RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483164.5

GIGYF2-238, Transcript of GRB10 interacting GYF protein 2, human

TSL 5

Gene GIGYF2, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GIGYF2-238	ENST00000483164	PBX3	P40426	434 aa		5.78	□□□□□ -1.48
GIGYF2-238	ENST00000483164	STAT2	P52630	851 aa		5.78	□□□□□ -1.48
GIGYF2-238	ENST00000483164	SLC12A3	P55017	1021 aa		5.78	□□□□□ -1.48
GIGYF2-238	ENST00000483164	LOXL3	P58215	753 aa		5.78	□□□□□ -1.48
GIGYF2-238	ENST00000483164	C21orf58	P58505	322 aa		5.78	□□□□□ -1.48
GIGYF2-238	ENST00000483164	POLR2F	P61218	127 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
GIGYF2-238	ENST00000483164	NIPAL4	Q0D2K0	466 aa		5.78	□□□□□ -1.48
GIGYF2-238	ENST00000483164	C17orf67	Q0P5P2	114 aa		5.78	□□□□□ -1.48
GIGYF2-238	ENST00000483164	CBX3	Q13185	183 aa		5.78	□□□□□ -1.48
GIGYF2-238	ENST00000483164	CAMK2D	Q13557	499 aa		5.78	□□□□□ -1.48
GIGYF2-238	ENST00000483164	ALCAM	Q13740	583 aa		5.78	□□□□□ -1.48
GIGYF2-238	ENST00000483164	NAA25	Q14CX7	972 aa		5.78	□□□□□ -1.48
GIGYF2-238	ENST00000483164	PPP2R5B	Q15173	497 aa		5.78	□□□□□ -1.48
GIGYF2-238	ENST00000483164	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
GIGYF2-238	ENST00000483164	MEP1B	Q16820	701 aa		5.78	□□□□□ -1.48
GIGYF2-238	ENST00000483164	GEN1	Q17RS7	908 aa		5.78	□□□□□ -1.48
GIGYF2-238	ENST00000483164	WSCD2	Q2TBF2	565 aa		5.78	□□□□□ -1.48
GIGYF2-238	ENST00000483164	SLC9B1	Q4ZJI4	515 aa		5.78	□□□□□ -1.48
GIGYF2-238	ENST00000483164	MPP7	Q5T2T1	576 aa		5.78	□□□□□ -1.48
GIGYF2-238	ENST00000483164	ERN2	Q76MJ5	926 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
GIGYF2-238	ENST00000483164	RD3	Q7Z3Z2	195 aa		5.78	□□□□□ -1.48
GIGYF2-238	ENST00000483164	TUSC5	Q8IXB3	177 aa		5.78	□□□□□ -1.48
GIGYF2-238	ENST00000483164	TBC1D21	Q8IYX1	336 aa		5.78	□□□□□ -1.48
GIGYF2-238	ENST00000483164	TMIE	Q8NEW7	156 aa		5.78	□□□□□ -1.48
GIGYF2-238	ENST00000483164	OVCA2	Q8WZ82	227 aa		5.78	□□□□□ -1.48
GIGYF2-238	ENST00000483164	TRIM44	Q96DX7	344 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
GIGYF2-238	ENST00000483164	SAT2	Q96F10	170 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
GIGYF2-238	ENST00000483164	PDLIM5	Q96HC4	596 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
GIGYF2-238	ENST00000483164	SLC46A1	Q96NT5	459 aa		5.78	□□□□□ -1.48
GIGYF2-238	ENST00000483164	NAA11	Q9BSU3	229 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
GIGYF2-238	ENST00000483164	MLPH	Q9BV36	600 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
GIGYF2-238	ENST00000483164	TES	Q9UGI8	421 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
GIGYF2-238	ENST00000483164	LEF1	Q9UJU2	399 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
GIGYF2-238	ENST00000483164	UBE2J1	Q9Y385	318 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
GIGYF2-238	ENST00000483164	ADAM18	Q9Y3Q7	739 aa		5.78	□□□□□ -1.48
GIGYF2-238	ENST00000483164	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		5.78	□□□□□ -1.48
GIGYF2-238	ENST00000483164	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
GIGYF2-238	ENST00000483164	CCDC187	A0A096LP49	1063 aa		5.77	□□□□□ -1.49
GIGYF2-238	ENST00000483164	URAD	A6NGE7	173 aa		5.77	□□□□□ -1.49
GIGYF2-238	ENST00000483164		E9PLN8	166 aa		5.77	□□□□□ -1.49
GIGYF2-238	ENST00000483164	DNM1L	O00429	736 aa		5.77	□□□□□ -1.49
GIGYF2-238	ENST00000483164	ZNF263	O14978	683 aa		5.77	□□□□□ -1.49
GIGYF2-238	ENST00000483164	DCLK1	O15075	740 aa		5.77	□□□□□ -1.49
GIGYF2-238	ENST00000483164	CTIF	O43310	598 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
GIGYF2-238	ENST00000483164	C1QL1	O75973	258 aa		5.77	□□□□□ -1.49
GIGYF2-238	ENST00000483164	SIX3	O95343	332 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
GIGYF2-238	ENST00000483164	FTCD	O95954	541 aa		5.77	□□□□□ -1.49
GIGYF2-238	ENST00000483164	PRR35	P0CG20	571 aa		5.77	□□□□□ -1.49
