF135Q8IUD6 432 aa15.74■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF333Q96JL9 665 aa15.74■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FERMT1Q9BQL6 677 aa15.74■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SNX15Q9NRS6 342 aa15.74■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa15.74■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OPHN1O60890 802 aa15.73■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GLRA3O75311 464 aa15.73■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PROCP04070 461 aa15.73■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RALBP11234 206 aa15.73■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CD1EP15812 388 aa15.73■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C6orf163Q5TEZ5 329 aa15.73■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RAP1GAP2Q684P5 730 aa15.73■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KBTBD2Q8IY47 623 aa15.73■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCDC106Q9BWC9 280 aa15.73■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa15.73■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MYO9BQ13459 2157 aa15.73■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 J3KR12 359 aa15.73■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ENPP3O14638 875 aa15.73■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DCXO43602 365 aa15.73■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PRKCGP05129 697 aa15.73■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GLUD2P49448 558 aa15.73■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCNG1P51959 295 aa15.73■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NIPAL4Q0D2K0 466 aa15.73■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TAF10Q12962 218 aa15.73■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MAVSQ7Z434 540 aa15.73■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AUTS2Q8WXX7 1259 aa15.73■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CYP11A1P05108 521 aa15.72■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP15.72■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SEPT6Q14141 434 aa15.72■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SPDYAQ5MJ70 313 aa15.72■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C10orf120Q5SQS8 335 aa15.72■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF280DQ6N043 979 aa15.72■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ISLR2Q6UXK2 745 aa15.72■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP15.72■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 URGCPQ8TCY9 931 aa15.72■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP15.72■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ATXN10Q9UBB4 475 aa15.72■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC39A10Q9ULF5 831 aa15.72■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MAP3K7O43318 606 aa15.72■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HSPA4LO95757 839 aa15.72■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CPA3P15088 417 aa15.72■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KCNQ1P51787 676 aa15.72■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DSC1Q08554 894 aa15.72■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IL31Q6EBC2 164 aa15.72■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP15.72■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa15.72■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PHTF2Q8N3S3 785 aa15.72■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ATPAF2Q8N5M1 289 aa15.72■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC26A7Q8TE54 656 aa15.72■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FTHL17Q9BXU8 183 aa15.72■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LRFN2Q9ULH4 789 aa15.72■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PPM1HQ9ULR3 514 aa15.72■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NEU3Q9UQ49 428 aa15.72■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa15.72■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CDY1Q9Y6F8 540 aa15.72■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DNAH14Q0VDD8 3507 aa15.72■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SIN3BO75182 1162 aa15.72■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SERPINA6P08185 405 aa15.72■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PIRTP0C851 137 aa15.72■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CST5P28325 142 aaPredicted RBP15.72■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FSTL4Q6MZW2 842 aa15.72■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF781Q8N8C0 355 aa15.72■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FBXO32Q969P5 355 aa15.72■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NTAN1Q96AB6 310 aa15.72■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM136AQ96C01 138 aa15.72■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FICDQ9BVA6 458 aa15.72■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 COPG2Q9UBF2 871 aa15.72■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ADAM28Q9UKQ2 775 aa15.72■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP15.72■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 A0A0U1RQS6 177 aa15.71■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 E9PAM4 449 aa15.71■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HLA-DQB2P05538 268 aa15.71■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GSTA2P09210 222 aa15.71■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DNAJB2P25686 324 aa15.71■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCR1P32246 355 aa15.71■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP15.71■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CTBP1Q13363 440 aa15.71■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C4orf22Q6V702 233 aa15.71■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NAPRTQ6XQN6 538 aa15.71■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP15.71■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IGSF8Q969P0 613 aa15.71■□□□□ 0.11
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SMIM14Q96QK8 99 aa15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59 ms