RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486016.1

GCFC2-209, Transcript of GC-rich sequence DNA-binding factor 2, human

TSL 3

Gene GCFC2, Length 595 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GCFC2-209	ENST00000486016	SORCS1	Q8WY21	1168 aa		4.1	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	BICD1	Q96G01	975 aa		4.1	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	SCMH1	Q96GD3	660 aa		4.1	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	TNIP3	Q96KP6	325 aa		4.1	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	THAP1	Q9NVV9	213 aa		4.1	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	NLK	Q9UBE8	527 aa		4.1	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	KCND3	Q9UK17	655 aa		4.1	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	BAG5	Q9UL15	447 aa		4.1	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	KDM4E	B2RXH2	506 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	FAM157A	C9JC47	383 aa		4.09	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016		J3KR12	359 aa		4.09	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	TIMM23	O14925	209 aa		4.09	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	SYN3	O14994	580 aa		4.09	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	CAND2	O75155	1236 aa		4.09	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	AFP	P02771	609 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	FAM27E3	Q08E93	113 aa		4.09	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	RPE65	Q16518	533 aa		4.09	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	KRT71	Q3SY84	523 aa		4.09	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	HIST2H2BC	Q6DN03	193 aa		4.09	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	GGT6	Q6P531	493 aa		4.09	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	RHBDF2	Q6PJF5	856 aa		4.09	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	RINL	Q6ZS11	566 aa		4.09	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	POC1A	Q8NBT0	407 aa		4.09	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		4.09	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	CXorf56	Q9H5V9	222 aa		4.09	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	TMLHE	Q9NVH6	421 aa		4.09	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	LRFN1	Q9P244	771 aa		4.09	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		4.09	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	FBXO40	Q9UH90	709 aa		4.09	□□□□□ -1.75
GCFC2-209	ENST00000486016	CHL1	O00533	1208 aa		4.08	□□□□□ -1.76
GCFC2-209	ENST00000486016	CCNT1	O60563	726 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
GCFC2-209	ENST00000486016	PAK4	O96013	591 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
GCFC2-209	ENST00000486016	YWHAQ	P27348	245 aa		4.08	□□□□□ -1.76
GCFC2-209	ENST00000486016	FMO4	P31512	558 aa		4.08	□□□□□ -1.76
GCFC2-209	ENST00000486016	GJC1	P36383	396 aa		4.08	□□□□□ -1.76
GCFC2-209	ENST00000486016	CYP4A11	Q02928	519 aa		4.08	□□□□□ -1.76
GCFC2-209	ENST00000486016	ST3GAL1	Q11201	340 aa		4.08	□□□□□ -1.76
GCFC2-209	ENST00000486016	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
GCFC2-209	ENST00000486016	RPS6KA2	Q15349	733 aa		4.08	□□□□□ -1.76
GCFC2-209	ENST00000486016	XKR9	Q5GH70	373 aa		4.08	□□□□□ -1.76
GCFC2-209	ENST00000486016	C9orf139	Q6ZV77	190 aa		4.08	□□□□□ -1.76
GCFC2-209	ENST00000486016	RFWD2	Q8NHY2	731 aa		4.08	□□□□□ -1.76
GCFC2-209	ENST00000486016	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
GCFC2-209	ENST00000486016	C3orf49	Q96BT1	292 aa		4.08	□□□□□ -1.76
GCFC2-209	ENST00000486016	PGLYRP2	Q96PD5	576 aa		4.08	□□□□□ -1.76
GCFC2-209	ENST00000486016	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
GCFC2-209	ENST00000486016	WDR6	Q9NNW5	1121 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
GCFC2-209	ENST00000486016	ARFGAP3	Q9NP61	516 aa		4.08	□□□□□ -1.76
GCFC2-209	ENST00000486016	NLRC4	Q9NPP4	1024 aa		4.08	□□□□□ -1.76
GCFC2-209	ENST00000486016	CLDN16	Q9Y5I7	305 aa		4.08	□□□□□ -1.76
GCFC2-209	ENST00000486016	SAA2-SAA4	A0A096LPE2	208 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GCFC2-209	ENST00000486016		A0A096LPK6	155 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GCFC2-209	ENST00000486016	KIF1C	O43896	1103 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
GCFC2-209	ENST00000486016	TFRC	P02786	760 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