GIGYF2-238	ENST00000483164	TFEB	P19484	476 aa		5.77	□□□□□ -1.49
GIGYF2-238	ENST00000483164	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
GIGYF2-238	ENST00000483164	KCNA3	P22001	575 aa		5.77	□□□□□ -1.49
GIGYF2-238	ENST00000483164	KCNA5	P22460	613 aa		5.77	□□□□□ -1.49
GIGYF2-238	ENST00000483164	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
GIGYF2-238	ENST00000483164	TTK	P33981	857 aa		5.77	□□□□□ -1.49
GIGYF2-238	ENST00000483164	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
GIGYF2-238	ENST00000483164	RARRES1	P49788	294 aa		5.77	□□□□□ -1.49
GIGYF2-238	ENST00000483164	TKTL1	P51854	596 aa		5.77	□□□□□ -1.49
GIGYF2-238	ENST00000483164	HMGN5	P82970	282 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
GIGYF2-238	ENST00000483164	RPA4	Q13156	261 aa		5.77	□□□□□ -1.49
GIGYF2-238	ENST00000483164	FHL3	Q13643	280 aa		5.77	□□□□□ -1.49
GIGYF2-238	ENST00000483164	DPCR1	Q3MIW9	517 aa		5.77	□□□□□ -1.49
GIGYF2-238	ENST00000483164	KIAA0895L	Q68EN5	471 aa		5.77	□□□□□ -1.49
GIGYF2-238	ENST00000483164	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
GIGYF2-238	ENST00000483164	SYCE2	Q6PIF2	218 aa		5.77	□□□□□ -1.49
GIGYF2-238	ENST00000483164	FOXR2	Q6PJQ5	311 aa		5.77	□□□□□ -1.49
GIGYF2-238	ENST00000483164	KDELC1	Q6UW63	502 aa		5.77	□□□□□ -1.49
GIGYF2-238	ENST00000483164	PIK3AP1	Q6ZUJ8	805 aa		5.77	□□□□□ -1.49
GIGYF2-238	ENST00000483164	RHPN2	Q8IUC4	686 aa		5.77	□□□□□ -1.49
GIGYF2-238	ENST00000483164	FAM217A	Q8IXS0	508 aa		5.77	□□□□□ -1.49
GIGYF2-238	ENST00000483164	HDDC3	Q8N4P3	179 aa		5.77	□□□□□ -1.49
GIGYF2-238	ENST00000483164	IL17RC	Q8NAC3	791 aa		5.77	□□□□□ -1.49
GIGYF2-238	ENST00000483164	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		5.77	□□□□□ -1.49
GIGYF2-238	ENST00000483164	TBC1D15	Q8TC07	691 aa		5.77	□□□□□ -1.49
GIGYF2-238	ENST00000483164	MR1	Q95460	341 aa		5.77	□□□□□ -1.49
GIGYF2-238	ENST00000483164	PPP2R3C	Q969Q6	453 aa		5.77	□□□□□ -1.49
GIGYF2-238	ENST00000483164	ERO1A	Q96HE7	468 aa		5.77	□□□□□ -1.49
GIGYF2-238	ENST00000483164	VKORC1	Q9BQB6	163 aa		5.77	□□□□□ -1.49
GIGYF2-238	ENST00000483164	SYT17	Q9BSW7	474 aa		5.77	□□□□□ -1.49
GIGYF2-238	ENST00000483164	SLC25A23	Q9BV35	468 aa		5.77	□□□□□ -1.49
GIGYF2-238	ENST00000483164	TLR10	Q9BXR5	811 aa		5.77	□□□□□ -1.49
GIGYF2-238	ENST00000483164	VPS33B	Q9H267	617 aa		5.77	□□□□□ -1.49
GIGYF2-238	ENST00000483164	TTYH1	Q9H313	450 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
GIGYF2-238	ENST00000483164	SLC32A1	Q9H598	525 aa		5.77	□□□□□ -1.49
GIGYF2-238	ENST00000483164	NRIP3	Q9NQ35	241 aa		5.77	□□□□□ -1.49
GIGYF2-238	ENST00000483164	KCTD5	Q9NXV2	234 aa		5.77	□□□□□ -1.49
GIGYF2-238	ENST00000483164	CWC15	Q9P013	229 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
GIGYF2-238	ENST00000483164	RCE1	Q9Y256	329 aa		5.77	□□□□□ -1.49
GIGYF2-238	ENST00000483164	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		5.76	□□□□□ -1.49
GIGYF2-238	ENST00000483164	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		5.76	□□□□□ -1.49
GIGYF2-238	ENST00000483164	ARHGEF17	Q96PE2	2063 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
GIGYF2-238	ENST00000483164		A0A1W2PS29	197 aa		5.76	□□□□□ -1.49
GIGYF2-238	ENST00000483164	OR2A25	A4D2G3	310 aa		5.76	□□□□□ -1.49
GIGYF2-238	ENST00000483164	SYN3	O14994	580 aa		5.76	□□□□□ -1.49
GIGYF2-238	ENST00000483164	NOL3	O60936	208 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
GIGYF2-238	ENST00000483164	RTN2	O75298	545 aa		5.76	□□□□□ -1.49
GIGYF2-238	ENST00000483164	PSMD10	O75832	226 aa		5.76	□□□□□ -1.49
GIGYF2-238	ENST00000483164	AGFG2	O95081	481 aa		5.76	□□□□□ -1.49
GIGYF2-238	ENST00000483164	TPO	P07202	933 aa		5.76	□□□□□ -1.49
GIGYF2-238	ENST00000483164	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
GIGYF2-238	ENST00000483164	CASP3	P42574	277 aa		5.76	□□□□□ -1.49

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