RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP21.28■■□□□ 16e-11■■■■□ 19.6
ACTB-211ENST00000480301 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa21.28■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa21.28■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 KCTD6Q8NC69 237 aa21.28■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 LRIG1Q96JA1 1093 aa21.28■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa21.28■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 RTKNQ9BST9 563 aa21.28■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 DYRK4Q9NR20 520 aa21.28■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 KLHL11Q9NVR0 708 aa21.28■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 TFR2Q9UP52 801 aa21.28■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 A0A1W2PPC4 97 aa21.27■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 C4orf47A7E2U8 309 aa21.27■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 KRIT1O00522 736 aa21.27■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 ARHGAP33O14559 1287 aa21.27■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 NDUFA10O95299 355 aa21.27■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 ITGB7P26010 798 aa21.27■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 IL10RBQ08334 325 aa21.27■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 PDK2Q15119 407 aa21.27■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 SPA17Q15506 151 aa21.27■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 RAD9BQ6WBX8 426 aa21.27■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 PPP1R16AQ96I34 528 aa21.27■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 TM9SF3Q9HD45 589 aa21.27■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 TMEM9BQ9NQ34 198 aa21.27■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 IMPACTQ9P2X3 320 aa21.27■■□□□ 1
ACTB-211ENST00000480301 CACNA1EQ15878 2313 aa21.26■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 TM4SF5O14894 197 aa21.26■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 INSIG1O15503 277 aa21.26■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 LATO43561 262 aa21.26■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 IGSF6O95976 241 aa21.26■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 KDELR1P24390 212 aa21.26■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 HADHBP55084 474 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 CCDC15Q0P6D6 951 aa21.26■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa21.26■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 TMEM139Q8IV31 216 aa21.26■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 SPC24Q8NBT2 197 aa21.26■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 PCDH19Q8TAB3 1148 aa21.26■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 RAPGEF5Q92565 580 aa21.26■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 FAF2Q96CS3 445 aa21.26■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 ZNF670Q9BS34 389 aa21.26■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 CALN1Q9BXU9 219 aa21.26■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 SP110Q9HB58 689 aa21.26■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 PCDH15Q96QU1 1955 aa21.25■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 C16orf96A6NNT2 1141 aa21.25■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 PALMO75781 387 aa21.25■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 SERPINB6P35237 376 aa21.25■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 SLC1A1P43005 524 aa21.25■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 NEK3P51956 506 aa21.25■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 BNC1Q01954 994 aa21.25■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 ZNF805Q5CZA5 627 aa21.25■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 TRIM69Q86WT6 500 aa21.25■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 MAP7D3Q8IWC1 876 aa21.25■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 EXOC2Q96KP1 924 aa21.25■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 PREBQ9HCU5 417 aa21.25■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 HYOU1Q9Y4L1 999 aa21.25■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP21.24■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 RCCD1A6NED2 376 aa21.24■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 MAFKO60675 156 aa21.24■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 PEX11BO96011 259 aa21.24■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 UGT2B4P06133 528 aa21.24■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 SYPP08247 313 aa21.24■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 ADRB3P13945 408 aa21.24■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 COMTP21964 271 aa21.24■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 MAPK8P45983 427 aa21.24■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 NOP2P46087 812 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 RGRP47804 291 aa21.24■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 RAD51Q06609 339 aa21.24■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 GRIK2Q13002 908 aa21.24■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP21.24■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 LRRC38Q5VT99 294 aa21.24■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa21.24■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 GDPD4Q6W3E5 623 aa21.24■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 PQLC3Q8N755 202 aa21.24■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 OR2I1PQ8NGU4 316 aa21.24■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 KLHL32Q96NJ5 620 aa21.24■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 ZNF599Q96NL3 588 aa21.24■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP21.24■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa21.24■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 DMXL1Q9Y485 3027 aa21.23■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 A0A1B0GVT2 93 aa21.23■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 DCDC2BA2VCK2 349 aa21.23■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP21.23■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 WNT9AO14904 365 aa21.23■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP21.23■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 GRIA4P48058 902 aa21.23■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 CSNK1DP48730 415 aa21.23■□□□□ 0.99
ACTB-211ENST00000480301 RACK1P63244 317 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
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