GCFC2-209	ENST00000486016	SKIV2L2	P42285	1042 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
GCFC2-209	ENST00000486016	GPR12	P47775	334 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GCFC2-209	ENST00000486016	BRWD1-AS2	P59051	145 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GCFC2-209	ENST00000486016	DHX34	Q14147	1143 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
GCFC2-209	ENST00000486016	LPIN1	Q14693	890 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GCFC2-209	ENST00000486016	TANGO2	Q6ICL3	276 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GCFC2-209	ENST00000486016	TYW3	Q6IPR3	259 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
GCFC2-209	ENST00000486016	DCUN1D3	Q8IWE4	304 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GCFC2-209	ENST00000486016	AADAT	Q8N5Z0	425 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GCFC2-209	ENST00000486016	SETD9	Q8NE22	299 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GCFC2-209	ENST00000486016	ATOH1	Q92858	354 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
GCFC2-209	ENST00000486016	PLEKHA2	Q9HB19	425 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GCFC2-209	ENST00000486016	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GCFC2-209	ENST00000486016	TMEM51	Q9NW97	253 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GCFC2-209	ENST00000486016	NFS1	Q9Y697	457 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GCFC2-209	ENST00000486016	CPED1	A4D0V7	1026 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GCFC2-209	ENST00000486016	OR6C68	A6NDL8	312 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GCFC2-209	ENST00000486016	ACKR2	O00590	384 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GCFC2-209	ENST00000486016	SKAP2	O75563	359 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
GCFC2-209	ENST00000486016	VNN2	O95498	520 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GCFC2-209	ENST00000486016	METTL18	O95568	372 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GCFC2-209	ENST00000486016	CH25H	O95992	272 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GCFC2-209	ENST00000486016	CSF1	P09603	554 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GCFC2-209	ENST00000486016	IGHV4-30-4	P0DP06	118 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GCFC2-209	ENST00000486016	PNPLA4	P41247	253 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GCFC2-209	ENST00000486016	SLC18A2	Q05940	514 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GCFC2-209	ENST00000486016	ACSM2A	Q08AH3	577 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GCFC2-209	ENST00000486016	PDCL	Q13371	301 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GCFC2-209	ENST00000486016	THOC5	Q13769	683 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
GCFC2-209	ENST00000486016	SMAD1	Q15797	465 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
GCFC2-209	ENST00000486016	PGBD2	Q6P3X8	592 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GCFC2-209	ENST00000486016	KLHL17	Q6TDP4	642 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GCFC2-209	ENST00000486016	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GCFC2-209	ENST00000486016	RRAGA	Q7L523	313 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GCFC2-209	ENST00000486016	EXOC3L1	Q86VI1	746 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GCFC2-209	ENST00000486016	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GCFC2-209	ENST00000486016	ELAC2	Q9BQ52	826 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
GCFC2-209	ENST00000486016	UBTD1	Q9HAC8	227 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GCFC2-209	ENST00000486016	MALT1	Q9UDY8	824 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GCFC2-209	ENST00000486016		H0Y3Z8	333 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GCFC2-209	ENST00000486016	LMX1B	O60663	402 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GCFC2-209	ENST00000486016	KRT18	P05783	430 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
GCFC2-209	ENST00000486016	MYL1	P05976	194 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GCFC2-209	ENST00000486016	SERPINB3	P29508	390 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GCFC2-209	ENST00000486016	SSTR2	P30874	369 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GCFC2-209	ENST00000486016	PTPN9	P43378	593 aa		4.05	□□□□□ -1.76

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms